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AATGATAATAAGCATCCTGATTGAAACACAGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATG > 1:459307/1‑289 ATAAGCATCCTGATTGAAACACAGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGACCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCCAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTTCTTCCGTTACCCCGTTCGGTTTGCGCATGATAGTGg > 1:473978/1‑288 CCTGATTGAAACACAGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCTTTGCGAGCGCTCACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATACTGCTCGAACGCCTCTGCAAGCATCTTTGGTGCCGTTCCCCCCACTCGTTTGCGCATGTTACTGGTTTAGTa > 2:627900/1‑287 CCTGATTGAAACACAGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT > 2:132654/1‑136 CCTGATTGAAACACAGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 1:132654/136‑1 ATTGAAACACAGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCT > 1:161929/1‑289 AGTATCAAATGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTT > 1:674056/1‑288 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TGGTAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTATCTACCCCAGTCGTAAGGTAAAGTGGAGTGTCGCATCTCAGCTGGATGTGCCCCCATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTACCCCATTACAATCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCT < 2:684695/289‑1 TAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCACGGTTCTTTGCTCCCGTTAACCCGTCTGGCTTGGGCATGATACTGAGTTGGTCACGCTTTTTCGTTTTCACtcagcct > 2:289474/1‑280 TAATGCCGCTTTCTATTTTTGGTATATTCTCTGACCCATGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGAT < 2:719513/256‑1 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TGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG < 2:442567/127‑1 TGCGTAACGTAAAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAGAACCCAGCGCACTCTGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTAGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACGTCTGTAGTCACGCTTTATCTTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTTATCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGT > 2:406712/1‑289 AAGTGGAATGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGACTGGGTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGGGTTCTTCGGTTCA > 1:348298/1‑289 TGTCGACTATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCCCTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCCCTCTGCTATTCCGTTACTCTCTGGTCTCCGCACCCCCGTGTTCTGCGTTTCCAGTCCCAA > 2:294676/1‑289 GACTATCAGTTTGAGTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCGTCCGCCGAGATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATC < 2:674056/289‑1 ATCAGGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTAT‑ATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGGTCTTCGGTTCAAGTCCCCACATCCGGGC > 1:549675/1‑289 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAA > NC_000913/2996361‑2996647 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |