| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3828991 | 771 (5.640) | 8 (0.060) | 7/528 | NT | 1.1% | coding (47/1392 nt) | xanP | xanthine permease |
| ? | NC_000913 | = 3828973 | 723 (5.650) | coding (29/1392 nt) | xanP | xanthine permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 837 total aligned reads displayed.
CTTTGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAAATGCGCAACCGGTTGCGCAGACTCAAAACAGCGAACTGATTTACCGTCTTGAAGATCGTCCGCCGCTTCCTCAAACCCTGTTTGCCGCCTGTCAGCATCTGCTGGCGATGTTCGTTGCGGTGATCACGCCAGCGCTATTAATCTGCCAGGCGCTGGGTTTACCGGCACAAGACACGCAACACATTATTAGTATGTCGCTGTTTGCCTCCGGTGTGGCATCGATTATTCAAATTAAGGCCTGGGGTCCGGTTGGCTCCGGGCTGTTGTCTATTCAGGGCACCAGCTTCAACTTTGTTGCC > NC_000913/3828674‑3829271 | ttGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAAATG < 1:511371‑M1/300‑1 (MQ=255) tGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTGATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGATAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAAAtgc < 1:1351017‑M2/300‑4 (MQ=255) gTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAAAtgcg > 1:1231021‑M2/1‑296 (MQ=255) cGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAAAtgcgcaacc > 1:491594‑M2/1‑291 (MQ=255) 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gAGTCAGAAAATGCGCAACCGGTTGCGCAGACTCAAAACAGCGAACTGATTTACCGTCTTGAAGATCGTCCGCCGCTTCCTCAAACCCTGTTTGCCGCCTGTCAGCATCTGCTGGCGATGTTCGTTGCGGTGATCACGCCAGCGCTATTAATCTGCCAGGCGCTGGGTTTACCGGCACAAGACACGCAACACATTATTAGTATGTCGCTGTTTGCCTCCGGTGTGGCATCGATTATTCAAATTAAGGCCTGGGGTCCGGTTGGCTCCGGGCTGTTGTCTATTCAGGGCACCAGCTTCAAc < 1:680169/300‑1 (MQ=255) aaTGCGCAACCGGTTGCGCAGACTCAAAACAGCGAACTGATTTACCGTCTTGAAGATCGTCCGCCGCTTCCTCAAACCCTGTTTGCCGCCTGTCAGCATCTGCTGGCGATGTTCGTTGCGGTGATCACGCCAGCGCTATTAATCTGCCAGGCGCTGGGTTTACCGGCACAAGACACGCAACACATTATTAGTATGTCGCTGTTTGCCTCCGGTGTGGCATCGATTATTCAAATTAAGGCCTGGGGTCCGGTTGGCTCCGGGCTGTTGTCTATTCAGGGCACCAGCt < 2:197378/286‑1 (MQ=255) aaTGCGCAACCGGTTGCGCAGACTCAAAACAGCGAACTGATTTACCGTCTTGAAGATCGTCCGCCGCTTCCTCAAACCCTGTTTGCCGCCTGTCAGCATCTGCTGGCGATGTTCGTTGCGGTGATCACGCCAGCGCTATTAATCTGCCAGGCGCTGGGTTTACCGGCACAAGACACGCAACACATTATTAGTATGTCGCTGTTTGCCTCCGGTGTGGCATCGATTATTCAAATTAAGGCCTGGGGTCCGGTTGGCTCCGGGCTGTTGTCTATTCAGGGCACCAGCt < 2:606507/286‑1 (MQ=255) | CTTTGTATCCGCATCACTCTTTCATACTCGTCATACTTCATCGCGCAGTGGCAACTTCATGAACTATGACGGGTATCGAGTTATGCTTTCCTGGGTCAAATTCTCAGCTGTTAATGAACAAATGGCATGGATTTTAAGCAGAAAAATACCAAAAGTTATATAAAAAAGTGCATTTATCTCATTTAAATATTTAGATGAGGATGTGGCAAACGTTTGCTTTTCTCTTTCGGTCAGCTAAAATGCCCGCTTTGCTACCACGGGATTGTTTTCGATGTCTGTTTCCACCCTCGAGTCAGAAAATGCGCAACCGGTTGCGCAGACTCAAAACAGCGAACTGATTTACCGTCTTGAAGATCGTCCGCCGCTTCCTCAAACCCTGTTTGCCGCCTGTCAGCATCTGCTGGCGATGTTCGTTGCGGTGATCACGCCAGCGCTATTAATCTGCCAGGCGCTGGGTTTACCGGCACAAGACACGCAACACATTATTAGTATGTCGCTGTTTGCCTCCGGTGTGGCATCGATTATTCAAATTAAGGCCTGGGGTCCGGTTGGCTCCGGGCTGTTGTCTATTCAGGGCACCAGCTTCAACTTTGTTGCC > NC_000913/3828674‑3829271 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |