| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,416,674 | C→A | S643Y (TCT→TAT) | pta → | phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,416,674 | 0 | C | A | 98.0% | 517.7 / NA | 149 | S643Y (TCT→TAT) | pta | phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); major base A (72/71); minor base T (1/2); total (76/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
ACGGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTCTCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTCCCGGATCTGAACACCGGTAACACCACCTACAAAGCGGTACAGCGTTCTGCCGACCTGATCTCCATCGGGCCGATGCTGCAGGGTATGCGCAAGCCGGTTAACGACCTGTCCCGTGGCGCACTGGTTGACGATATCGTCTACACCATCGCGCTGACTGCGATTCAGTCTGCACAGCAGCAGTAATCTCGTCATCATCCGCAGCTTTGCGCTGCGGATATCTGAACCGGAAATAATC > NC_000913/2416401‑2416943 | acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGACGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCGGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGGGCCGAACCAACCGGGTGCAGGTc > 2:5721/1‑288 (MQ=255)acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCACCTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGAACGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCCAAATCCAAACCGCCGACCTACCCGGTCTCAGGTc > 2:563251/1‑288 (MQ=255)acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGGTc > 1:229266/1‑288 (MQ=255)acgGTGACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTACCCGGTTGCAGGTc > 1:1214778/1‑288 (MQ=255)acgGTGACTGTGCGAACAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCTGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTTTGCTCTCCTACTCCACCGGTAGTTCTGGTGCAGGTAGCGAAGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGACTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATAGACGGTCCGCTTCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGGTCAGCAATCCAAAGCGCCGAACTAACCGGTCTCAggcc > 2:1221590/1‑286 (MQ=255) gACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCCGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGGTCGCGCTa < 1:620185/289‑1 (MQ=255) gACTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGGTCGCGCTa < 1:144762/289‑1 (MQ=255) aCTGTGCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCCGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAACAACGTCCTGACCTCATGATCGACGGTCCGCTGCCGTACGACGCTGCGCTACTGGCTGACGTTGCGACATCCCACACCCCGAACTATCCGTTTGCAGTTCGCGCTa > 1:636584/1‑288 (MQ=255) tgCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATTGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTAATCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCCCCGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTACGCTGCAGTACGCCGCTGCGGTAATGCCTGACGTCGAGAAATCCAAAGCGCCGACGTCGCCGGTTGCCGGTCGCGCTCCCgtt > 2:508774/1‑288 (MQ=255) tgCGATCAACCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGTGCGCGCTACCggg > 2:1081517/1‑287 (MQ=255) 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aCCCGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGGTCGCGCTCCCGTGTTCAGCt > 1:452678/1‑288 (MQ=255) ccggccccGACCGCTGATCAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGTTTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTcc < 2:229266/283‑1 (MQ=255) ccGGATCCGACCGCTGAACAGCTGGCAGAAATCGCGATTCAGTCCGCTGATTCCGCTGCGGCCTTCGGTATCGAACCGCGCGTTGCTATGCTCTCCTACTCCACCGGTACTTCTGGTGCAGGTAGCGACGTAGAAAAAGTTCGCGAAGCAACTCGTCTGGCGCAGGAAAAACGTCCTGACCTGATGATCGACGGTCCGCTGCAGTACGACGCTGCGGTAATGGCTGACGTTGCGAAATCCAAAGCGCCGAACTATCCGGTTGCAGGTCGCGCTACCGTGTTCATCTTcc < 1:1241352/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |