| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,666,468 | 0 | A | T | 7.7% | 361.5 / 17.1 | 118 | Q385L (CAG→CTG) | clcB | H(+)/Cl(‑) exchange transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/60); new base T (4/5); total (53/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTCCTTTGTAAACTGTGTGCCGTGCTGGCGAGTAGCGGTTCCGGCGCACCCGGTGGGGTCTTTACACCGACGCTATTTATCGGTCTTGCCATTGGCATGTTGTATGGTCGTAGCCTGGGATTATGGTTCCCTGATGGCGAAGAAATTACACTTTTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGAGCTGTTAGCAGTGCA > NC_000913/1666171‑1666767 | aaTCCTTTTTAACCGCCCCTCCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTCCTTTGTAAACTGTGTGCCGTGCTGGCGAGTAGCGGTTCCGGCGCACCCGGTGGGGTCTTTACACCGACGCTATTTATCGGTCTTGCCATTGGCATGTTGTATGGTCGTAGCCTGGGATTATGGTTCCCTGATGGCGAAGAAATTACACTTTTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGc < 1:279109/300‑1 (MQ=255) 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tCAGCTACTCCCCGGTTTATTGAGTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTg < 2:382035/286‑1 (MQ=255) aGCTACTCCCCGGTTTATTGCTTGCCTGCGTAACTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGAGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGAGCTGTTAGCAGTGCa > 1:438862/1‑300 (MQ=255) aGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGAGCTGTTAGCAGTGCa > 1:1358223/1‑300 (MQ=255) | AATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTCCTTTGTAAACTGTGTGCCGTGCTGGCGAGTAGCGGTTCCGGCGCACCCGGTGGGGTCTTTACACCGACGCTATTTATCGGTCTTGCCATTGGCATGTTGTATGGTCGTAGCCTGGGATTATGGTTCCCTGATGGCGAAGAAATTACACTTTTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGAGCTGTTAGCAGTGCA > NC_000913/1666171‑1666767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |