Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 3769516 | 3770376 | 861 | 27 [26] | [26] 27 | [yibV]–[yibH] | [yibV],yibV,yibU,yibU,[yibH] |
TAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGA > NC_000913/3769232‑3769755 | tAGCAAATTAAAAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTAGTAACAATTGTATTGTTGTATCTAGTTCTGGGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATg < 2:93932/284‑1 (MQ=255) tAGAACAATAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTa < 2:144192/289‑1 (MQ=255) attaaaaagtaaggACTAAAAAATATGGCAAGTTTATTAAAAATTGTATTTGTTGCTCTATTTATGGGAGTGCAGTTAATGCAAGACAATTTCAGAGAGAGGTAGATTTAGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCTGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAAt < 2:296559/277‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTTACGGACTAAAAAATATGGTAAGGTTATTAACAATTTTATTTTTTTATCCATTTCTGCGAGTGCAGTTAATGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAAt < 2:636956/289‑1 (MQ=255) taaggACAAAAAAATATGGAAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATg < 2:203580/282‑1 (MQ=255) aCGGACTAAAAAATATTACTAGGTTATTAACAATTTTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGa < 1:578040/289‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAAt < 1:622627/273‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTcc < 1:192798/289‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAAAATTGTATTTTTTTCTCTAGTTCTGCGAGGGCAGTGAATGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTTGACTTTcc < 2:153093/289‑1 (MQ=255) tAAAAAAAATGGCAAGGTTATTAACAATTGGATTTTTTTATCTATGTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTcc < 2:515369/289‑1 (MQ=255) aaaTATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAAt < 1:16432/289‑1 (MQ=255) aaaTATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAAt < 1:479835/289‑1 (MQ=255) aaTATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATc < 1:82686/289‑1 (MQ=255) ggCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGCCATATTTTGCTGGGAATGATAAAAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATTTAATAAGGTACAAAATAGATGCGGGACttttatcttatacac > 2:622627/1‑277 (MQ=255) ttGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATtaagt < 1:649556/289‑1 (MQ=255) ttCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTcc > 1:602170/1‑244 (MQ=255) ttCTGCGAGTGCAGTGACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTcc < 2:602170/244‑1 (MQ=255) tCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGAc < 2:24725/289‑1 (MQ=255) gagTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGACAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGc < 1:105175/287‑1 (MQ=255) aaattgggaaaaaaaaGAAAAATTATGGGAACTAATAGAATCCAGTACTAAAGAGGGAGGAAAAGAGTGTTAACTAAGCGATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGAt < 2:480293/276‑1 (MQ=255) aCTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGAt < 1:374652/289‑1 (MQ=255) ggACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCg < 1:655991/148‑1 (MQ=255) ggACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCg > 2:655991/1‑148 (MQ=255) aCTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAg > 2:137015/1‑289 (MQ=255) ggCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATtga < 1:137015/289‑1 (MQ=255) cTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCtattta < 2:51365/95‑1 (MQ=255) cTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCtattta > 1:51365/1‑95 (MQ=255) | TAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTATTATGGCCATTGA > NC_000913/3769232‑3769755 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |