Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,416,823 | 0 | G | . | 46.1% | 302.6 / inf | 165 | coding (2077/2145 nt) | pta | phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/42); new base . (44/32); total (91/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.34e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAACCAACAAGAAGATG > NC_000913/2416524‑2417118 | aCTTCGGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTgcgca < 1:1470698/299‑5 (MQ=255) ctgcTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCAc < 1:331877/297‑1 (MQ=255) aGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACATCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATCCTGCAGGTTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCACGTGGCGCTCTGGTTGa > 2:125735/1‑285 (MQ=255) gAAAAAGTTCGCGACGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGGTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACg < 2:1323621/285‑1 (MQ=255) 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gTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGc < 2:45866/284‑1 (MQ=255) tAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAAcc < 1:656786/300‑1 (MQ=255) aaCGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAACca < 1:1444257/300‑1 (MQ=255) aaCGACCTGTCCCGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGCTTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGCATTGCGCCATCCCACTTTGCCTACTTACCACTTTGTTTTGTTCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCa > 2:471792/1‑285 (MQ=255) cccGT‑GCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAACcaacctacagccg > 1:839901/1‑291 (MQ=255) cGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAAc > 2:441174/1‑286 (MQ=255) | CCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATCACTATTTCCGGTTTTTTATTCTCTTAATTTGCATTAATCCTTTCTGATTATCTTGCTTAACTGCGCTGCATCAATGAATTGCGCCATCCCACTTTGCATACTTACCACTTTGTTTTGTGCAAGGGAATATTTGCGCTATGTCCGCAATCACTGAATCCAAACCAACAAGAAGATG > NC_000913/2416524‑2417118 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |