| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571858 | 1 = | 0 (0.000) | 142 (1.160) | 82/170 | NT | 100% | intergenic (–/‑11) | –/pSAS01 | –/putative ABC transporter ATP binding protein |
| ? | BX571858 | = 20651 | 0 (0.000) | intergenic (+5/–) | pSAS24/– | putative exported protein/– | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
GATTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BX571858/97‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑TTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGGATC < BX571858/20651‑20557 GATTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACC > 2:2527417/1‑97 ATTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCT < 2:1551030/97‑1 TTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTC > 2:1371495/1‑97 TTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTC > 1:1726406/1‑97 TTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCAT < 1:1796537/97‑1 TTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCAT > 2:1202645/1‑97 CCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTT > 1:711918/1‑97 TTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAA > 2:1670925/1‑97 AAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCT < 2:56803/97‑1 AAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCT > 2:2353552/1‑97 AATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTA < 2:1232917/97‑1 ATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAG > 1:1691991/1‑97 TTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGG < 1:2059997/97‑1 TAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGA > 1:58634/1‑97 AAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAAT < 1:650947/97‑1 AGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATA < 2:2393903/97‑1 GTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAACGCTAGGAATAT > 2:1288658/1‑97 TTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATc < 1:766813/97‑2 TACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATct > 1:2535313/1‑95 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT < 1:1823445/97‑1 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT < 2:1228051/97‑1 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT > 2:1650313/1‑97 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT < 2:1170898/97‑1 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT > 2:2015785/1‑97 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT > 2:926678/1‑97 CATCCCTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT < 2:2603641/97‑1 ATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTTt < 2:371181/97‑2 TCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTTtg > 1:1930684/1‑95 CCGTCTTAAATGTGTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGT < 2:423438/97‑1 GTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAA < 2:1086593/97‑1 TCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAAT < 2:2173561/97‑1 TAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGT < 1:391712/97‑1 AAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTA < 2:2331468/97‑1 AAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTA < 2:1959996/97‑1 AAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTAT > 1:1367012/1‑97 ATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTC < 1:202294/97‑1 ATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTC < 2:2033993/97‑1 ATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTC < 1:822890/97‑1 ATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTC > 1:2030806/1‑97 TGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCT < 2:2258975/97‑1 TGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCT < 1:1749923/97‑1 TGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCT > 1:188383/1‑97 TGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCT < 1:2509677/97‑1 TTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTAT > 1:1205564/1‑97 TTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTAT > 1:675642/1‑97 TTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGATAGGAATATATTTTGTAATGTATTCTAT > 2:301236/1‑97 TTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATC > 2:2244357/1‑97 TTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCG > 1:1850558/1‑97 TTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCG > 1:1603500/1‑97 TTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGA > 1:1746197/1‑97 TTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGA < 2:1799236/97‑1 TATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAA > 2:658223/1‑97 TATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAA > 1:156149/1‑97 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TTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATA > 1:455823/1‑97 TTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATACTATCGAACGCACATA > 2:63387/1‑97 TTTTTGACACAAACATTTTCAAGTTTGATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATA < 2:1406247/97‑1 TTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATT > 1:2180185/1‑97 TTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTT < 2:237100/97‑1 TTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTT < 2:372162/97‑1 TTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTT < 1:1329720/97‑1 TTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTC < 1:1631949/97‑1 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BX571858/97‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑TTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGGATC < BX571858/20651‑20557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |