Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 131,380 | 0 | T | G | 13.8% | 325.5 / 4.1 | 124 | intergenic (‑120/‑235) | Y75_RS00595/acnB | DUF3300 domain‑containing protein/bifunctional aconitate hydratase 2/2‑methylisocitrate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/72); new base G (18/2); total (49/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.96e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GTTCCACAGGCGCTTCCACTGTGCGGCTTTTTATATATAGCCCGGTAGAGGCGGCACAAAGCCCGGCACTGCAAATTAGCGCCAGCACATGGGGTTTAAACGGCAAAGTCATTTTCATAATTCGGATCTCAAGGAAATCGCAATGGTCGGCGAACTGCCACCCGCAGGTGCTGTGAATCCGAGTATAAAGAGGC‑GGTAGTTTAAATTTTGACTAATCTT‑GGGATT‑CGTTGAGAAAGGTGATTATCACCA‑TGCGAATTAACGAAGTTTTTACGGAGGG‑AAACAATCTCTAGACCATCC‑TTAACGATTCAG‑CCA‑CTTTTTTATGTTGCTTTTTTGTAAACAG‑ATTAACACCTCGTCAAAATCCTGCTATTCTGCCCGTTGCGGTACTGGGCATTTACCCTACAAACTGCTGTCTCACAGGAGCGTGAAGAGAATCGCCTGCCGCACTATGACAATGAGAGCGAGGA > NC_007779/131143‑131606 | tCCACAGGCGCTTCCACTGTGCGGCTTTTTATATATAGCCCGGTAGAGGCGGCACAAAGCCCGGCACTGCAAATTAGCGCCAGCACATGGGGTTTAAACGGCAAAGTCATTTTCATAATTCGGATCTCAAGGAAATCGCAATGGTCGGCGAACTGCCACCCGCAGGTGCTGTGAATCCGAGTATAAAGAGGC‑GGTAGTTTAAATTTTGACTAATCTT‑GGGATT‑CGTTGAGAAAGGTGa < 2:555531/238‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |