New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 3506129 = | 80 (0.520) | 4 (0.030) | 4/364 | NT | 3.6% | coding (718/2433 nt) | Y75_RS17400 | bifunctional aspartate kinase/homoserine dehydrogenase II |
? | NC_007779 | 3506453 = | 140 (0.950) | coding (394/2433 nt) | Y75_RS17400 | bifunctional aspartate kinase/homoserine dehydrogenase II | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
ACCGTTACGCCCCAGCAGCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGAGCAGCGCCGCCAGGCGCTCAAGGTCGCTGACAAAAGCGCTAATGAGGCTATCG‑GCTTCTTCAGCGGGTAGCAGACCGCTAATCAGATCGCACTGATAGCGACGCAGCGTTTGTTGAACCTGATGCGCAGAGAGACGATCGGTCTGGCTTAGTTTCAACCAGTTAATCAACTGGTTAG > NC_007779/3506220‑3506686 | aCCGTTACGCCCCAGCAGCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACt > 1:608867/1‑238 (MQ=255) aCCGTTACGCCCCAGCAGCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGACACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTTCACGGCGCGTTAAGCGCGTAAAAACTCGCGCGCAGCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGGAGCTATCAAACGCGCCGACGACACt > 2:1698577/1‑238 (MQ=255) tACGCCCCAGCAGCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCg > 1:293693/1‑239 (MQ=255) cccAGCAGCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGcc < 2:1273059/239‑1 (MQ=255) cagcagCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGccc > 1:1802666/1‑238 (MQ=255) gcagcaCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCccac > 1:227185/1‑238 (MQ=255) agcaCGGTTTCCCCGGAGGTGTGGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGGTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCACCCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCccacca < 2:1604951/238‑1 (MQ=255) agcaCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCccacca < 1:1260687/238‑1 (MQ=255) agcaCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCccac < 1:933422/236‑1 (MQ=255) caCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACt > 2:266943/1‑238 (MQ=255) aaCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGCTAAACCCGGTCACCGCCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCGCCAGCAGCCCTTGCAGCATGGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTTCGGTTGTGCGGCGTTCTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGTCATCACGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTTCCGCCGACATCAGACGTGCTGCACATACTTCCCCGTGGCCCTCCACt < 2:608867/237‑1 (MQ=255) aCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACt < 1:372813/237‑1 (MQ=255) aCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACt < 2:245919/237‑1 (MQ=255) aCCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACt < 1:1623099/237‑1 (MQ=255) ccGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACt < 1:517102/236‑1 (MQ=255) ccGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTcc > 1:168963/1‑239 (MQ=255) ccGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTc > 1:2079982/1‑238 (MQ=255) tttCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGGACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCa > 1:1517940/1‑239 (MQ=255) tttCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCCGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGGGCCGACCATACTTCCCCGAGGCCCACCACTTCCCCa > 2:255215/1‑239 (MQ=255) tttCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGCTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACCGGCCGACCATACTTCCCCGGGGCCCACACCTCCCGCa > 2:1260687/1‑239 (MQ=255) aCCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATaca < 1:1117730/239‑1 (MQ=255) cGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGcg > 1:1003257/1‑239 (MQ=255) cGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGc < 1:743873/238‑1 (MQ=255) gttgttGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGcg < 1:879457/238‑1 (MQ=255) tgttgCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGcgtc < 1:1901114/238‑1 (MQ=255) 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tAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTg < 1:1835505/239‑1 (MQ=255) gTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGCCGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCCATTCCGCATACACTGCGTCGCTAATACCGCTGTCGagca > 2:1176915/1‑238 (MQ=255) tCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGagcagc > 1:457606/1‑239 (MQ=255) cGTTTGCCCGGATGTTGCCCCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCACCCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCTGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACCCTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGAGCAGCGCCGCCAGgc < 1:1334645/238‑1 (MQ=255) ttGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAACACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGAGCAGCGCCGCCAGGCGCTc > 2:319427/1‑239 (MQ=255) ttGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGAGCAGCGCCGCCAGgcgccc > 2:119678/1‑237 (MQ=255) 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cagcagCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGAGCAGCGCCGCCAGGCGCTCAAGGTCGCTGACAAAAg < 1:235278/239‑1 (MQ=255) agcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGcg > 2:606288/1‑183 (MQ=255) agcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGcg < 1:606288/183‑1 (MQ=255) gcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGc < 1:1448163/181‑1 (MQ=255) gcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGc > 2:1448163/1‑181 (MQ=255) gcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGc > 2:1642308/1‑181 (MQ=255) gcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGc < 1:1642308/181‑1 (MQ=255) gcagcTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCACGTGCAGCGCATAAAAACTCGCGGGCATCAAGACCGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTCATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCACACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGCCGTTCATACCGCAGTCGAGCAGCACCGCCAGGCGCTCAAGTCTGCTGACACAAgc > 2:1819154/1‑238 (MQ=255) 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ACCGTTACGCCCCAGCAGCACCGTTTCACCGGCGTTGTTGCGGCTGATAAATCCGGTCACCACCAGACGTTTGCCCGGATGTTGCACCAGCAGCTGTTGCAGCAACGGGTAAGAAAGCCCTTCATCAACCTGCGGTTGTGCGGCGCGTTCAGCGCGTAAAAACTCGCGGGCATCAAGCCAGGCCGCTGGCAGCCCTTGTTGATTAAGTACCGCAGACATCAGACGTGCCGACCATACTTCCCCGTGGCCCACCACTTCCGCATACACTGCGTCGTTAATACCGCTGTCGAGCAGCGCCGCCAGGCGCTCAAGGTCGCTGACAAAAGCGCTAATGAGGCTATCG‑GCTTCTTCAGCGGGTAGCAGACCGCTAATCAGATCGCACTGATAGCGACGCAGCGTTTGTTGAACCTGATGCGCAGAGAGACGATCGGTCTGGCTTAGTTTCAACCAGTTAATCAACTGGTTAG > NC_007779/3506220‑3506686 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |