| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,521,793 | C→G | 10.7% | intergenic (+15/‑183) | curA → / → Y75_RS07665 | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase/DNA‑binding transcriptional regulator McbR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,521,793 | 0 | C | G | 10.7% | 271.7 / 3.4 | 130 | intergenic (+15/‑183) | curA/Y75_RS07665 | NADPH‑dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase/DNA‑binding transcriptional regulator McbR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/66); new base G (11/3); total (55/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.05e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGTTGAGA > NC_007779/1521557‑1522027 | cTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGGGt > 1:1123640/1‑239 (MQ=255) ttGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCCCC‑ATaaaaaaa > 1:501425/1‑236 (MQ=255) ttttATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGGGATGGGGCAATGGGT‑GAAAAAGG‑ATAAAACCCACTCCCGCGAAGAAATTACTTACGGTTAAGAAAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGACCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCaaaa < 1:873121/239‑1 (MQ=255) ttattaTCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGGTGATTAAAGTTTCGACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATACAGGCaaaca > 1:803819/1‑236 (MQ=255) tattatCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGGGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGc < 1:1679354/239‑1 (MQ=255) tattacAGCTCAGGATTTTGGTCTCCGTATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGAAATGGGT‑AAAGGAGG‑AAAAAATCACCTACCGAGAAAAAATTACTGACGTTTTAGAGACTGCGCCACAGCGGTTTACCGGCCTGCTGAAGGGTAAAACTTTCGGCAATGTGGTGATCCGCGTGGGGGGGGATAATAAAATTTTCACCGGC‑GGCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGc < 2:2065745/239‑1 (MQ=255) cGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGTGGAAAGCGCC‑CTAAAAAAACAGGGAAAAAGCCTAttt > 2:171530/1‑239 (MQ=255) gCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAACTTAtttt > 1:44000/1‑239 (MQ=255) gCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTAAACGGC‑GGCGGGAGACGCC‑ATAAAAAAAAAGGTAAAAAAATTAtttg > 2:1330645/1‑238 (MQ=255) gCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGGCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAACTTAtttt > 1:1044569/1‑239 (MQ=255) ttATGGTCACAGCACCCTTGTGTTTC‑AGAGGGAGAGGGGGGAGTGGGG‑AAAAGAGG‑ATAAAGACCACTACCCAGAAGAAATTCCGAAGGGTTTAGAGAAGGCGCCCCAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAATTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGGGGGTGATGATAAAATTTTCATCGGC‑GGCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Ttta < 2:1438887/239‑1 (MQ=255) aTGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaat < 1:171530/239‑1 (MQ=255) aTGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGAAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaat < 1:1712373/239‑1 (MQ=255) tCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAATTCCACTCCCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAAGGCGCCACTGACGTTTATCGGCCTGCTGATGGGAAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGC‑GGCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaattaa < 1:1251210/238‑1 (MQ=255) tCACCGAATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaattaa < 1:2058429/238‑1 (MQ=255) gaaCCGCAGCCAT‑AGTATCTAGAGGAGGAGGGGGCAATGGTA‑GAAAGAGA‑AAAAAATCCACTACCGCGAAAAAAGTACGAGCGGTAGAGAGAATGCGCCACAGACGTTTAGCGGCCGGCTGAAGTTAAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGGAGGAGGTGATGATAAAATTTTCAACGTC‑GGTGTAAACCGCC‑ATAAAGATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑Tttaattaa < 2:375650/236‑1 (MQ=255) cACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaac < 1:432337/238‑1 (MQ=255) cACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTAAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTAAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGGGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaact < 1:1608902/239‑1 (MQ=255) aCCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAtt > 1:1074787/1‑221 (MQ=255) aCCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAACTTATTTTTAGC‑CTTAATtaaata > 1:142573/1‑239 (MQ=255) aCCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGATTTCACGGC‑GGGGGAAGCCCCC‑CAAAAAATCCCAGGAAAAAGGATTTTTTTACC‑TCTAaataaata > 2:261541/1‑239 (MQ=255) aCCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGAAGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGTGTTAACCGCC‑ATCAAAAAACAGGCGAAAAAATTAATTTTGTC‑TTTAATtaacta > 2:925571/1‑239 (MQ=255) ccGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCCAAAAACTTATTTTCAGC‑TTTTATtaactaa > 1:1812233/1‑239 (MQ=255) ccGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGGTTCAACGGC‑GGCGTAAACCGCC‑CTAAAAATCCAGGGAAAAAGCTTATTTTCAGG‑TTTAATtaactaa > 1:117208/1‑239 (MQ=255) cggaTCGATGAGTTTC‑AGAGGGAGAGGGGGCAAGGGGA‑GAAAGGGT‑AAAAAACCCCATACCGCAAAGAAATTACAGAGGGTTTAGAGAATGCCCCACAGGCGTTTAGCGGCGTGCTGAAGGATAAAAATTTCGGAAAAGTGGTGACCCGCGTGGAGGGTGATGATAAAAGTTTAAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaactaac < 2:1123640/236‑1 (MQ=255) cGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCCCTCCCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaactaac < 1:1418038/239‑1 (MQ=255) acccATGAGTTTC‑AGGGGGAGAGGGGGAAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTCCTGAGGGTTTAGAGAGTGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTAACCGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACca < 2:1293074/236‑1 (MQ=255) cATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGCGATCAGCGTGGCGGGTGATGGTTAAAAGTTTAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑CTACAGATTCAGGCAAAAAAACTATTTTCAGC‑GTAGATtaaccaacaccaa > 2:306122/1‑233 (MQ=255) ttggttttA‑AGGGGGAGATGGGCAAATGGG‑‑GAAAAAGGAAAAAAATCCACTACCGGGAAAAAATTTCTGAGGGTTTAGAGACTGCCCCACAGTCTTTTCTCGCCTTGATAAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTCACCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGC‑GCCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCAcatca < 2:1833794/234‑1 (MQ=255) tGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACCGC‑GGCGGAAGCCGCC‑CTAAAAATTCAGGCAAAAAACTTTTTTTAAGC‑TTTAATTAAATAACCAcattat > 1:195678/1‑239 (MQ=255) ttC‑AGAGGGAGAGGGGGAAATGGGT‑AAAAGAGG‑CTAAAACCCCCTACCGGGAGGAAATGATGGGCGTTTAAGAGAAGGCGCCCAAGACGTTGATCGGGCTGATGAAGGGTAAAAACTTCGGAAAAGTGTGGAGCCGCGTGGTGGGGGAGTTTTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAACCGCC‑ATAAAAATCCAGTCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑tt < 2:1123237/238‑1 (MQ=255) c‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTctg < 1:1579628/239‑1 (MQ=255) c‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGGGGATTAAAGTTTCAACGGCGGGGGTAAG‑CGCC‑CTAAAAAATCAAGCGAAAAACGTTTTTTTAGG‑TTTTATTAAACAACCCCAACACTG‑ttttt > 2:567541/1‑236 (MQ=255) c‑AGAGGGAGATGGGGAAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTAAGAGATTGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGATAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGGGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTctg < 1:1201896/239‑1 (MQ=255) gagaTGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCATTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAAGTTCAACGGC‑GGCGGAAGACGCC‑CTAAAAAACCAGGCCAAAAACTTATTTTTAGC‑TTTAATTAACTAAACACAACATTG‑TTATGCTGCta > 2:387392/1‑239 (MQ=255) agagGGGGCAAGGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTAAGAGAATGCGCCACAGACGTTTAGCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATtaactaac < 1:260414/217‑1 (MQ=255) agaTGGGGCAATGGGT‑GACAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGAAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGAAGGTGAAAGGTTCAAAGGC‑GGCGTGAGCAGAC‑ATAGAAATCACAGCAAAAAATCAATATTAAGC‑CTTAATTAACGAAAAACAACATAG‑TTcagcggtcat > 2:2040125/1‑233 (MQ=255) agaTGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGGAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAg > 1:192023/1‑191 (MQ=255) acagggCAAAGGGAGGAAAGACG‑ATAAATCCCATTCCCGAGAAAAAATTACTGAGTGTTTAAAGAATGCACCACACACGTTTACCGTCGTGATGAAGGAAAAACACTTCGGAAAGGTGGTGTCCCGCGTGGCGGGTGATATTTAAATTTTCAACGGC‑GGCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCtaat < 2:1710727/236‑1 (MQ=255) aTGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAAAAATTCCTGAAGGTTTAGAGAAGGCGCCACAGACTTTTATCGGCCTGATGAAGGTTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGTC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCtaat < 1:1309364/238‑1 (MQ=255) tGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCtaat < 1:185090/237‑1 (MQ=255) tGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAACCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTAGCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTGCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCtaat < 1:104369/237‑1 (MQ=255) aaggggT‑AAAAGAGA‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGTTTTAGAGAAAGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCGGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGACCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAacaaca < 1:1499772/235‑1 (MQ=255) aaTGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAACCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAacaaca < 1:972796/238‑1 (MQ=255) aTGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGGTTCAACGGC‑GGCGGAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCCAAAAAATTATTTTTCGG‑TTTAAATTACTAACCAAATCAATT‑CTCTGCTGCtaataaactgtct > 1:630369/1‑232 (MQ=255) aTGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAAACCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTTATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACaaaaaa > 1:109454/1‑239 (MQ=255) tGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCAGAAGGGTAAAAGCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAg < 1:1451512/239‑1 (MQ=255) gAAAGAGG‑ATAAAATCCCCTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAAAATGCGCCACAGACTTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAATTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 1:726265/239‑1 (MQ=255) gAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTTATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAAGTGAg > 1:1646938/1‑239 (MQ=255) gAAAGAGG‑AAAAAATCCCCTACCGCAAAAAAATTACTGAGGGTTTAGAGAATGGGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGGGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa < 1:261541/238‑1 (MQ=255) gAAAGAGA‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACTTTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGATAAAAACTTCGACAAAGTGGTGATCCCCGTGGCGGTTGATGATTAAATTTTCAACGGC‑GGCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 1:1428847/239‑1 (MQ=255) aaaaGAGG‑ATAAAATCCACTACCGGGAAGAAATTACGGAGTGTTTGGAGAGTGCACCACGGTCTTTGATCGGCTTGCTGAAGGGTAAAAACCTCGGAAAAGTGGTGATCCGGGTGGAGGATGATGATAAAAGTTTAAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa < 2:501425/237‑1 (MQ=255) aaaaGAGG‑ATAAAACCCACTACCGAGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAACCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 1:1047612/238‑1 (MQ=255) aaaaGAGA‑ATAAAACCCACCACCGAAAAGAATTTACTGACGTTTAGGGGAACGCGCCACAGTCTTTTATCGGCCTGCGGAGGGTAAAAAATTTCGGCAAAGTGGTGACCGGCGTGGGGGGTGATGAAAAAAGTTTAACCGGC‑GGCTTAAACCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 2:517315/238‑1 (MQ=255) aaaaggggtAAAACCCACTCCCGAGAAGAACTTAGTGGTGGTTAAGAAAAGGCGCCACTGTCGTTTATGGGCTTGCGGAAGGATAAAACCTTCGACAAGGGGGTGATCAGCGTGGCGGGTGATAAAAAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 2:142573/230‑1 (MQ=255) agG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACCGC‑GGGGGAAGCCGCCAATAAAAATCCATGAAAAAAACTATTTTTAACT‑TTTATTTAACAAACAACACCCTT‑‑TTATTCCTCCAAAAACAAAAAAGGTGAGAGGtt > 2:1805406/1‑239 (MQ=255) g‑ATAAAATCCACTCCCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa < 1:1350225/231‑1 (MQ=255) g‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTTAGC‑TTTAATTAACTAAACACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAAAAACAAAGGGGAGGGGgtt > 1:1984163/1‑238 (MQ=255) aaaaTCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGa < 1:1276368/239‑1 (MQ=255) ccACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGAAAGGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGattatt < 1:519495/239‑1 (MQ=255) aCTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGA‑GGGGCAAACCGCC‑CCAAAAATACAGGCAAAAAACTTATTTTCTGC‑ATTAATTAACAAACCACAACATTT‑TTCTTCCTCTAATAAAAACAAAAGAGAGGAGttttttcatttc > 2:1350225/1‑228 (MQ=255) gggaagaaATTCCTGACGGTTAAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAACCGTCGGCAAAGTGGTGATCCGGGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTaa < 1:1805406/237‑1 (MQ=255) ggagaaaaTTACTGCCGGTGTGGAGAATGGGCCTCATGCTTTTATCGGCTTGTGGAAGGTTAAAACCGTCGTCAGAGTGGTAGTCCGATTGGCGGGTAATTATAAAAGTTTCATGGGC‑GTCTTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTaa < 2:1952598/233‑1 (MQ=255) aattgttGACGATTAAGAGAATGCGCAACAGGCGTTTATGGGCATGCTGAAGGGTAAAATCTCCGGCAGTGTGTTGATCCGAGTGGCGAGTGATGATTAAAGTTTAATGGTC‑GTTGTAAACCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATaca‑c < 2:114183/231‑1 (MQ=255) gACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGGCGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGTGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAAt < 1:925571/239‑1 (MQ=255) cGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGGGGTTTATGATTATTCACTTTTATACA‑CCAGGTGAAtt > 1:279538/1‑238 (MQ=255) ggTTTAGAGAATGCGCCGCAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATAAAATTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTa < 1:2104439/221‑1 (MQ=255) tttAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTAATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCtaat < 1:1268055/182‑1 (MQ=255) aTGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGGGAGTGGTTTATGa > 1:293322/1‑199 (MQ=255) tGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑CTAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGGGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATa > 1:654001/1‑213 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGGGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTTAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCAATG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGGGGTTTATGAATATTCACTTTTAAATA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATgca > 1:264045/1‑239 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATgca > 1:1409766/1‑239 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAAAAAAGGGGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATgca > 1:16243/1‑239 (MQ=255) cgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTgctgct < 1:641890/168‑1 (MQ=255) gcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATgcagg < 1:1382600/239‑1 (MQ=255) accACAGGCTTTTATGGGCGTGCGGAAGGTAAAAAACTTCGGCAAGGTGGTGAGCCGCGTGGGGGGTTATTATAAAATTTACAGCGGG‑GGCGAAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATgcagg < 2:1812233/238‑1 (MQ=255) tttGTCGGCCGGGTGAAGGGTAAAAGGTACGGCAAGGTGGTCACCGGGGGGGCGGGTAATAATTAAAGTTTAACCGGC‑GGCGTTAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGa < 2:264045/239‑1 (MQ=255) tATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATGGTTTAAGGTTCAACGGC‑AGGGGTAGGCGCC‑CTAAAAATTCAGGCAAAAAGATTATTTTTTGC‑TTTTATTAAATAAACACATTCTTGTTTCTCCT‑CTAATAACAACAAAGAGAAATGGTATATTATTATTATCTTTTATATA‑CCACGAGGCTTACTTCTGCCCATCAAGCAGGGTTggtat > 2:1525837/1‑236 (MQ=255) gCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTTTGCTGCTAATAACAACAAAGGGGAGTGGGTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGGGAAATCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGGTGGGCAGaaaa > 1:489025/1‑239 (MQ=255) gCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGGGATTGTTAAAGGTTCAACGGG‑GGGGGAAGGCCCC‑CTAAAAAATCACGGAAAAAACCTATTTTCAGCTTTTAATAAACAAACC‑CAACATTT‑TTTTTCTGCTAATAACAACCAAAATGAGTGGTTTTTTATTTTTTCATTTTATACACCCTGGTAAATTAC‑TCTTGCATTCCGGCAGGGTTTGACaaaaaa > 2:1560423/1‑239 (MQ=255) ggctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGGGGTGATCCGCGGGGGGGGTTATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAGAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGa < 1:1560383/199‑1 (MQ=255) gctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAAC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTTACTTTAATACA‑CCAGGGGAATTTCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAaaac > 1:1755973/1‑238 (MQ=255) gAAGGTTAAAAACTGCGGCAAAGTGGTATTCCGCGTGTCGGTTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGa < 1:923762/239‑1 (MQ=255) gAAGGGTAAAACCTTCGGAAAAGTGGTGAGCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAGCGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGa < 1:563346/239‑1 (MQ=255) gTAAAACCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGTGGGGTAGTAATTAAAGTTTCAACGCC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTAGTCa < 1:741984/173‑1 (MQ=255) gTAAAACCTTCGGCAAAGTGGTGACCCGCGTGGGGGGTGATGATAAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCaaaa < 2:899130/90‑1 (MQ=255) cGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGGTGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACca > 1:729016/1‑110 (MQ=255) cGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGGTGATAAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACca < 2:729016/110‑1 (MQ=255) cGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑CTAAAAATCCAGGCAAAAAACTTAtttt > 1:899130/1‑90 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATAATTAAAGTTTCAACGGC‑GGGGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 1:1754501/143‑1 (MQ=255) tgttgATCTGCGTGGCGGTTGATGATTAAAGTTTCAACGGG‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATaca‑c < 1:1998603/163‑1 (MQ=255) tggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCa < 1:1749025/155‑1 (MQ=255) gtgtcccggggggCGGGTGATGATTAAATTTCCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACggg < 1:1222011/227‑1 (MQ=255) gtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg < 1:1734927/136‑1 (MQ=255) cgTGGCGGGGGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑CTAAAAATCCCGGCAAAAAGCTTATTTTTAGC‑TTTAATTAACTAACCAAATCATTG‑TTCTGCTGCCAATAACAAAAAAGGGGAGTGGTTTTTGATTATTTCCTTTTATACA‑CCACGTGAAATCCTTCTTCCCTGCAGGCAGGGTTTGTCAGAAAAAAACCGCAGTCAATAAAATGACTGGAACGGGAAAAAtaga > 2:233876/1‑236 (MQ=255) tGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGGGGAAGCCGCC‑CTAAAAATCCAGGGAAAAAACTTTTTTTTAGC‑TTTAATTTACTAACCACATCATTG‑TTTTGCTGCTAATAACAAAAAAGGTGGGGGGGTTTTGa > 2:1734927/1‑136 (MQ=255) cGGGTGATGATAAAAGTTTAAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACAt < 1:1525837/238‑1 (MQ=255) tgatTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGAAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGtt < 1:567541/238‑1 (MQ=255) cAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGt > 1:339110/1‑239 (MQ=255) c‑ggcgTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGTTgaga > 1:1675713/1‑238 (MQ=255) | CTGAAAAAACGTATTCGCTTGCAAGGTTTTATTATCGCTCAGGATTATGGTCACCGCATCCATGAGTTTC‑AGAGGGAGATGGGGCAATGGGT‑GAAAGAGG‑ATAAAATCCACTACCGCGAAGAAATTACTGACGGTTTAGAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGC‑GGCGTAAGCCGCC‑ATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGC‑TTTAATTAACTAACCACATCATTG‑TTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTTATGATTATTCACTTTAATACA‑CCAGGTGAATTCCTTCTGCCATGCAGGCAGGGTTGGACAGAAAACACGCGAAGGAATTAAAATGCCTGGAACGGGAAAAATGAAACATGTCAGTTTGACTCTGCAGGTTGAGA > NC_007779/1521557‑1522027 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |