Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 582695 | 584641 | 1947 | 33 [27] | [26] 28 | [ybcY]–appY | [ybcY],ybcY,tfaX,appY |
TTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACCACA > NC_000913/582408‑582958 | tttGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCt < 1:565584/289‑1 (MQ=255) ttGGAGATATATTTCAAAGGAGGCAGTGAAGAAAGTAAGACATAGAAATGTAATCAAATTGACCATGTAACGACGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAAGTTTATGTTTAATGTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCtt < 2:102777/289‑1 (MQ=255) ataatgacatTTCCAGGAAAGCAGGGAACAAGGTAAGACATTGAAATGGAATGTAAATTACCATTTAACGCCCTGTTATAATGTTCAAAAACATCATTGCTATTTTTATGTTTAATTTCTGAAGCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTg < 2:493719/281‑1 (MQ=255) aggcaggcAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTc > 1:224393/1‑270 (MQ=255) aggcaggcAGGGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGAACATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTc < 2:224393/270‑1 (MQ=255) aagGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGAt < 1:473847/289‑1 (MQ=255) aatggaaTCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACccac < 1:616328/289‑1 (MQ=255) cAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATa < 2:405042/289‑1 (MQ=255) cAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATa < 1:510422/289‑1 (MQ=255) ccATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCttt < 1:362213/288‑1 (MQ=255) cATGTAACGCCGCGGGCTAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGCTGCCGCGTTAAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTCCTCTCAGGTACGTGAGTACGGTAAAACCCAGTTCCACCACCACTCTCCAGATGGTTGTTGCCGAAATGTTCCAGAAATTGTGGACGAAGGTGTTCATTTGTAGTCCATCCCCATGCAAGCCGATTGGATACTACCACAACCCACCAATCATaacaatttag > 2:438929/1‑281 (MQ=255) aaaaaCATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGa < 1:345611/208‑1 (MQ=255) aaaaaCATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGa > 2:345611/1‑208 (MQ=255) aaaaCATCATAGCTAATTTTATGTTTAATGTTTGAGTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGTTGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACAGCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGccc < 1:438929/289‑1 (MQ=255) ttCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTc < 1:593570/122‑1 (MQ=255) ttCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTc > 2:593570/1‑122 (MQ=255) ttCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATgg < 1:325748/281‑1 (MQ=255) ttCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATgg > 2:325748/1‑281 (MQ=255) gcacttAAAAATATAAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGCTAAAACCCATTTCCAACTCTAATAACCATATGGTTGTTACATAAATGTTCCAGAAAGATTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTGTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAg < 2:37902/285‑1 (MQ=255) tCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTa > 2:718474/1‑191 (MQ=255) tCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTa < 1:718474/191‑1 (MQ=255) ctctCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATa < 2:358656/152‑1 (MQ=255) ctctCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATa > 1:358656/1‑152 (MQ=255) cAGGTACTGGAGTAAGGGACAACTCAGGGCCAAAACCAATGTCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTTAAGAAAGTGTGGAAGAAGGTTTGCCGTTGTAGGACATCCCAATGCAAGCAGATGTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTGAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCAACTGTGTTTTTTTATTAATATCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGAAATGAATTACAAGGGGTGAAATGCTGCCGCAGCAGAGc < 2:298705/289‑1 (MQ=255) cGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTc > 1:494393/1‑85 (MQ=255) cGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTc < 2:494393/85‑1 (MQ=255) cGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTtg < 1:247455/225‑1 (MQ=255) cGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGATTTAAATCAATTATGTCATTGAATAACAAGGGGTTAATTGCTGCCGCAGAATAGCGATCtt > 2:136438/1‑289 (MQ=255) cGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCACAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAACTTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTtg > 2:247455/1‑225 (MQ=255) aaTATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCAcc > 2:329802/1‑176 (MQ=255) aaTATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCAcc < 1:329802/176‑1 (MQ=255) ccAGAAAGTGTGTAAGAAGGTTTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTACCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACcaca < 1:234821/289‑1 (MQ=255) ccAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACcaca < 1:136438/289‑1 (MQ=255) | TTTGTAGATATATTTCCAGGCAGGCAGTGAAGAAGGTAAGACATGGAAATGGAATCAAATTGACCATGTAACGCCGCGGGATAAGGTTCAAAAACATCATGGCTAATTTTATGTTTAATTTTTGATTCCCCAGCCCTTGTAGATGCCGCGTTCAGGCTAGCTTCGTTCAAATCCATTAAAGATATCAGACTACTCTCAGGTACGTGAGTAAGGTAAAACCCAGTTCCAACACCAATATCCAGATGGTTGTTACCTAAATGTTCCAGAAAGTGTGGAAGAAGGTGTTCCTTTGTAGGACATCCCCATGCAAGCCGATTTGATACTCCCAAAACCCACCAGTCATAAAGCTTTAGGGTAAGTGGTGTGTAAATTCTAGCCCCATCATCTGTGTTTTTTTATTAATTTCACCATGTTATAGTTTTATTTGTGAATTAAATCAATTATGGCAATGAATTACAAGGGGTTAAATGCTGCCGCAGCATAGCGATATTGAAATAGCCTGGTATGCTTCAATACAGCAGGAGCCGAATGGCTGGAAGACCGTCACCACA > NC_000913/582408‑582958 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |