| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,448,400 | G→A | 15.9% | R978C (CGT→TGT) | rpoC ← | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,448,400 | 0 | G | A | 15.9% | 418.4 / 62.4 | 169 | R978C (CGT→TGT) | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/72); new base A (17/9); total (86/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.30e-02 | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CAGACCGGTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCAGGTCACG > NC_007779/3448164‑3448631 | acCGGTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAg > 1:221547/1‑239 (MQ=255) tGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTAcc > 1:858078/1‑236 (MQ=255) tGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGAATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTAcc > 1:1309987/1‑236 (MQ=255) tCTGGCCGTCTATCATGTCAGTAAAGCGTACAAACCCGCTTGCTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCACCGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAAc < 2:858078/238‑1 (MQ=255) ggCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGaa < 1:1847804/203‑1 (MQ=255) cAGTAAGGCGTACAAAACCGCTGCATTCGTGGATACCCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGc < 2:1389413/239‑1 (MQ=255) aGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGCGATAACCGGCATGGTGTGCCGGTCACAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTCCCGTTCAGCATTACGGGAAGTGGTAACCAGTTTACCTCTGGAGTTCACACCCGACTTCCCGTTGCTGAGCt > 2:306100/1‑239 (MQ=255) tAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGACTTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTg > 2:1964885/1‑239 (MQ=255) aaaGCGTACCAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGAATGGTGTGCGGGGCCCGGTTTGCAACGTTTTCGCCGCCAGCAACCTTTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCt < 2:713151/236‑1 (MQ=255) cGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGt > 2:2079638/1‑182 (MQ=255) cGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGt < 1:2079638/182‑1 (MQ=255) cGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAACTTGAttcc > 2:136392/1‑236 (MQ=255) aCAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTa > 1:1472870/1‑237 (MQ=255) cAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCt < 1:136392/239‑1 (MQ=255) aaaaCCGCTTACTTCGGCGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCtt > 1:1882566/1‑239 (MQ=255) cTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGttttt > 2:694554/1‑239 (MQ=255) cTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGATTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATACTACCTTTGtttt > 1:1554372/1‑238 (MQ=255) cGGCGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGCTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTgg > 2:18195/1‑239 (MQ=255) gTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGAt > 2:1099572/1‑239 (MQ=255) tGATAACCGGCTGGGTGGGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGAt < 2:462697/238‑1 (MQ=255) aTAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACg > 1:1821898/1‑198 (MQ=255) tAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTgg > 1:1422678/1‑233 (MQ=255) tAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTgg < 2:1422678/233‑1 (MQ=255) aCCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGa > 1:416684/1‑239 (MQ=255) gCATGGTGTGCTGTTCCCAGTTTGCAATGGTTTAGCCGCCATCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCt < 2:1350176/212‑1 (MQ=255) cATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGc < 1:901985/206‑1 (MQ=255) cATGGTGTGCGAGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGTCGCCAGCTACCTGTTCGCCATAGCC‑TTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGCTAAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACAGTTGGAGTTCCCAACCGACTTCACGTTGCTGAACTTGCTGCTACCTTTGTTTTTCACTGGTCTGCTGGTTTccgc > 2:86922/1‑239 (MQ=255) tgggggCCCAGTGGGCAGAGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTGTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCGCGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCGCTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCa < 2:1554372/237‑1 (MQ=255) cGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCa > 1:1350176/1‑212 (MQ=255) cGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCAc > 2:1823784/1‑239 (MQ=255) tCCCAGTTTGCAACTGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACgaga < 2:1843348/239‑1 (MQ=255) tCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGACAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGGTGCTGGATTCAGCAGCCGCACgaga > 1:726633/1‑239 (MQ=255) ccAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACagg < 1:155977/131‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACagg > 2:155977/1‑131 (MQ=255) ccAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGAt > 1:1425313/1‑238 (MQ=255) aGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGcc > 1:285229/1‑239 (MQ=255) gCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTcagc < 1:763489/218‑1 (MQ=255) tttCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGcacca > 2:739225/1‑233 (MQ=255) tttCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGcacca < 1:739225/233‑1 (MQ=255) cgccAGCTACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTTGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCTCCACCGATGTGGaa < 2:858879/238‑1 (MQ=255) gccAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACg < 1:1597793/239‑1 (MQ=255) ccTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGGATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATg > 1:1995033/1‑239 (MQ=255) tGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGt < 1:266598/239‑1 (MQ=255) tGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGt < 1:170107/239‑1 (MQ=255) atCGCGATCGCCTTCCGCCAAACCCGAACTGTAAGGTTCTTTGTCGCTTTCTTTTGAACGACCTCATTGGTCGCGCAGCTTCAGATCAGTATTACGGGAACTGATACTCAGCTTACCGCTGCAGCTCACCACCGACTTCACGTTGCTGAGCTACATGCCACCCTTGTTCTTCACTTGACTGCTGGATACAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCCCCGATGAGAAACGTACACAGGGTCa > 2:1692997/2‑239 (MQ=255) cTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTAcc < 1:90401/238‑1 (MQ=255) cGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGt > 1:441551/1‑238 (MQ=255) cGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGtt < 1:18195/239‑1 (MQ=255) gCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGt < 1:51958/221‑1 (MQ=255) tACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACg < 1:618753/206‑1 (MQ=255) tACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACg > 2:618753/1‑206 (MQ=255) tACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACTTACGCATGGCCAGCTGTCTACCCGTTTCAACg > 2:90401/1‑238 (MQ=255) tACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGa > 1:106415/1‑239 (MQ=255) aCCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCg < 2:106415/237‑1 (MQ=255) aCCGTACGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGCTCAGTTTCAGTTCAGAATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGCCTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATgg > 2:1897702/1‑236 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACtgtg > 1:1842483/1‑238 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACtgtg > 1:776401/1‑238 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACtgtg > 2:527381/1‑238 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGtt < 2:1237418/223‑1 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGtt > 1:1237418/1‑223 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTAAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTGCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACTGATGTTGATCGTACGCATGGTCAGCCGGGCACCCGCTCCACCGCTggctattg > 2:438181/1‑232 (MQ=255) tAAGGTACTTTGTAGCTTTCGTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACtgtg > 2:2095120/1‑238 (MQ=255) taGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTGAGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTTCCGCTGGCGTTCACAACCGGCTTCACGTTGCTGATCTTGAGGCTACCTTTGTTGATCACTTGGAGGCTGAGTTCAAGAACCGCGCGAGATGCCGCACCACCGATGTGCAAGGTTCGCATGGTCAGCTGTTTACCCCGTGCACCAATGGACTGTGc < 2:1003887/237‑1 (MQ=255) tttGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATg > 2:102141/1‑142 (MQ=255) tttGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATg < 1:102141/142‑1 (MQ=255) tttGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATa > 2:2012750/1‑238 (MQ=255) tttGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATa > 2:206162/1‑238 (MQ=255) tGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATg > 2:773473/1‑116 (MQ=255) tGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGCTGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCAt > 1:810011/1‑193 (MQ=255) tGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATg < 1:707723/140‑1 (MQ=255) tGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATg > 2:707723/1‑140 (MQ=255) tGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAac > 2:97559/1‑238 (MQ=255) tttctttAGTACGTCCGAAGTCGTCGCTCAAGTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGAAGTCCCGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGTAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCCCCGATGGACTGTGCCGCGATAACAccta < 2:1396532/237‑3 (MQ=255) tttctttAGTACGACCGATTTCGTCGATCAGTTTCAGTTCATTATTACGGGAAGTGATAACCAGTGTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCATCCGCACGAGATGCCGCACCTCCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACGCCGa < 2:1392958/237‑1 (MQ=255) ttctttAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACACGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGAtt > 1:2031778/1‑238 (MQ=255) ctttAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATTCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCa < 1:1940788/149‑1 (MQ=255) ctttAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCt < 2:776401/239‑1 (MQ=255) tttAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGATCAGTATTACAGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCt > 1:202683/1‑191 (MQ=255) tACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGtt > 1:374636/1‑198 (MQ=255) tACGACCCAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTTAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGAAGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGtt < 2:374636/198‑1 (MQ=255) aCGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCAccc < 1:19200/238‑1 (MQ=255) ccGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTcag > 2:1876760/1‑130 (MQ=255) ccGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGc < 1:67759/180‑1 (MQ=255) ccGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGtt < 2:894425/193‑1 (MQ=255) ccGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCttgtt > 1:1147033/1‑239 (MQ=255) tcgATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCaccacc < 1:2078262/146‑1 (MQ=255) cgATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGcac < 2:644105/141‑1 (MQ=255) cgATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGcac > 1:644105/1‑141 (MQ=255) ttcagttcagTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACgcgc < 1:2095120/239‑1 (MQ=255) ttcagttcagTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACgcgc < 2:1513298/239‑1 (MQ=255) tcagttcagtATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCttgttg < 1:1765283/221‑1 (MQ=255) tcagttcagtATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCttgttg > 2:1765283/1‑221 (MQ=255) cagttcagtATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCa < 1:97559/239‑1 (MQ=255) ttcagtATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCAgg > 1:892511/1‑238 (MQ=255) tcagtATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCAGGTc < 1:86922/239‑1 (MQ=255) gtATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACtt > 1:1535908/1‑88 (MQ=255) tATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCAGGTCACg > 1:178304/1‑238 (MQ=255) aTTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCAGGTCAc < 1:1897702/236‑1 (MQ=255) cGGGAAGTGATATCCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGc < 2:179005/138‑1 (MQ=255) cGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGc > 1:179005/1‑138 (MQ=255) | CAGACCGGTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAAAACCGCTTACTTCGGTGATAACCGGCATGGTGTGCGGGTCCCAGTTTGCAACGGTTTCGCCGCCAGCAACCTGTTCGCCATCGCCTTTCGCCAGTACCGCACCGTAAGGTACTTTGTAGCTTTCTTTAGTACGACCGAATTCGTCGATCAGTTTCAGTTCAGTATTACGGGAAGTGATAACCAGTTTACCGCTGGAGTTCACAACCGACTTCACGTTGCTGAGCTTGATGCTACCTTTGTTTTTCACTTGGATGCTGGATTCAGCAGCCGCACGAGATGCCGCACCACCGATGTGGAACGTACGCATGGTCAGCTGTGTACCCGGTTCACCGATGGACTGTGCCGCGATAACACCGATTGCTTCACCCTTGTTGATGATGTGGCCACGCGCCAGGTCACG > NC_007779/3448164‑3448631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |