| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,476,874 | C→T | 5.0% | H577H (CAC→CAT) | ydbD → | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,476,874 | 0 | C | T | 5.0% | 259.3 / 2.1 | 80 | H577H (CAC→CAT) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/40); new base T (2/2); total (37/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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CTTACAGTTTAATTTTGTTAAAAGGATGGAGAAAAAATCCCCGGCCTACTTTTGCTGTCGGGATATGCAGGTAATTCACTCTGACGCTGCTTTACAACGGTTATTGACACGTTTCAACGATCCTGAAGGGTGGAGTAATCTGGCGAAAAATCAGTATCTGAGCACGTCGATGAAACAAAAAATTTGGCAACGTGCTTTATCGCATCGGAAAAATAATCCGAAAGCAGATTCAGATGCATATGAAACCAGCGCTGATATGATTTTGTCTGAGCTGATTAGCCACGGCGAAGTTGATGACCAGATGCTATTAAATGCCACCGCCCTGATACGTTCGGACGACTGGGACTTTTTAGAGAGTGCATTAATTAGTTGGGATAATTTACCCGCTGTTGTTCTCAAGGAATTACAGCAAAACACGCCACGCAATGATATTTGGGCGAAGTTTTTTCTGAGGCAGGAAAACAGTTCCCGTGCGCAGGTTGACGAAGCGTTACGTGTTTATTATGCACTAGACCCCGATGCGTTAGCACAACTGGATGTACTGGCAAAACAACCGGATCGTATATGGTGGAGTAC > NC_000913/1476592‑1477167 | agctcAGTTTAATTTTGTTAAAAGGATGGAGAAAAAATCCCCGGCCTACTTTTGCTGTCGGGATATTCAGGTAATTCACTCTTACGCTGCTTTACAACGGTTATTGACACGTTTCAACGATCCTGAAGGGTGGAGTAATCTGGCGAAAAATCAGTATCTGAGCACGTCGATGAAACAAAAAATTTGGCAACGTGCTTTATCGCATCGGAAAAATAATCCGAAAGCAGATTCAGATGCATATGAAACCAGCGCTGATATGATTTTGTCTGAGCTGATTAGCCACgg < 2:420081/281‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |