| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 46,798 | A→G | 9.5% | D331G (GAT→GGT) | Y75_RS00235 → | MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 46,798 | 0 | A | G | 9.5% | 340.8 / 2.6 | 125 | D331G (GAT→GGT) | Y75_RS00235 | MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/84); new base G (11/3); total (33/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GGACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGGGTTGGCAAAAACGCGGCACTAGGGAATGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGC‑TGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTAATCCCGGATATGGGGATCTGGCTGGTAGTGATGG‑CCTTTGCGGT‑GTATGCCTTTTTCTCTGGCGGGCCGGGTAATTTGCAGTGGCTCTATCCTAATGAACTCTTCCCGACAGATATCCGCGCCTCTGCCGTGGGCGTGATTATGTCCTTAAGTCGTATTGGCACCATTGTTTCGACCTGGGCACTACCGATCTTTATCAATAATTACGGTATCAGTAACACGATGCTAATGGGGGCGGGTATCT > NC_007779/46561‑47034 | ggACCTGCCAGGTGATCCCAATGTTCGCCATTTACACCTTTGGCCCGCAAATCGTTGGTTTGTTGGGATTGGGGGTTGGCAAAAACGCGGCACTAGGGAATGTGGTGATTAGCCTGTTCTTTATGCTCGGCTGTATTCCGCCGATGCTGTGGTTAAACACTGCCGGACGGCGTCCATTGTTGATTGGCAGCTTTGCCATGATGACGC‑TGGCGCTGGCGGTTTTGGGGCTAATCCCGGat < 1:1379557/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |