New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 1885208 = | 2 (0.010) | 157 (1.020) | 83/382 | NT | 98.7% | coding (307/1446 nt) | Y75_RS09485 | BCCT family transporter |
? | NC_007779 | 2411458 = | NA (NA) | intergenic (‑147/+15) | lrhA/Y75_RS12035 | transcriptional regulator LrhA/IS1‑like element IS1A family transposase |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
AAGCAGGATCACAAATGCCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1885441‑1885208 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC > NC_007779/2411458‑2411692 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ATCACAAATGCCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACT < 1:1856090/237‑1 ATCACAAATGCCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACT < 1:451733/237‑1 TCACAAATGCCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCC < 1:111836/238‑1 TCACAAATGCCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCC < 1:249065/238‑1 CCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:2109663/1‑239 CCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:573904/1‑239 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TGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:627118/239‑1 TGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:1269222/238‑1 TGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACT > 1:921270/1‑225 GCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCC > 1:36393/1‑226 GCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCC < 2:36393/226‑1 CACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:1991272/1‑239 ACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCCCCGACAGTGGCGATCAGGAACTTCAAATCGACAAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGTGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGTCCCCAACTTACTGATAGT < 2:545272/238‑1 ACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGGTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTAAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGATTTCCACATGGGCCTTGCGGGCGAAAGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:1381314/1‑239 TGAAGTTATCGGGTCAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGGTGCTGCGGTAACAACAAGGGAACTGGTCAGTGCGCCGACAGAGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGCGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTTAGACTTTTGTTTTTCCGCACTTCAAATTGGGGAAGGACTCCAACTTATCGGTAGGGTTTT > 2:1994492/1‑239 TGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:1740243/1‑239 TGAAGGTAGCGGGTAACCCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGCGTAAAGGCTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGACGATAGTGGCGATCAGGAACCTCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAAGAATGCCGGAAAGGCTCAGACCGTTGTTTTTCCTCACATGAAAGCGGGTAAT < 2:2089947/214‑1 TATCGTGTAAAACGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTATAGGTTGCTGCGATAACAACAAGTGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:2021710/238‑1 TATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:1274907/238‑1 TATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:1492805/238‑1 GGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACT > 1:2089947/1‑214 GTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 1:229554/1‑239 TAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGGCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 2:401723/238‑1 GGTCAGCGCGGAAAGCCGACGGGGAAAGGTTGCTGCGGGAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGGCAGTGGCGGTCAAGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAAGAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:1109840/239‑1 CGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAATAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACT > 2:391736/1‑193 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1:1676297/190‑1 GGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTCCTGC > 1:1427213/1‑238 CAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT < 1:786938/239‑1 ACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGG > 2:737047/1‑239 CCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 1:2065731/119‑1 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aagggCGGAAAGGGTCATACCTTTGTTTTTTCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCATCTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCACGC < 2:2045036/234‑1 aaaGCCGGAAAGGCTCAGCGCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCGTGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCATATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGGTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCATCTTTCCCTTCAGGC < 2:1353528/236‑1 AATGCCTGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACGTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCTACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 2:485274/239‑1 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AAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCAT > 1:1844867/1‑239 GCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC > 1:40728/1‑184 GCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC < 2:40728/184‑1 TTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTTCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCaaacc > 2:596999/1‑234 TTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT > 1:1771455/1‑151 TTGTTTTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGGGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT < 2:1771455/151‑1 TGTTTTTCCGCCCGTGAAAGTGGTTAATGACTCCAACTTATTGATAGTTTTTTATGTTCAGAAAATGCCCGATGTCTTTGTCATGCAGCTCCTCCGATTTTGAGAACGACAGCGTCTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATCTCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACA < 2:1551773/228‑1 TTTCCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCG < 1:1948185/239‑1 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CCGCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTC < 1:338411/238‑1 GCACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATC < 1:1266203/239‑1 CACATGAAAGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCC > 1:1551773/1‑228 atccGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATAGCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 1:1180257/235‑1 ccaGGGTAATGACTCCAACCTGTTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCTCGATGACTTTTTCATGCAGCTCCCCCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCAC < 2:144140/235‑1 AAGCAGGATCACAAATGCCTGCACGGTGAAGTTATCGGGTAAACCGGTCAGCGCGGAAAGCCCACGGGTAAAGGTTGCTGCGGTAACAACAAGGGAAATGGTCAGTGCGCCGACAGTGGCGATCAGGAACATCAAATCGACCAGTTTTCCCCATGGGCCTTGCGGGCGAACGCCGGTAATAGCAGCAATAATGCCGGAAAGGCTCAGACCTTTGTTTTTCCGCACATGAAAGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1885441‑1885208 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC > NC_007779/2411458‑2411692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |