Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4251330 | 4252040 | 711 | 28 [22] | [26] 28 | yjbI | pseudogene, SopA‑related, pentapeptide repeats‑containing |
TGAGGTGAATTTCGATACCCAACAGATGATCGATTTTATTAACAGATTTAATACGAATAAATGGCTAATTGATAAAAATAACAATTTTTTTATCCAACTTATCGATCAGGCCTTACGATCAACGGATGATATGATCAAAGCAAATGTTTGGCATCTTTATAAAGAGTGGATTCGTAGTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCC > NC_000913/4251770‑4252329 | tGAGGTGAATTTCGATACCCAACAGATGATCGATTTTATTACCAGATTTAATACGAATAAATGGCTAATTGATCAAAATAACAATTTTTTTATCCAACTTATCGATCAGGCCTTACGATCAACGGATGATATGATCAAAGCAACTGTTTGGCATCTTTATAAAGAGTGGAGTCGTAGTGAGGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGCATTAAGAAGAACCGATAATTCCTTTATCCTGTTTTATTTAGTAgatgat > 2:45298/1‑289 (MQ=255) aaTAAATGGCTAATTGATAAAAATAACAATTTTTTTATCCAACTTATCGATCAGGCCTTACGATCAACGGATGATATGATCAAAGCAAATGTTTGGCATCTTTATAAAGAGTGGATTCGTAGTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACaa > 1:272728/1‑289 (MQ=255) aaaaaTAACAATTTTTTTATCCAACTTATCGATCAGGCCTTACGATCAACGGATGATATGATCAAAGCAAATGTTTGGCATCTTTATAAAGAGTGGATTCGTAGTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCAAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAAtt > 1:386945/1‑289 (MQ=255) aggacataagATCAACGGATGATATGATCAAAGCAAAGGTTTGGCATCTTTATAAAGAGTGGATTCGTAGTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGtt < 2:272728/280‑1 (MQ=255) atgatatgatCAAAGCAAATGTTTGGAATCTTTATAAAGAGTGGATTCGTAGTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATATACAATTCCAGACATGAGATGTTTCCTGTTAATCTTAATCa > 1:163708/1‑289 (MQ=255) gatgatGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTAAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCAttt > 1:19549/1‑289 (MQ=255) gTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACtt > 2:451695/1‑288 (MQ=255) tCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGtt < 1:144225/209‑1 (MQ=255) tCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGtt > 2:144225/1‑209 (MQ=255) aGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCCGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATATTACTCAGGACACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCa > 1:184802/1‑288 (MQ=255) taaaGTTAATTTAAGACCCTTTAACACGAATAAATTAACACCAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTTCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCATCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGtata < 2:725704/287‑1 (MQ=255) tGAAAATAAGTTAAGAATATTTAACAAGAAGGAATTAAAACGGAACGATATTATCTTTATTCTGTTCTCCTCAGTCCATGATTGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTTAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAAGCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGtata < 2:386945/289‑1 (MQ=255) aaTTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATggg < 2:487319/78‑1 (MQ=255) aaTTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATggg > 1:487319/1‑78 (MQ=255) tttAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCTAGCTCATCGTATAATGAATAAg > 1:725704/1‑289 (MQ=255) ccTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGTGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATACAGACATGAGATGTTGACTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCAAAATCTAATGGTAATGATGCGCTTTTCCCCTTTTTTTCTGTGAGTTTGCGAGCTAATAGTATAATGAATAAGAgttgtta > 2:102544/1‑284 (MQ=255) ccTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATc < 2:140058/157‑1 (MQ=255) ccTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATc > 1:140058/1‑157 (MQ=255) ttAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGCCATGCTCATCGTATAATGAATAAGGTTGTTTACGt > 2:500337/1‑289 (MQ=255) aatgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCATCAGTCGATGATGGGACAGTTATGGTGGTAAGCTAACAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAGTTCCACGTATATCTACAAAGCCAGACATGAAATATTGCCTGTTAATCTTAATAAGGAAACACTTTTCAGATCACACTCTCATGGTACATTGGCGCTTTTCCCCATTTTTAATTCGAATGGGCATGCACAGAGTAGACTGAATCAGAGTGTTTAACTAAAGGaaa > 2:345378/1‑289 (MQ=255) atgaatTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGaaaa > 2:304623/1‑289 (MQ=255) aaaCGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATACTGAATAGGGGTTTTTAAGTAAAGGAAAACATAACAGTTcat > 2:125941/1‑287 (MQ=255) ttATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGtata < 2:194173/233‑1 (MQ=255) ttATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGtata > 1:194173/1‑233 (MQ=255) gTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGtata > 1:110121/1‑226 (MQ=255) gTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGtata < 2:110121/226‑1 (MQ=255) ttCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGCCATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCATCTCCAACTCTCATGGTAACTATGAGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGCGTTGGCAAGTTCATCTTCTAATCAATACGGGTTTTTAAGTAAAGGAACATATCAACATTCTTGGAATCCTGGCCGTTGATGccc > 2:146779/1‑289 (MQ=255) ttCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACATTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCTCTTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCACCGTATAATGAATAAGGCATTTTAATTAAAGGAAAACATCATCCTTCCTGGCTTTATGGACGGTgttcac > 2:188649/1‑283 (MQ=255) | TGAGGTGAATTTCGATACCCAACAGATGATCGATTTTATTAACAGATTTAATACGAATAAATGGCTAATTGATAAAAATAACAATTTTTTTATCCAACTTATCGATCAGGCCTTACGATCAACGGATGATATGATCAAAGCAAATGTTTGGCATCTTTATAAAGAGTGGATTCGTAGTGATGATGTTTCACCTATATTTATAGAAACTGAAGATAATTTAAGAACCTTTAACACGAATGAATTAACACGAAACGATAATATCTTTATCCTGTTCTCCTCAGTCGATGATGGGCCAGTTATGGTGGTAAGCTCCCAGCGCTTACATGATATGTTGAATCCTACAAAAGATACCAATTGGAATTCCACGTATATCTACAAATCCAGACATGAGATGTTGCCTGTTAATCTTACTCAGGAAACACTTTTCAGCTCCAAATCTCATGGTAAATATGCGCTTTTCCCCATTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCC > NC_000913/4251770‑4252329 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |