| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2716029 | 155 (1.020) | 2 (0.010) | 3/540 | NT | 1.3% | intergenic (+19/+37) | eamB/grcA | cysteine and O‑acetylserine exporter/autonomous glycyl radical cofactor |
| ? | NC_000913 | = 2716033 | 153 (1.050) | intergenic (+23/+33) | eamB/grcA | cysteine and O‑acetylserine exporter/autonomous glycyl radical cofactor | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
ATCAGCTTTTGGGCCAGCTTTGCTTTGCAGTTTGTGAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCA > NC_000913/2715735‑2716327 | aTCAGCTTTTGGGCCAGCTTTGCTTTGCAGTTTGTGAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTTTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAGAAAAAGCGGAAGAGGTCGCc > 1:1424955‑M2/1‑299 (MQ=255) ttttGGGCCAGCTTTGTTTTGCAGGTTGTGAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCcctc > 1:313965‑M2/1‑293 (MQ=255) cAGCTTTGCTTTGCAGTTTGTGAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAg < 1:402268/299‑1 (MQ=255) cAGCTTTGCTTTGCAGTTTGTGAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGt < 1:6088/300‑1 (MQ=255) 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tcttccgatctaaaaTCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGcc < 1:1361353/289‑1 (MQ=255) gAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTACCTTGc > 2:1077960/1‑286 (MQ=255) gAACGTCAAAATCATGTTGTACGGGTGTACGGAGCTGTGGACGTTTGTTCTGGCGTAAACACGGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGAGATGATTGTGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCAGCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGc < 2:1229174/286‑1 (MQ=255) 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gCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCaagatcggaaga > 2:1124112/1‑276 (MQ=255) agagGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACGCGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACt < 1:1000310/300‑1 (MQ=255) gTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCa > 1:827306/1‑299 (MQ=255) | ATCAGCTTTTGGGCCAGCTTTGCTTTGCAGTTTGTGAACGTCAAAATCATTTTGTACGGTGTTACGGCACTGTCGACGTTTGTTCTGCCGCAAACACAGGCGTTAAGCTGGGTAGTTGGCGTCAGCGTTTTGCTGGCGATGATTGGGACGTTTGGCAATGTGTGCTGGGCGCTGGCGGGGCATCTGTTTCAGCGATTGTTTCGCCAGTATGGTCGCCAGTTAAATATCGTGCTTGCCCTGTTGCTGGTCTATTGCGCGGTACGCATTTTCTATTAACGAAAAAAAGCGGAAGAGGTCGCCCTCTTCCGCTTAGTAACTTGCTACTTAAGCCTTACAGGCTTTCAGTAAAGGTACGAGCGATAACGTCGCGCTGCTGTTCCGGAGTCAGAGAGTTAAAGCGAACTGCATAACCGGATACACGGATGGTCAGCTGCGGATATTTTTCCGGATGCTTAACTGCATCTTCCAGAGTTTCGCGACGCAGAACGTTAACGTTCAGGTGTTGACCACCTTCAACGCGAACTTCTGGTTTCACTTCTACTGGAACTTCACGGTATTCAATGTCACCCAGTTTGCTTACTGCAACCACTTCA > NC_000913/2715735‑2716327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |