New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4217479 | 74 (0.990) | 10 (0.130) +CAA |
3/522 | 8.0 | 11.4% | coding (371/1305 nt) | aceA | isocitrate lyase |
? | NC_000913 | 4217480 = | 81 (1.060) | coding (372/1305 nt) | aceA | isocitrate lyase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGCGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAG‑TTTTAGTG‑CCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCG‑CGTCTGGCA > NC_000913/4217192‑4217765 | tGCGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAACGCGGGTATTGCAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCGAACCTGGCGGCCAGCAGTTATCCGGAGCAGGCGCCCTATCCAGCAACCTCGGGTCCAGCTGTGGTGGAGGGGCT‑‑‑c > 2:378205/1‑289 (MQ=255) tGCGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCCATAGCCGGCAAACTCGGTGCCAGCGGTGGGGGGGCGGAT‑‑‑c > 2:96963/1‑289 (MQ=255) cGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAATGCGGGAATTGAAGCAGTCTATCGGTCGGGATGGAAGGTGGCGGCGGACGCCAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGACCAGTCGATCTACCCGGCAAACTCGGTCCCGGTGGCGGTGGAGCGGGT‑‑‑caa > 2:348612/1‑289 (MQ=255) cGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTAGCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTTCCAGCTGGGGTGGAGCGGGT‑‑‑caa > 1:192478/1‑289 (MQ=255) cGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAAACTGGCGGCCAGCATGTATCCGGAACAGTCTCTCTATCCGGACAACTCGGTGCCAGCTGTGGGGGCGCGGAT‑‑‑aaa > 1:259305/1‑289 (MQ=255) aaGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑ccacca > 1:358490/1‑287 (MQ=255) gtggtgAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGGTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGGGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCt > 1:158315/1‑289 (MQ=255) gtggtgAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTTTCCGGCAAACTCGTTGCCAGCTGTGGGGGACGCGCT‑‑‑CAACAACCCCt > 2:244796/1‑289 (MQ=255) gtggtgAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGAGCAGTCGCTCTATCCGGCAACCTCGGTGCCAGCTGTGGTGGGGCGGAT‑‑‑CAACAACAACt > 2:53027/1‑289 (MQ=255) tggtgAAGTGTCCCGTTTCAGTCAAGCCGGAATGCCGGCTGGTGCACCGGGGCGGAGCGAAAATTTGGCGTCTGCTGCACGGGGGGTCGAAAACAGGCTGCAGCGACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCtt < 2:18007/289‑1 (MQ=255) 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ggTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATc < 1:230810/289‑1 (MQ=255) gTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGGCGTGCCGATCa > 1:649529/1‑289 (MQ=255) ccTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGCGCGGAT‑‑‑CCACAACACCTTCCGTCCTGCCGACCAGATCCaagtg > 2:288801/1‑285 (MQ=255) ccTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGGAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGGTCTATCCGGCAAACCCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGCTCTGCCGCTCCGATCCAATggg > 2:366714/1‑288 (MQ=255) aaTGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTCACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTTGTGGAGCGGCT‑‑‑CAACAACACCTGCCGTCGTGCCGACCCGAGCCAACGGTCagc > 2:165127/1‑289 (MQ=255) atgccggCTGGCCGAACGGGGGGCAGCGAAAAGGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCcgc < 1:403716/282‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCa > 1:444240/1‑289 (MQ=255) ggCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGGCGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATTTATCCGGATCAGGCTCTCCATCCGGCAAACTCGGTCCCCGCTGTGGTGGGGCCGAT‑‑‑CCACCACACCTTCCGTCGTTCCGCTCCGTGCCAATGGTCCGCGGGCATTGa > 2:702529/1‑288 (MQ=255) ggCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGGGAGTCGAAAAAAGGCTACAGCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGAt < 1:443350/288‑1 (MQ=255) 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cGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGACCAGTCGCTCTCTCCGGCAAACTCGGTGCCCGCGTTGGTGGATCGGAT‑‑‑CAACCACACCTTCCGTCCTGCCGCTAAGATCCACTGGTCCGCCGCACTTCGGCCGGGCGATcccgcgt > 2:504981/1‑283 (MQ=255) gAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGGGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCt < 1:96963/287‑1 (MQ=255) aaaaTGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGTGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTAt < 1:550091/288‑1 (MQ=255) tGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAAACACCCCTTCCGTCGTGCCGACCAGCTCCAATGGTCCGCGGGCATTCACCCGGGAGAACCGCGCTATGTCCGTTACTTccctcgcgtcgtt > 2:406444/1‑278 (MQ=255) tGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGAGCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTTCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCCTGCCGATCAGCTCCAAGGGGCCGCGGGCATGTGCCCGGGGGATCCGCGGCATGTCAGTTACCTCCCGCCGATCGtg > 2:503441/1‑288 (MQ=255) aGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCCGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGACCCGCGCCATGTCGAGTCCTTCCCGCCGATCgcta > 2:213781/1‑285 (MQ=255) cGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTCTGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGa > 1:440761/1‑289 (MQ=255) aaaaaGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATAGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGc > 1:680771/1‑289 (MQ=255) gCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTCAGCCGGGCCATCCGCGCGATGTCGATTACTTCCTGCCGGTCGTTGCCCATGGCGA‑Ag > 2:46922/1‑288 (MQ=255) 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ctgtgcgcgcGGACTGGCCGTCAGGCGGTGGA‑AGAGGCGAAATGGGGTAGTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGAAGCTAACCTGGCGGCCAGCATGGATCCGAATCAGTCGCTTGATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAAAACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCGgtg < 1:659518/285‑1 (MQ=255) cgcGGCGTACTGTCGGTCGGTCATGCGCTCGA‑ACAGGCGAAGGCGGGTTTTGAAGCAGTCTATGGGTGGGGATGGGCGGTCGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATGCGGATCAGTCGATCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCg < 2:494540/284‑1 (MQ=255) cTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGGTTTGGCGgtg > 1:631032/1‑289 (MQ=255) 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cGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCGgtgt > 1:508706/1‑288 (MQ=255) cACGGACTGGCGTTCAGGCGCTGCA‑ACGGGGGAAAGCGGGTATTGAATCAGGCTATCTGTCGGGATGGAAGGTAGCGTTGGACGCTAACCTGGAGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGaa < 1:212678/289‑1 (MQ=255) gctgactgGCGGTAAGGGGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGAAGGTAGCGGCGGACGCTGACCTGGCGGCCAGCATGTATCCTGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGaa < 1:69869/287‑1 (MQ=255) 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TGCGGAAGATGTGGTGAAATTACGCGGTTCAGTCAATCCTGAATGCACGCTGGCGCAACTGGGCGCAGCGAAAATGTGGCGTCTGCTGCACGGTGAGTCGAAAAAAGGCTACATCAACAGCCTCGGCGCACTGACTGGCGGTCAGGCGCTGCA‑ACAGGCGAAAGCGGGTATTGAAGCAGTCTATCTGTCGGGATGGCAGGTAGCGGCGGACGCTAACCTGGCGGCCAGCATGTATCCGGATCAGTCGCTCTATCCGGCAAACTCGGTGCCAGCTGTGGTGGAGCGGAT‑‑‑CAACAACACCTTCCGTCGTGCCGATCAGATCCAATGGTCCGCGGGCATTGAGCCGGGCGATCCGCGCTATGTCGATTACTTCCTGCCGATCGTTGCCGATGCGGA‑AGCCGGTTTTGGCGGTGTCCTGAATGCCTTTGAACTGATGAAAGCGATGATTGAAGCCGGTGCAGCGGCAGTTCACTTCGAAGATCAGCTGGCGTCAGTGAAGAAATGCGGTCACATGGGCGGCAAAG‑TTTTAGTG‑CCAACTCAGGAAGCTATTCAGAAACTGGTCGCGGCG‑CGTCTGGCA > NC_000913/4217192‑4217765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |