Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,620,224 | 0 | C | G | 5.0% | 461.6 / 11.0 | 132 | intergenic (+17/+14) | marB/eamA | periplasmic mar operon regulator/cysteine and O‑acetyl‑L‑serine efflux system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (60/65); new base G (4/3); total (64/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TTTTTACATCCATTAAATCATTACAACAGCTAGTTGAAAACGTGACAACGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGACAAGATGGTGGTCATATCGATAGTAA > NC_000913/1619925‑1620518 | tttttACATCCATTAAATCATTACAACAGCTAGTTGAAAACGTGACAACGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAc > 1:1057325/1‑300 (MQ=255) cATCCATTAAATCATTACAACAGCTAGTTGAAAACGTGACAACGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCg > 1:316466/1‑300 (MQ=255) cATTAAATCATTACAACAGCTAGTTGAAAACGTGACAACGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCATCTGCGCTTATGCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGc < 1:712894/300‑1 (MQ=255) aaaTCATTACAACAGCTAGTTGAAAACGTGACAACGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCttat > 1:199811/1‑300 (MQ=255) 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ccGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCCCCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGACACGTACCCCAGATCACATAACCAACAATTGTCGCCACAACCGCCAGCAACATCAGCACAAAGAAggtggt > 2:854862/1‑285 (MQ=255) gACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGACAAGATGGTGGTCat > 2:327385/1‑286 (MQ=255) aaCATCTCGGGGCTTATTAACGTCCCACCTTGACCGCTTTACTCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGACAAGATGGTGGTCa < 2:658180/284‑1 (MQ=255) | TTTTTACATCCATTAAATCATTACAACAGCTAGTTGAAAACGTGACAACGTCACTGAGGCAATCATGAAACCACTTTCATCCGCAATAGCAGCTGCGCTTATTCTCTTTTCCGCGCAGGGCGTTGCGGAACAAACCACGCAGCCAGTTGTTACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGCCAGTCCTACTACGGGCACCAGTAACGATAACGGTGCAACCCGCCAGGTTTCATAGCGTCCCAGTAACGTCCCCCAGATCCCATAACCAACAATTGTCGCCACAAACGCCAGATACATCAGAGACAAGATGGTGGTCATATCGATAGTAA > NC_000913/1619925‑1620518 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |