| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3781698 = | NA (NA) | 3 (0.020) | 3/550 | NT | NA | noncoding (1/29 nt) | REP273 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP273 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 3781727 = | NA (NA) | intergenic (+39/+14) | trmL/cysE | tRNA Leu mC34,mU34 2'‑O‑methyltransferase, SAM‑dependent/serine acetyltransferase | |||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TATCGCGCGTTCCTCGAAGCAGAAAATCCCCAGCGCCTGTTCGCCCTCACCACGAAAGGTACACCTGCTCACAGCGCCGTAAGCTATCAGGATGGCGATTATCTGATGTTCGGCCCGGAAACACGCGGCCTGCCAGCGAGCATTCTTGATGCCCTGCCCGCTGAACAAAAAATTCGCATTCCGATGGTGCCGGACAGCCGCAGCATGAATCTGTCCAATGCGGTGTCGGTAGTGGTGTATGAAGCCTGGCGGCAGTTGGGGTATCCGGGAGCGGTATTGAGAGATTAGTTACTGTAGGCCGGATAGATGATTACATCGCATCCGGCACGATCACAGGACATTAGATCCCATCCCCATACTCAAATGTATGGTTAATACCGTTGAAATGCTGGTCCATATCCATTGATGGCTTATCGCTGTCTGGTTTACCGACAATACGAGCCGGAACGCCAGCGGCGGTGGTATGCGGCGGCACCGGTTGCAGCACCACGGAACCTGCGCCAATCTTCGCGCCGCGCCCAACTTCAATATTGCCGAGGATTTTCGCGCCCGCGCCAATCATCACACCTTCACGAATTTTCGGGTGACGGTC > NC_000913/3781401‑3781992 | gacgcttggcggtacgggtaaatctggtggtgaccgtcacccgaaaattcgtgaaggtgtgatgattggcgcgggcgcgaaaatcctcggcaatattgaagttgggcgcggcgcgaagattggcgcaggttccgtggtgctgcaaccggtgccgccgcataccaccgccgctggcgttccggctcgtattgtcggtaaaccagacagcgataagccatcaatggatatggaccagcatttcaacggtattaaccatacatttgagtatggggatgggatctaatgtcctgtgatcgtGc > 1:93262‑M1/298‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |