| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_007779 | 573814 = | NA (NA) | intergenic (+252/+146) | quuD/Y75_RS02845 | antitermination protein QuuD/IS5‑like element IS5 family transposase | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TGCATGGCCCGTCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAGGGAGCCACTTATATGTTGGGGAGGCAACGCCTCCCGCAACATATCTTTTTCGTAATCAGATTAGAACTGGTAAACCAGACCTACAGCAACGATGTCATCAGTGCTTACACCGA > NC_007779/573344‑573804 | tGCCTGGCCCGTCTGAAAAAGAACAACAGCGATTTGCCCGACTTATTAGCAGATTATTATGTCGTCGGTACGGCCTTCATGTCACTGGCAGGTAACCATCTCTGGCGTCATGGTTCTATCGTGAAACAGCTATAAGAGGCTGAGGGCACTATTGAAGGGAGTTTATTGGCCTTAGATATACGGTTCGAACTGGGTTTAGTTGTTTATAACTCCATCTAATATTGCAATTGGTTACTaaa > 2:2037530/1‑239 (MQ=255) tCTGAAAAAGGACAACAGCGATTTGCACGATTTATTAGTAGATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGTGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAattatt < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |