Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 2,418,598 | 0 | T | C | 15.5% | 425.2 / 67.0 | 169 | intergenic (‑20/‑318) | Y75_RS12065/ackA | DUF412 domain‑containing protein/acetate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/81); new base C (13/13); total (74/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.23e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.04e-01 |
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
AGCTGACCGCCCAGGGCAATCTGCCAGCAGAGAGTAAATACGGCGATCGGCGGCATAAAACGGATCGCATAACGCGTCATCTTGATAACGCGATTTTCGACAAAGACCGGGGCAAGGCGTTTTTCCAGCGGCCACGTCTTTGAGTAATGCTGTCCCCGGCGAAACAAGCTAAAAAAATTAACAGAACGATTATCCGGCGTTGACATGCTTCACCTCAACTTCACATATAAAGATTCAAAAATTTGTGCAAATTCACAACTCAGCGGGACAACGTTCAAAACATTTTGTCTTCCATACCCACTATCAGGTATCCTTTAGCAGCCTGAAGGCCTAAGTAGTACATATTCATTGAGTCGTCAAATTCATATACATTATGCCATTGGCTGAAAATTACGCAAAATGGCATAGACTCAAGATATTTCTTCCATCATGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAA > NC_007779/2418373‑2418833 | ccGCCCAGGGCAATCTGCCAGCAGAGAGTAAATACGGCGATCGGCGGCATAAAACGGATCGCATAACGCGTCATCTTGATAACGCGATTTTCGACAAAGACCGGGGCAAGGCGTTTTTCCAGCGGCCACGTCTTTGAGTAATGCTGTCCCCGGCGAAACAAGCTAAAAAAATTAACAGAACGATTATCCGGCGTTGACATGCTTCACCTCAACTTCACATATAAAGATTCAAAAATTtg > 2:1953478/1‑239 (MQ=255) ccAGGGCAATCTGCCAGCAGAGAGTAAATACGGCGATCGGCGGCATAAAACGGATCGCATAACGCGTCATCTTGATAACGCGATTTTCGACAAAGACCGGGGCAAGGCGTTTTTCCAGCGGCCACGTCTTTGAGTAATGCTGTCCCCGGCGAAACAAGCTAAAAAAATTAACAGAACGATTATCCGGCGTTGACATGCTTCACCTCAACTTCACATATAAAGATTCAAAAATTTGTGc < 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AGCTGACCGCCCAGGGCAATCTGCCAGCAGAGAGTAAATACGGCGATCGGCGGCATAAAACGGATCGCATAACGCGTCATCTTGATAACGCGATTTTCGACAAAGACCGGGGCAAGGCGTTTTTCCAGCGGCCACGTCTTTGAGTAATGCTGTCCCCGGCGAAACAAGCTAAAAAAATTAACAGAACGATTATCCGGCGTTGACATGCTTCACCTCAACTTCACATATAAAGATTCAAAAATTTGTGCAAATTCACAACTCAGCGGGACAACGTTCAAAACATTTTGTCTTCCATACCCACTATCAGGTATCCTTTAGCAGCCTGAAGGCCTAAGTAGTACATATTCATTGAGTCGTCAAATTCATATACATTATGCCATTGGCTGAAAATTACGCAAAATGGCATAGACTCAAGATATTTCTTCCATCATGCAAAAAAAATTTGCAGTGCATGATGTTAA > NC_007779/2418373‑2418833 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |