Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_007779 | 4,527,463 | T→G | 14.3% | T438P (ACC→CCC) | Y75_RS22420 ← | xylonate dehydratase YjhG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_007779 | 4,527,463 | 0 | T | G | 14.3% | 423.7 / 7.9 | 163 | T438P (ACC→CCC) | Y75_RS22420 | xylonate dehydratase YjhG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/73); new base G (26/2); total (88/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTGGTAACCTGGTAGGTTTCTTCCATCCCTGTACCTGAAGGTCCAACGCCAATAATGACCAGAATATCGCCCGCCTTGATCTTGTCATGTTTGATATCGTAAATCGCACTTTTCTCGGACAGATAAACCTTCGCCACACCTTTATGGTAATAGATACCTTGCTCATCAATCATCGAGGGGTCAATGGCGGTGGATTTGATCACCGAACCTTCTGGCGCAATATTGCCCACCGGGAAGGTGATAGTTGAGGTTAATCCGCGCGCTTTTGC‑TTGCTGCGGAGACATGATCACTTCGTCAGCGTTGATTTGTTCCTGATCGAGCAGGAGTTGCTTGAACCGCTGACGCCGTTCGGAGTGCTCCCACCAGTCGAGGTTTTCTTTCAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCA > NC_007779/4527225‑4527693 | ttGGTAACCTGGTAGGTTTCTTCCATCCCTGTTCCTGAAGGTCCAACGCCAATAATGCCCAGAATATCGCCCGCCTTGATCTTGTCATGTTTGATATCGTAAATCGCACTTTTCTCGGACAGATAAACCTTCGCCACACCTTTATGGTAATAGATACCTTGCTCATCAATCATCGAGGGGTCAATGGCGGTGGATTTGATCACCGAACCTTCTGGCGCAATATTGCCCACCGGGAAGGt < 1:565984/238‑1 (MQ=255) 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CTGGTAACCTGGTAGGTTTCTTCCATCCCTGTACCTGAAGGTCCAACGCCAATAATGACCAGAATATCGCCCGCCTTGATCTTGTCATGTTTGATATCGTAAATCGCACTTTTCTCGGACAGATAAACCTTCGCCACACCTTTATGGTAATAGATACCTTGCTCATCAATCATCGAGGGGTCAATGGCGGTGGATTTGATCACCGAACCTTCTGGCGCAATATTGCCCACCGGGAAGGTGATAGTTGAGGTTAATCCGCGCGCTTTTGC‑TTGCTGCGGAGACATGATCACTTCGTCAGCGTTGATTTGTTCCTGATCGAGCAGGAGTTGCTTGAACCGCTGACGCCGTTCGGAGTGCTCCCACCAGTCGAGGTTTTCTTTCAGCGTGCTGCCGGTAACCGTCATAACGTCTTCATGCAACAATCCGAGGCTGCGCAGATGCAACATGACTTCCGGCACACCACCTGCCA > NC_007779/4527225‑4527693 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |