| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4433885 | 94 (1.380) | 3 (0.040) | 3/536 | 7.5 | 3.1% | coding (140/861 nt) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 4433891 = | 92 (1.360) | coding (134/861 nt) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGCAGGAACCGTTTTCATCAAGGATTCAATAACATAGTGACCAAGTTGGCCAGTGGCACCAGTAATAGCGATCATGGGAAGTCTCCATCGTTTTGTCTTGTGTTTAAATACGCTAACACCTAAACTTACTTTTAGTAAGTACGTACAAAAAGGTAAGTATGAAATGAGTCAGGTTAGCCTGTCGCAACAACTGAAAGAGGGTAATCTCTTTGCGGAACA > NC_000913/4433598‑4434168 | tttCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTAGACGAGATCAGCCGTAGTTTTTCCACTCCCTACAGTGCCGCTGTCAGTTCGGCTTCTTCGCCGTTGTTCGCATTACGCACggc > 2:216065/1‑288 (MQ=255)tttCGCTGTACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGGATAAGCGATAAATTTCACTCCAGGCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCAACGCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTAATCGCCGTAGTCAGCCTGCCGCACTGt > 1:660807/1‑289 (MQ=255) tACCAGCCGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCAAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATCAGCGATCACTTTCACGCCAGCCGCCTTGGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGTTCAGCAGTCGCTGTTCCACTCCCTGAAGTTCAGATGTCAGTGCGGCTTCCTCGCCGCAGTCAGCCGGCCGCACGGTAGTGCCtt > 2:691172/1‑289 (MQ=255) ccGTTGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGcc > 1:296268/1‑281 (MQ=255) tGCGCAGCAGGGTGTAAACGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGCAGAGATCAGCAGTCGTTTTTCAACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCGTCATCGCCGTAGTCAGCCGGCCTCACGGTACTGCCTTGggctgcacg > 1:541321/1‑286 (MQ=255) aaaCGCTGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGc < 1:216065/289‑1 (MQ=255) aaaCGATGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTg < 1:367771/288‑1 (MQ=255) aTGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGACGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAAt > 1:492334/1‑254 (MQ=255) aTGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCGGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCACAGGCGTGGGCGTTTGCCggcg > 2:376397/1‑287 (MQ=255) aTGCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATAAGCAGTAGTTTTTCCACTCCATGAAGTGCAGCTGTCCGTGAGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTCATGCATTGTGATGCCAGGTCTTGGGGTTTGGCgggct > 2:208319/1‑287 (MQ=255) 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gCCAGAATCAGCCAGCATTTTCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGAtt > 1:296642/1‑288 (MQ=255) cAGAAGCAGCCAGCGTTTTCTCCGGCTCGATGTGCGCAGCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCGGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAAGTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTacg < 2:344459/289‑1 (MQ=255) ttCTCCGTCTCGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACACTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGCAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGCTACCCCCttgt > 1:190729/1‑285 (MQ=255) tctcGATGTGCTCATCGGCGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTTGCAGGCTGGAATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTtggctggc < 1:572189/289‑1 (MQ=255) ggcgagggcgagCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAATCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGCAGGAACCGTTTtcatc < 1:376397/289‑1 (MQ=255) cGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGCAGGAACCGTTTTCATCaa > 1:262118/1‑289 (MQ=255) cGAGGCCGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGACTTGTGCTGCCAGGGCTGGGGCTCTTGACGGGGTGCGAACTGAAGCCACACTTTGGCTGGGAGGAACCGTTTTAATCaa > 2:209425/1‑289 (MQ=255) ccGAGCGGGGAGGTATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGTTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGCAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATGTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGCAGGAACCGTTTTCATCAAGGa < 1:86603/287‑1 (MQ=255) cgggCGGGGAGGGATCTGCATGTAGCAGGCTGGTATAAGCGATAAATTTCACGCCAGCCGCCTTTGCGGCATTAATAACATTACGATGCTGCGGGGCACGCTGACCCACTTCGCTGGAAGAGATCAGAAGTAGTTTTTCCACTCCCTGAAGTGCAGATTTCAGTGCGGCTTCATCGCCGTAGTCAGCCTGACGCACGGTAATGCCTTGTGCTGCCAGGGCTTGGGCTTTTGCCGGATTACGAACGATAGCCACTATTTGGCTGGCAGGAACCGTTTTCATCAAGGAtt < 1:636733/285‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |