| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,416,824 | Δ1 bp | coding (2078/2145 nt) | pta → | phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,416,823 | 0 | G | . | 97.3% | 319.0 / ‑1.8 | 75 | coding (2077/2145 nt) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (31/42); minor base T (0/2); total (31/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
AGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAA > NC_000913/2416552‑2417104 | aGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTTACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGat < 1:206243/288‑1 (MQ=255)aGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGata < 1:715129/289‑1 (MQ=255)aGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCGGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAAGGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGat < 1:359480/288‑1 (MQ=255)aGAAAAAAGTCGCGAAGCAACTCGGCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGata < 1:214281/289‑1 (MQ=255) aaaaaGGTCGCGAACCAACTCGTCTGGCGCAGGAACAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAAGCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATc < 1:215790/289‑1 (MQ=255) aaaGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACTTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCGTCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGt < 1:3210/289‑1 (MQ=255) gcaaGGCAAAACTGCCTGGCCTGAGGTTGGACGGTCCGCGGCAGGAGGAAG‑TGCGGGTAATGGGTGACGTGTCGAAATCCCAAGCGCCGAACGCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCTGGTTCATCTTCCCGGAGCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTGCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGAt < 2:226442/285‑1 (MQ=255) cgcAGGGAAAACGTCCTGACCTGCTGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGATGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGAt < 1:544788/288‑1 (MQ=255) cgcAGGAACAACTTCCTGACCTGACGAGCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGAt < 1:202887/288‑1 (MQ=255) aGGAAAAACGGCCGGCCCTGGTGATTGACGGGCCGCGGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTGGCGAACTCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGGCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCa < 2:640514/288‑1 (MQ=255) gAAAACGGTCCGGACCGGATGGTCGCCGGTCCGCTGCAGTAGTACGGTGC‑GGTAACGGCTGCCGTTGCGCAATCCAATGCGCCGAACGCTCCGGTGGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGGTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTc < 2:317880/289‑1 (MQ=255) gAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAg > 1:450656/1‑287 (MQ=255) gAAAAACGTCCGGACCGGATGATCGACGGTCGGCGGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTGGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCGGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTgcgca < 2:628915/242‑5 (MQ=255) aaaaCGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTg < 1:559153/289‑1 (MQ=255) aCGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCAGATCTCCATCGGGCCGCTGCTGCAGGGTATGCGCAATCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑TCGCACTGGTTGCCGCTACCGTCACCCCCATCCCCCTTACTTCGATTCATCCTGcc > 2:806184/1‑287 (MQ=255) gTCCTGACCGGTTGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGGTGACGTTGCGCAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcag < 1:181530/289‑1 (MQ=255) ctgacctgaTGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCTACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGAAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACg > 1:628915/1‑242 (MQ=255) ctgacctgaTGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcagcag < 1:249736/289‑1 (MQ=255) ctgacctgaTGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcagca > 1:643573/1‑288 (MQ=255) atgatCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCCGCCGTAAt > 1:159649/1‑288 (MQ=255) tgatCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAAtc < 1:686961/288‑1 (MQ=255) gTCCGCTGCAGTACGACGCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGGTAACGCCCTGTCCCGT‑GCCCCCTGGTTGACGATATAGTCTACCCCATCCCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACCGCAGCAGTATACTCCtcctca > 2:815418/1‑288 (MQ=255) cgacgCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTgcg < 2:450656/289‑1 (MQ=255) cgacgCTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCAGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTgcg < 1:806184/289‑1 (MQ=255) acgCGGC‑GGTAATGGCTGACTTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCTGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCt < 1:428876/289‑1 (MQ=255) cTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTgcgc > 2:371358/1‑192 (MQ=255) cTGC‑GGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTgcgc < 1:371358/195‑4 (MQ=255) aCGTGGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGa < 1:698426/289‑1 (MQ=255) aGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTgcg > 1:650011/1‑253 (MQ=255) aGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTgcg < 2:650011/253‑1 (MQ=255) cGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTg > 2:581522/1‑209 (MQ=255) cGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTg < 1:581522/209‑1 (MQ=255) cgccGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAAAACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTAtt < 1:6779/287‑1 (MQ=255) cGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTg < 2:308470/237‑1 (MQ=255) cGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTg > 1:308470/1‑237 (MQ=255) acagtgcggcTACCGTTGTCGACTTCCCGTATCTGAACACCGTGAACACAA‑CCGAAAAAGCGGTGCAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCGGCAGTGTAGGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAAt < 2:103594/280‑1 (MQ=255) ggTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCAcag > 2:478361/1‑197 (MQ=255) 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tCTTCCCAGATCTGACCACCAGTAACACCA‑CCTACAAAGCGCTACAGCGTTCCGCCGACCCGTTCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCTCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCTTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTa < 1:320550/289‑1 (MQ=255) cTTACCGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGACTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAAGCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCAGTATTTCCGGTGTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTAAttct > 1:533144/1‑287 (MQ=255) cccGGATCTGAACACCGGTAACACCA‑CCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCTCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATCCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGACCCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGTATTAATCCTGTCtctttttc > 1:566208/1‑280 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |