Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4476471 | 4477233 | 763 | 35 [27] | [28] 29 | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
TTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATCATATTAATCTTCGCAGCGATCAGTCTAAAATAGCTGAGACATTATTTTTCAATCTCGATAAAGAACCCTATAAAAATAGCCCTGAATTACA > NC_000913/4476198‑4476752 | ttCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt < 1:757087/273‑1 (MQ=255) ttCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt > 2:757087/1‑273 (MQ=255) ctctAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCa < 1:759012/289‑1 (MQ=255) aGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt < 2:62041/250‑1 (MQ=255) aGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt > 1:62041/1‑250 (MQ=255) cAGTTGATTCTACGATTACGGGTTGATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTATCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAAGTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCAt < 1:721467/289‑1 (MQ=255) aataatGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTa > 2:75678/1‑289 (MQ=255) atGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatga < 2:27232/289‑1 (MQ=255) cTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTAtt < 1:678595/174‑1 (MQ=255) cTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTAtt > 2:678595/1‑174 (MQ=255) aaTGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCGACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATg < 1:566042/289‑1 (MQ=255) tGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCa < 1:75678/289‑1 (MQ=255) tGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCa < 1:343906/289‑1 (MQ=255) aaTCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt < 1:204948/130‑1 (MQ=255) aaTCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt > 2:204948/1‑130 (MQ=255) actGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTaa < 1:374378/221‑1 (MQ=255) actGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTaa > 2:374378/1‑221 (MQ=255) ggCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCatgcatgc > 1:472620/1‑288 (MQ=255) gCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCt < 2:472620/288‑1 (MQ=255) tAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGaa > 2:87581/1‑177 (MQ=255) tAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGaa < 1:87581/177‑1 (MQ=255) tAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGTTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATCATATTAATCTTCGCAGCGATCAGTCTACAAt > 1:765371/1‑289 (MQ=255) tAAATGATCACGGAATTGATAACGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATAtt < 2:573517/77‑1 (MQ=255) tAAATGATCACGGAATTGATAACGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATAtt > 1:573517/1‑77 (MQ=255) aTAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGtt > 1:865246/1‑89 (MQ=255) aTAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGtt < 2:865246/89‑1 (MQ=255) aaTGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCaaaa < 1:840264/132‑1 (MQ=255) aaTGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCaaaa > 2:840264/1‑132 (MQ=255) aGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt > 1:91265/1‑39 (MQ=255) aGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCt < 2:91265/39‑1 (MQ=255) gTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATAtt > 2:584865/1‑131 (MQ=255) gTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATAtt < 1:584865/131‑1 (MQ=255) tGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATCTTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCTTAATAAATCCTATTAATCTTCCAAGCGATCAGTCTAAAATAGCTGCAACATTATTTTTAAATCTCGATAAAGAACCCtat > 2:438694/1‑289 (MQ=255) gACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATCATATTAATCTTCGCAGCGATCAGTCTAAAATAGCTGAGACATTATTTTTCAATCTCGATAAAGAACCCTATAAAAATAGcc < 1:438694/289‑1 (MQ=255) ttAACCTGTCTCATAGTCTTATTTATTCCTTAGAAGATGCAAAGGTTAACCTTAAACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATCATATTAATCTTCGCAGCGATCAGTCTAAAATAGCTGAGACATTATTTTTCAATCTCGATAAAGAACCCTATAAAAATAGCCCTGAATTACa < 2:765371/289‑1 (MQ=255) | TTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGATGATACTAAAAAGATAAAGCATGCATGCTCCGTAATAAATCATATTAATCTTCGCAGCGATCAGTCTAAAATAGCTGAGACATTATTTTTCAATCTCGATAAAGAACCCTATAAAAATAGCCCTGAATTACA > NC_000913/4476198‑4476752 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |