Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,666,470 | 0 | C | A | 5.0% | 568.2 / 14.9 | 165 | L386I (CTA→ATA) | clcB | H(+)/Cl(‑) exchange transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (75/81); new base A (5/4); total (80/85) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.48e-01 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTCCTTTGTAAACTGTGTGCCGTGCTGGCGAGTAGCGGTTCCGGCGCACCCGGTGGGGTCTTTACACCGACGCTATTTATCGGTCTTGCCATTGGCATGTTGTATGGTCGTAGCCTGGGATTATGGTTCCCTGATGGCGAAGAAATTACACTTTTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGAGCTGTTAGCAGT > NC_000913/1666173‑1666764 | tCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTCCTTTGTAAACTGTGTGCCGTGCTGGCGAGTAGCGGTTCCGGCGCACCCGGTGGGGTCTTTACACCGACGCTATTTATCGGTCTTGCCATTGGCATGTTGTATGGTCGTAGCCTGGGATTATGGTTCCCTGATGGCGAAGAAATTACACTTTTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGTTATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGcag > 1:101763/1‑298 (MQ=255) 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aCCGGGGAGTAGCTGATACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGa > 1:976190/1‑298 (MQ=255) ccGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCcgtcgt > 2:421759/1‑283 (MQ=255) aTCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGACGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCATGAGCTGTTAGCAGt > 1:258646/1‑300 (MQ=255) | TCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTCCTTTGTAAACTGTGTGCCGTGCTGGCGAGTAGCGGTTCCGGCGCACCCGGTGGGGTCTTTACACCGACGCTATTTATCGGTCTTGCCATTGGCATGTTGTATGGTCGTAGCCTGGGATTATGGTTCCCTGATGGCGAAGAAATTACACTTTTACTCGGATTGACCGGGATGGCGACACTGTTGGCGGCGACCACGCACGCGCCGATTATGTCGACGTTGATGATATGTGAAATGACCGGGGAGTATCAGCTACTCCCCGGTTTATTGATTGCCTGCGTAATTGCGTCGGTAATTTCGCGGACGTTACACCGTGACTCTATCTACCGCCAGCACACTGCGCAGCATAGCTAAGCGGATGTATTGCCCCAGTTCACGCTGTTCGGCGCGCGGCAGATAAGGCAGTTCACCAATGAGCGGTGCCGGAAGTTTTTTACCCAGCACATCAATGATTTCCGCATAATGCGCCAGTCCTGGGTTGATTCGGTTAGCCACCCAGCCAATGAGCGGCAGCCCGTCGTTGGCGATCGCCTGAGCTGTTAGCAGT > NC_000913/1666173‑1666764 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |