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ttCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGAAAGTGTCTGTTGTTCGCCAGGCAGATAAATAGTCACCGTTCCTTGCGCAAAGGCATGGGGTGTCATTACGTAAAGTACGCTGGCAATGAAATACGACTGTAATTTATTCATGGTGCGGGTTTAAGAAACGTCATTTCt > 1:1124457/1‑300 (MQ=255) gcttGCTTCCTGGGAAGCAGAAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCCCCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGCAAGTGTCTGTTGTTCTCCAGGCAGATAAATAGTACCCGTTCCTTCCGCAAAGGCATTGGGTGTCATTAAGTCAAGCACCCTGGCAATTACAAACGCCAGTAATTTATTCATGGTGCGGCttt > 2:973944/4‑286 (MQ=255) gcttGCTTCCTGGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGAAAGTGTCTGTTGTTCGCCAGGCAGATAAATAGTCACCGTTCCTTGCGCAAAGGCATGGGGTGTCATTACGTAAAGTACGCTGGCAATGAAATACGACTGTAATTTATTCATGGTGCGGGTTTAAGAAACGTCATTTCt > 1:627937/4‑300 (MQ=255) tctcAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGAAAGTGTCTGTTGTTCGCCAGGCAGATAAATAGTCACCGTTCCTTGCGCAAAGGCATGGGGTGTCATTACGTAAAGTACGCTGGCAATGAAATACGACTGTAATTTATTCATGGTGCGGGTTTAAGAAACGTCATTTCTACGGGaa < 1:520512/297‑1 (MQ=255) ccAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGAAAGTGTCTGTTGTTCGCCAGGCAGATAAATAGTCACCGTTCCTTGCGCAAAGGCATGGGGTGTCATTCCGTAAAGTACGCTGGCAATGAAATACGACTGTAATTTATTCATGGTGCGGGTTTAAGAAACGtta > 2:929299/1‑284 (MQ=255) cAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGAAAGTGTCTGTTGTTCGCCAGGCAGATAAATAGTCACCGTTCCTTGCGCAAAGGCATGGGGTGTCATTACGTAAAGTACGCTGGCAATGAAATACGACTGTAATTTATTCATGGTGCGGGTTTAAGAAACGTCAt > 2:461225/1‑286 (MQ=255) | TCTTGTCCGCGCCTGCAAGGCGGGGGTGATCTTGCAGATAATCGGTAACGCTACGGCCTGCCTGCCAGGGCAATTGCCCGGCCCCAGAAACCGCACCCAGCAGAGTAATAGTCACCGGACGCTGTACGGTATAGAGCGTATAGTCCCCGACCAACGGGGGATTGCTGTTCTCATCCACTCGTACAAAATCAGGGTCCAGTTTGACCGGTAAGCGACCAGTGATATTGAGATTGAGTAACTGCTGGCGCACGGATTTAATCGTTGCCGCCACATCGTCGTCAGCTTCTGCTTCCCAGGAAGC‑‑AAGCTGTGCCATGACATGTTGGTAGTCTTTAAGCGCTTTAGCTTTCGCCGCAGAGTCGGTCAGCAAGGCACCAGGCCACCAGAGGCGATCGCGCAGTTGCGGTTGTGTCACCAACTGGACAACATTTTCCACGGGGCCAACGGAAAGTGTCTGTTGTTCGCCAGGCAGATAAATAGTCACCGTTCCTTGCGCAAAGGCATGGGGTGTCATTACGTAAAGTACGCTGGCAATGAAATACGACTGTAATTTATTCATGGTGCGGGTTTAAGAAACGTCATTTCTACGGGAA > NC_000913/1048136‑1048725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |