| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 621 (4.540) | 330/564 | NT | 83.0% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3844640 | 127 (0.930) | coding (677/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase | |||||
Only 100 of 782 total aligned reads displayed.
GGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCC > NC_000913/3844341‑3844939 | cGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTAggt < 1:1198366‑M2/300‑4 (MQ=255) 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ttAACGCCTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaaca > 1:418009‑M2/1‑10 (MQ=255) aaCGCCTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggccaacgcccataatgc > 1:165775‑M2/1‑8 (MQ=255) cGCCTAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatctctgctctcactgccgtaaaacatggcaactgcagttcacttacaccgcttctcaacccggtacgcaccagaaaatcattgatatggccatgaatggcgttggatgccgggcaacagcccgcattatgggcgttggcctcaacacgat > 1:406064‑M2/1‑6 (MQ=255) | GGGCGAAGCCGGATTCGCCTGGTTTGCCCGCTGTGCCGAACAGGCAAGGCAAAACCAGTACTTACAGGTCAGCTCTTGCGTACCCGCCCTGGAAGGCTGCGATGTTAACGGTGCCAGTTTTACCCTTGAACAGATGCTCGCCTGGCGGGACCATCCGCAGGTTACCGGCCTTGCAGAAATGATGGACTACCCTGGCGTAATTAGCGGGCAGAATGCGCTGCTCGATAAACTGGATGCATTTCGCCACCTGACGCTGGACGGTCACTGCCCGGGTTTGGGTGGTAAAGAACTTAACGCCTATATTACTGCGGGTATTGAAAACTGCCACGAAAGTTATCAGCTGGAAGAAGGACGCCGGAAATTACAACTCGGCATGTCGTTGATGATCCGCGAAGGGTCCGCTGCCCGCAATCTCAACGCGCTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCC > NC_000913/3844341‑3844939 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |