| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 4,458,032 | A→G | 9.0% | E260G (GAG→GGG) | Y75_RS22070 → | ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007779 | 4,458,032 | 0 | A | G | 9.0% | 282.1 / 4.1 | 104 | E260G (GAG→GGG) | Y75_RS22070 | ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/62); new base G (8/3); total (38/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.71e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATTATCGCGGTGCTGACGCTTATCCTGTTCTGGCTGTTGACCCGCAAAACGGCGCTGGGGATGTTTATCGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCT‑GGACGCCATTCTCGC‑GGTGGTGATTGGCGGCGGATCGC‑TGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACT‑TTCGGTGGTGGGGGCGCTGAT‑TATTCAGGGGA‑TGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGC‑TTTCCGC‑CAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAA > NC_007779/4457797‑4458270 | aTTATCGCGGTGCTGACGCTTATCCTGTTCTGGCTGTTGACCCGCAAAACGGCGCTGGGGATGTTTATCGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACATCGCTGGGTTATGgctggagct < 1:1162128/239‑1 (MQ=255) 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ATTATCGCGGTGCTGACGCTTATCCTGTTCTGGCTGTTGACCCGCAAAACGGCGCTGGGGATGTTTATCGAAGCCGTTGGTATCAACATTCGGGCGGCAAAAAATGCCGGGGTAAACACGCGAATCATCGTCATGCTCACTTATGTGTTGAGCGGGCTGTGTGCGGCGATTGCGGGCATTATCGTGGCGGCGGATATTCGCGGTGCCGATGCCAACAACGCTGGGTTATGGCTGGAGCT‑GGACGCCATTCTCGC‑GGTGGTGATTGGCGGCGGATCGC‑TGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACT‑TTCGGTGGTGGGGGCGCTGAT‑TATTCAGGGGA‑TGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGC‑TTTCCGC‑CAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAA > NC_007779/4457797‑4458270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |