| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 302,732 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑159/‑255) | paoA ← / → yagU | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit/DUF1440 family inner membrane acid resistance protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 302732 = | 0 (0.000) | 101 (0.770) | 78/548 | 0.2 | 100% | intergenic (‑159/‑259) | paoA/yagU | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit/DUF1440 family inner membrane acid resistance protein |
| ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 302736 | 0 (0.000) | 151 (1.150) | 88/548 | 0.1 | 100% | intergenic (‑163/‑255) | paoA/yagU | PaoABC aldehyde oxidoreductase, 2Fe‑2S subunit/DUF1440 family inner membrane acid resistance protein |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/302454‑302736‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAA > NC_000913/1467910‑1468196 CACTGCTGTCGCCGCTGTTGCCGCGCTCACTTTAATCCGATCGCGACTGGTCAAACTTAAATCCTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATT < 2:483349/289‑1 CGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATTTGCC < 1:349699/288‑1 agagggaggggACTTAAAGCAGATGGCGACGGGTCAAACTTAAAGCGGGAGGCTAGTGCTTCCAAACCCGATTATCTTCGGGGTATTGGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCATCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTGAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 2:137279/277‑1 TTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTAACTTCGGGGTATTCGCCGTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTGTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCA < 1:300155/288‑1 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GCGCTCACGTTAATCAGAACGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCGTCCCAACCCGATGATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 2:229063/288‑1 CTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT > 1:874046/1‑289 CTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGATTGGATTTGCCCC > 1:636433/1‑270 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ATAAATTCATGTTCTCCGGGATTTTGATTTGATTTGCCCCTATAGTTCCCGACCTCTGTTATCACTTAACCCATTCCAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTC < 2:984805/289‑1 GCCGGGATGTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGCTGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCCACGCCGTGTTCTTCGGTTCAGGTCCCAc > 2:726242/1‑288 gtTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTCAACCCCTTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATACCCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGG < 2:906582/287‑1 TGTTGATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACACGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTCGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGG < 1:43362/289‑1 ATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGCACTCCGCCCCCCCGTGTTCTTCGGTTCCTGTCCCACCCTCCGGGCGc > 2:1028661/1‑287 ATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCAGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACTCTTTCTCGTTTTCACCAGGCTCTTC‑TCTCTTCCTTTCCGCCCCGTCCTCACCACCGCCGTTTTCTTCGGTTCACGCTCCACCATCCGGGTGAA > 2:215387/1‑289 CACGGCGGTCGCCGCTGTTGCGGCGCTCACTTTAATCAGATCGCGACGGGTCAAACTTAAATCGTGCGGCTCGTGCTTCCCAACCCGATTATCTTCGGGGTATTCGCCTTGGTTGCTCATACCAGGCCTCCGGTATTCTAAAGGGGAAAATAAGAGTGCGTTGCGAGAGTGCTGATGCTTTTTTAAACGTTAAGCATAGTCGGCGACAGCAGGAGGATTATTCTTAAAACGCGAATGCAGCTATGAGCCCGGCTAATAAATTCATGTTCGCCGGGATGTTGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/302454‑302736‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT‑TATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCT‑GCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCGAA > NC_000913/1467910‑1468196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |