| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 623,178 | G→T | 13.8% | Q186K (CAA→AAA) | fepB ← | Fe2+‑enterobactin ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 623,178 | 0 | G | T | 13.8% | 252.8 / 3.1 | 97 | Q186K (CAA→AAA) | fepB | Fe2+‑enterobactin ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/50); new base T (13/2); total (44/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.18e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AATAGTGACTCGCCATTTAACCCTGCAGCCAGATTTTCCCCACCAAGCTGAATGATGTCATGGCGTTTACCCTGACTTTGGCTGGCATTTAACCCTGCGGGTAACTTCGCCAGCGTAAAGCCGAGTTGTTCCAGCATCTGCCCTTGTGCTGATTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGC‑TGCGGC‑GGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTGCGCAAT‑CCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCA‑TGCCCGGTAATTTCGCCAA‑GTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTG‑ATGATTAATGTCG‑GGGCGATGGTGGAAAGCTG‑ATCATACA‑GTGCCAGCGCCG‑AATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGC > NC_007779/622946‑623414 | aaTAGTGACTCGCCATTTAACCCTGCAGCCAGATTTTCCCCACCAAGCTGAATGATGTCATGGCGTTTACCCTGACTTTGGCTGGCATTTAACCCTGCGGGTAACTTCGCCAGCGTAAAGCCGAGTTGTTCCAGCATCTGCCCTTGTGCTGATTCTGGCGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGC‑TGCGGC‑GGTAATTTGATTTGCTCtt < 1:826640/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |