| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,075,135 | T→G | 100% | I156S (ATC→AGC) | yihW → | putative transcriptional regulator for sulphoquinovose utilization |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,075,135 | 0 | T | G | 100.0% | 357.5 / ‑6.7 | 100 | I156S (ATC→AGC) | yihW | putative transcriptional regulator for sulphoquinovose utilization |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (51/47); total (52/48) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CGGGCTTCCAGCGTCGTTAATACGGCGTTCGAGCAGCGTGAGGTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGATCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGAGTTTGATGTAAACGAAGCTAACGTGGTGAAAACGATGATGGCGCACGCGAGAAATATTCTGCTGGTCGCCGATCACACTAAGTATCATGCTTCGGCGGCGGTTGAAATTGGTAACGTGGCACAGGTCACTGCGCTCTTTACCGACGAGCTGCCGCCCGCTGCGCTAAAATCACGCTTACAAGACAGCCAAATTGAAA > NC_000913/4074855‑4075428 | cGGGCTTCCAGCGTCGTTAATACGGCGTTCGAGCAGCGTGAGGTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAgcggcg < 1:1027814/300‑1 (MQ=255)cGGGCTTCCAGCGTCGTTAATACGGCGTTCGAGCAGCGTGAGGTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAgcggcg < 1:286230/300‑1 (MQ=255) cTTCCAGCGTCGTTAATACGGCGTTCGAGCAGCGTGAGGTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTGGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGAGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTGGCGCTCTAATAATAGCGGGGGAATTGGccc > 2:1065223/1‑286 (MQ=255) cAGCGTCGTTAATACGGCGTTCGAGCAGCGTGAGGTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCa > 2:950299/1‑286 (MQ=255) 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gTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGc > 1:791118/1‑300 (MQ=255) cGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTg > 1:196907/1‑300 (MQ=255) aaaCCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTTACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTgggg > 1:349377/1‑300 (MQ=255) 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cGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATgg < 2:1162966/286‑1 (MQ=255) cTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGAGTTTGATGt < 1:1239642/297‑1 (MQ=255) atatTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGa > 2:960475/1‑286 (MQ=255) 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cATAATAGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGAGTTTGATGTAAACGAAGCTAACGTGGTGAAAACGATGATGGCGCACGCGAGAAATATTCTGCTGGTCGCCGATCACACTAAGTATCATGCTTCGGCGGCGGTTGAAATTGGTAACGTGGCACAGGTCACTGCGCTCTTTACCGACGAGCTGCCGCCCGCTGCGCTAAAATCACGCt > 2:658578/1‑286 (MQ=255) aGCGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGAGTTTGATGTAAACGAAGCTAACGTGGTGAAAACGATGATGGCGCACGCGAGAAATATTCTGCTGGTCGCCGATCACACTAAGTATCATGCTTCGGCGGCGGTTGAAATTGGTAACGTGGCACAGGTCACTGCGCTCTTTACCGACGAGCTGCCGCCCGCTGCGCTAAAATCACGCTTACaa < 2:1075310/285‑1 (MQ=255) cGGGAGCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGAGTTTGATGTAAACGAAGCTAACGTGGTGAAAACGATGATGGCGCACGCGAGAAATATTCTGCTGGTCGCCGATCACACTAAGTATCATGCTTCGGCGGCGGTTGAAATTGGTAACGTGGCACAGGTCACTGCGCTCTTTACCGACGAGCTGCCGCCCGCTGCGCTAAAATCACGCTTACAAGACGGCCAAATTGaaa > 1:459830/1‑299 (MQ=255) | CGGGCTTCCAGCGTCGTTAATACGGCGTTCGAGCAGCGTGAGGTTTCGCAAACCGAGGAAAAAAAAGCGATTGCCGAAGCGGTGGCAGACTATATTCCTGATGGTTCAACAATATTTATCACCATTGGTACGACTGTTGAGCATGTTGCCCGGGCGTTACTTAACCATAATCATTTGCGGATAATCACCAACAGCCTGCGTGTGGCGCATATTCTTTACCACAACCCGCGCTTTGAAGTGATGGTGCCCGGCGGTACGTTGCGCTCTCATAATAGCGGGATCATTGGCCCTTCAGCGGCGTCCTTTGTGGCTGATTTTCGTGCTGATTATCTGGTAACAAGCGTTGGGGCGATTGAGAGCGATGGCGCGTTGATGGAGTTTGATGTAAACGAAGCTAACGTGGTGAAAACGATGATGGCGCACGCGAGAAATATTCTGCTGGTCGCCGATCACACTAAGTATCATGCTTCGGCGGCGGTTGAAATTGGTAACGTGGCACAGGTCACTGCGCTCTTTACCGACGAGCTGCCGCCCGCTGCGCTAAAATCACGCTTACAAGACAGCCAAATTGAAA > NC_000913/4074855‑4075428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |