| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 4324601 = | 76 (0.710) | 4 (0.040) | 4/548 | NT | 5.0% | coding (565/789 nt) | phnC | phosphonate ABC transporter ATPase |
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GATGTCAGGCAGCTTTCGCGTTCTCTTCGACGCGGTTAATGCTGCGGTAGAGATGGTCAAAACGTTCGTTATCAAACTGTTGGCTGCTGCCGTCGTAGAAGACGTGCCCCTGGCGCAGGGCGACGATGCGTTCGCAGTAGCGCAGGGCGTAATCCACCTGATGCAGCGTGACGACCACGGTGATGCCGTCGTTCTGGTTGATGTCGCGCAGGGTGTCCATCACGATGCGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCACGGGCAATCGCCACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAGAGGGTGGAAACGCGCTGATGGGCAAAATGCACCATGCCAACGCGGGTCAGCGCCTGTAACGCGCGCTGTTTCTGCTCGCCGGTGAACCAGCTAAAACAGGTGCGCCAGAACGGCGTGCTGCCGAGCGCGCCAATCAGCACGTTCTCCAGTACGCTCAGGCGGTTCACCAGGTTGAATTGTTGGAATATGTAGCCGGTATGGGCGCGGCTTTTGCGGATATCGCGGGCCAGGCGGCCTTCGCGCTGGACTGTGCGGCC > NC_000913/4324373‑4324964 | tacatattccaacaattcaacctggtgaaccgcctgagcgtactggagaacgtgctgattggcgcgctcggcagcacgccgttctggcgcacctgttttagctggttcaccggcgagcagaaacagcgcgcgttacaggcgctgacccgcgttggcatggtgcattttgcccatcagcgcgtttccaccctctccggcggccagcagcaacgtgtggcgattgcccgtGCGCTGATTCTGGGTCCAGCGAGGCGATGGGTTCATCGGCCAGAATCACTTTCGCCTGCTGCATCAGCGCa > 1:456687‑M1/229‑299 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |