| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3242761 = | 263 (2.450) | 9 (0.090) | 8/440 | 7.6 | 3.7% | coding (554/1488 nt) | uxaA | altronate hydrolase |
| ? | NC_000913 | 3242787 = | 217 (2.100) | coding (528/1488 nt) | uxaA | altronate hydrolase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
GACCGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGAAGAGGAACACGCCGTCAGTACCTTCGGCGTTGTTGGTCTCTTTCAGAAAACGGTTCTGGATCTGCCGCGCGATGCCGTTGACACAGCCCACGGTTGGCAGGATCCACAGCTCATTACGCACCCCGACATCGCCGTTAGCGCGACGATAGATCTGCACTTCACGATCTGCCGCTTGCGCAGGCAGATCCTGAAAATCAGGTTGATAGCGATACTGATCCAGATCGCTCAGATTCG > NC_000913/3242507‑3243070 | gcccGTCAGAACCGCCGACCTCCAGACCAACCTTCCATTCGCTGGATTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGACAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAACCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTAt < 2:932021/283‑1 (MQ=255) cGTCAGAACCACCGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTTGCGCACCATGTTTTGGCGCCTGGTGCGGGTATTAAt > 1:259205/1‑286 (MQ=255) cGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGTTATTAATGTGATCGTCGc > 1:661705/1‑285 (MQ=255) cGCACTCCAGACCAAACTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGc > 1:68915/1‑285 (MQ=255) cacAACCTTCAGTTGCTTGAGTTTGCCTGGTTCGCGTTTATCTGTGCGCATCACGTTATCCAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGag < 2:259205/284‑1 (MQ=255) aCTTCATTTTGCTGAGTTTGCCTTGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGCTGCAAATGCCCGTTTCCGGCTTCGATC‑‑‑TCAT‑CCTGCTGTTGGCCGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGACCCATATCTCCTAGCGCCTCACGGAGTGTGGCAACCTGGTTGTTTTTCCACCCCTGCCCAATCTCCAACACTCCGCCTGCCTTCGGTGTGCGCCCCATGTTTTTCAGTCTGGTTCTGGTTTTAATGTGATCGTGCCCCTGCCGTGCAGAGCCGt > 2:136156/1‑285 (MQ=255) aCTTCAGTTCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGTCTGCGTTCGGGCGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGCGCGGGTCtt > 1:349811/1‑256 (MQ=255) ttCGCTGAGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGgtg > 1:358553/1‑286 (MQ=255) aGTTTGCCTGGCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGATCGTCGCCCAGCTGTGAGCAGCCGTAGGTGTGGCTGa > 1:117447/1‑286 (MQ=255) gCTCGCGTTTATCGTTGCGCATCACGTTATACAGCTGATGCAAATGCTCGATTCCGGCTTCGATCTCATCAT‑CCTGCTGTTGGCAGATCATGAAATGAACGCGTTCAGGATCGATATCGCCCAGCGTTTCACGGAATGCGGCAACCTGGTTGTTTTCACAGCCCAGACCAATCACCAGCACTGCGCCTGCGTTCGGGTGGCGCACCATGTTTTGCAGCATGGTGCGGGTATTAATGTGAt > 2:203659/1‑240 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |