| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 924,050 | T→G | 28.2% | F263V (TTT→GTT) | clpA → | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 924,050 | 0 | T | G | 28.2% | 218.5 / 105.9 | 132 | F263V (TTT→GTT) | clpA | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/48); new base G (17/21); total (63/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.04e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CTGGTGGGGAGGAACGTATGGAGAATTTCACGACGAACCTGAATCAGCTTGCGCGCGTGGGCGGAATCGACCCACTGATTGGTCGTGAGAAGGAGCTGGAGCGTGCTATTCAGGTTCTCTGCCGTCGCCGTAAAAACAACCCGCTGCTGGTGGGGGAATCTGGTGTCGGTAAAACCGCGATTGCGGAAGGTCTTGCCTGGCGAATTGTTCAGGGCGATGTGCCGGAAGTGATGGCTGACTGTACGATTTACTCTCTCGATATCGGTTCTCTGTTAGCGGGCACAAAATATCGCGGCGACTTTGAAAAACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAATTCGTGTAATTGGTTCGACAACCTATCAGGAGTTCAGCAACATTTTCGAGAAAGACCGTGCTCTGGCGCGTCGCTTCCAGAAAATTGATATTACTGAACCGTCGATCGAAGAAACTGTTCAAATCATCAATGGCCTGAA > NC_000913/923751‑924348 | gtggGGAGGAACGTATGGAGAATTTCACGACGAACCTGAATCAGCTTGCGCGCGTGGGCGGAATCGACCCACTGATTGGTCGTGAGAAGGAGCTGGAGCGTGCTATTCAGGTTCTCTGCCGTCGCCGTAAAAACAACCCGCTGCTGGTGGGGGAATCTGGTGTCGGTAAAACCGCGATTGCGGAAGGTCTTGCCTGGCGAATTGTTCAGGGCGATGTGCCGGAAGTGATGGCTGACTGTACGATTTACTCTCTCGATATCGGTTCTCTGTTAGCGGGCACAAAATATCGCGGCGACGTTg > 1:784738/1‑300 (MQ=255) 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atatCGCGGCGACGTTGAAAAACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAATTCGTGTAATTGGTTCGACAACCTATCAGGAGTTCAGCAACATTTTCGAGAAAGACCGTGCTCTGGCGCGTCGCTTCCAGAAAATTGATATTACTGAACCGTCGATCGAAGAAACTGTTCAAatca > 1:92076/1‑299 (MQ=255) gACTTTGAAAAACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTAGTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAATTCGTGTAATTGGTTCGACAACCTATCAGGAGTTCAGCAACATTTTCGAGAAAGACCGTGCTCTGGCGCGTCGCTTCCAGAAAATTGATATTACTGAACCGTCGATCGAAGAAACTGTTCaaa < 2:749113/286‑1 (MQ=255) cTTTGAAAAACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAATTCGTGTAATTGGTTCGACAACCTATCAGGAGTTCAGCAACATTTTCGAGAAAGACCGTGCTCTGGCGCGTCGCTTCCAGAAAATTGATATTACTGAACCGTCGATCGAAGAAACTGTTCAAATCATCAATGGCCTGaa > 1:484087/1‑300 (MQ=255) | CTGGTGGGGAGGAACGTATGGAGAATTTCACGACGAACCTGAATCAGCTTGCGCGCGTGGGCGGAATCGACCCACTGATTGGTCGTGAGAAGGAGCTGGAGCGTGCTATTCAGGTTCTCTGCCGTCGCCGTAAAAACAACCCGCTGCTGGTGGGGGAATCTGGTGTCGGTAAAACCGCGATTGCGGAAGGTCTTGCCTGGCGAATTGTTCAGGGCGATGTGCCGGAAGTGATGGCTGACTGTACGATTTACTCTCTCGATATCGGTTCTCTGTTAGCGGGCACAAAATATCGCGGCGACTTTGAAAAACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAATTCGTGTAATTGGTTCGACAACCTATCAGGAGTTCAGCAACATTTTCGAGAAAGACCGTGCTCTGGCGCGTCGCTTCCAGAAAATTGATATTACTGAACCGTCGATCGAAGAAACTGTTCAAATCATCAATGGCCTGAA > NC_000913/923751‑924348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |