New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 3748324 | 3 (0.020) | 118 (0.770) | 70/382 | NT | 97.5% | pseudogene (657/873 nt) | tnaB | low affinity tryptophan permease TnaB |
? | NC_007779 | 4056220 = | NA (NA) | intergenic (‑209/+15) | Y75_RS25055/Y75_RS20055 | hypothetical protein/IS1‑like element IS1A family transposase |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CGCACCTTCCTTAGAGAACACCAGCAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3748096‑3748324 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC > NC_007779/4056220‑4056454 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taagTTAGAGAACACCAGCAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAA < 1:1296206/233‑1 aagTTAGAGAACACCAGCAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTT < 2:557039/236‑1 agaTAGAGAACACCAGCAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTA > 1:303907/4‑239 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CAGCAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTATAGCTTTGTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCACTAGAGCCACAACAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACTCCGCTTTTGATTAACTTATCTTTTCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGGTTTTT > 2:674331/1‑239 CAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCTGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:429871/1‑228 CAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:429871/228‑1 AGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 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TGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA > 1:1296068/1‑238 TGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:1296068/238‑1 TGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTA < 2:1699669/187‑1 TGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTA > 1:1699669/1‑187 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AGGAACGATTTCACCAGCCAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC > 2:1755034/1‑238 cGAACGATTTAGCCAGCGCATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATGTTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTCATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 2:624734/237‑1 GGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 2:1100908/238‑1 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CCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 1:816077/210‑1 TAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:836293/239‑1 TAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:1229684/239‑1 TTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAAGTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGCCTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 2:1757523/239‑1 TCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA > 2:1506836/1‑161 TCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 1:1506836/161‑1 TCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCC < 1:1149238/120‑1 TATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCC > 1:1277206/1‑238 CCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCATCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:421765/1‑117 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CCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATAT > 1:972176/1‑236 CCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < 1:495763/214‑1 CCAGAAGAGATAAATCACCAGCACCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTCTCTTTGCGATTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCACGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTTTATC > 2:1313794/1‑237 CAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCT < 1:1052027/239‑1 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ACCATCACCAGCAGCGAACCAAATACCACGCGTTTGATTGATTTATCTTTGCGTTTTCCAAGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCGCCGCCGGTTTTGGAAACGACAACGAGTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGGTGCGTCGGATTCAGGTCATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTTCTGATTACGTGCA < 2:103082/239‑1 CCAGCGCAAGCAGCGAACCAAATACCACGCCTTTGTTTAACTTATCTTTGCGTTCTCAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATACTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCTCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCTGCTCACTTCGCTGCGTATATCGATTGCTGATTACGTGCA > 2:370551/1‑238 CGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTT > 1:1125388/1‑238 CGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACT > 2:957011/1‑65 CGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCCTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTT > 1:984533/1‑238 AGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTT < 1:144015/237‑1 gaacatAATCCCACAGTTTTGATTAACTGAGCTTTTCGTTGTCCAGGTAATGACTCCAACTTAGTGATAGTGTATTATGTTCAGGTACTGCCCGATGACTTTGGCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCGTCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCTCTTGCTGATTGCGTGGAGCTTTCCCTTCAGGC < 2:1084187/233‑1 GAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 1:1324007/239‑1 GAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 1:1921448/239‑1 CACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCTAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG > 1:129584/1‑108 CACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCTAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG < 2:129584/108‑1 CGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG > 2:779089/1‑118 CGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG < 1:779089/118‑1 GCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGC > 2:702309/1‑239 TTTGATTACCTTATCTTTGCGTTTCCCACGTAATGACTCCAACTTATGAATAGTGTTTTATGTTCGGATAATGCCCGAGGACTTTGGCATGCAGCTCCACCGATTTTGGGAACGACAGCGAATTCCGTCCAAGCCGTGCCAGGTCCCGCATCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGATGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCCGC < 2:2051624/239‑1 TTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGGCTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGC < 1:961986/239‑1 TTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATTTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGG < 2:1696985/237‑1 TTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGG > 1:1696985/1‑237 TTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCG < 2:1640680/177‑1 TTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCG > 1:1640680/1‑177 TTAACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGC < 1:1084100/238‑1 ACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCAT > 2:612054/1‑238 ACTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT > 2:1243103/1‑143 CTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCC > 1:1568804/1‑239 CTTATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCC > 1:2051624/1‑239 TATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACG > 2:69932/1‑192 TATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACG < 1:69932/192‑1 ATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTC < 1:702309/239‑1 ATCTTTGCGTTTTCCAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGGCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTC < 1:624573/239‑1 CGCACCTTCCTTAGAGAACACCAGCAGGCAAAACTCGATAATGCCGTGCTGTTTGGTGCCGAGGAACGATTTCACCAGCGAATCAACGTTGCCGCCTGAGGAGATAATCGCCTTAAAGCTTTCTCGCGGAATATTCCCCATGGTGCAATAGAGCCAGAAGAGATAAATCACCAGCGCCAGCAGCGAACCAAATACCACGCTTTTGATTAACTTATCTTTGCGTTTTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3748096‑3748324 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCCATATCACC > NC_007779/4056220‑4056454 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |