| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 1,136,694 | C→T | 10.2% | A40T (GCA→ACA) | SAS1063 ← | iron‑regulated heme‑iron binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 1,136,694 | 0 | C | T | 10.2% | 373.1 / 29.5 | 108 | A40T (GCA→ACA) | SAS1063 | iron‑regulated heme‑iron binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/78); new base T (3/8); total (22/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTCTGGAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGATTTAAA > BX571857/1136599‑1136790 | ttCTGGAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAgctgctgct > 1:2384686/1‑97 (MQ=255) cTGGAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTtg < 2:1130313/97‑1 (MQ=255) tGGGGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTGGCAACTGCTTCAGTTTTGGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTtgt < 2:1229456/97‑1 (MQ=255) tGGAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTtgt < 1:1869768/97‑1 (MQ=255) gAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGc > 2:2282565/1‑97 (MQ=255) gAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGc < 1:2229375/97‑1 (MQ=255) gAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGc > 2:1445725/1‑97 (MQ=255) aGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCt < 1:447865/97‑1 (MQ=255) gCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCtt > 1:324788/1‑97 (MQ=255) ttttCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGc < 2:404924/97‑1 (MQ=255) ttttAAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGTTTCCGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGc < 1:674014/97‑1 (MQ=255) ttCCGATGTTGTTGTTGGACGTGCAACTGCTTCACTTGTTGGTTGTGCTGGTGCATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCGTCGCCa < 2:1031752/97‑1 (MQ=255) tCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCAt > 1:2068632/1‑97 (MQ=255) aGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCAttt < 1:1034809/97‑1 (MQ=255) aGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCAttt < 1:2661101/97‑1 (MQ=255) gATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTg < 1:2640811/97‑1 (MQ=255) gATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTg < 1:60119/97‑1 (MQ=255) gATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTg < 1:60112/97‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGTTGGACTTGCAGCTGCTTCAGTTTTTTGTTGTGCTTCTGTTTTTGTACCACCTGTTTCTTCATCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGa < 2:1113672/97‑1 (MQ=255) tgttgttgtTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCTTCGCCATTTGAc > 1:1587922/1‑97 (MQ=255) gttgttgttGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACa < 1:1225005/97‑1 (MQ=255) gttgttgttGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACa > 1:2551532/1‑97 (MQ=255) gttgttgttGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACa < 1:2372401/97‑1 (MQ=255) ttgttgttgGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACAt < 1:2584764/97‑1 (MQ=255) tgttgttgGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACAtt < 1:1992159/97‑1 (MQ=255) tgttgttgGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACAtt < 2:293085/97‑1 (MQ=255) gttgctgGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATta < 2:1052595/97‑1 (MQ=255) tgttgGACTTGCTACTGCTTCAGTGTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTCCCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATtaat < 2:2150389/97‑1 (MQ=255) tgttgGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATtaat < 2:2656369/97‑1 (MQ=255) gttgGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATtaata > 1:2035919/1‑97 (MQ=255) ggACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCTTCGCCATTTGACATtaataata > 2:1323227/1‑97 (MQ=255) cTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATaaaa < 2:1308812/97‑1 (MQ=255) ttGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAg < 2:2064002/97‑1 (MQ=255) tGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAgt < 2:1533268/97‑1 (MQ=255) tGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAgt > 1:2402588/1‑97 (MQ=255) gCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAgtg < 1:2439725/97‑1 (MQ=255) gCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAgtg < 2:2409657/97‑1 (MQ=255) gCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTGCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAgtg < 2:2159532/97‑1 (MQ=255) cTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACt < 1:2271479/97‑1 (MQ=255) tGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTa > 1:2469367/1‑97 (MQ=255) tGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTa < 1:1581600/97‑1 (MQ=255) tGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTa < 2:1875755/97‑1 (MQ=255) gCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTaa > 1:1512559/1‑97 (MQ=255) ttCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAAtt < 1:13182/97‑1 (MQ=255) tCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTg > 1:661239/1‑97 (MQ=255) cAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGc < 2:2129314/97‑1 (MQ=255) cAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGc < 1:492695/97‑1 (MQ=255) gTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTa < 2:1461701/97‑1 (MQ=255) gTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTa < 2:899704/97‑1 (MQ=255) ttttGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACa < 2:1710967/97‑1 (MQ=255) tttGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAg < 1:82646/97‑1 (MQ=255) tttGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAg < 1:156690/97‑1 (MQ=255) ggTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATg > 2:2481687/1‑97 (MQ=255) gTTGTGCTTCTGTATTTGTACCTCCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTAGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGc < 2:2158203/97‑1 (MQ=255) gTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGc < 1:216801/97‑1 (MQ=255) ttGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCa < 2:2059807/97‑1 (MQ=255) tgCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACg < 1:1791255/97‑1 (MQ=255) cTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGcc < 1:985499/97‑1 (MQ=255) cTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGcc < 2:469010/97‑1 (MQ=255) ttCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGGCATTAATCATATTAGGGTACTACTCGCTACAGATGCCACGCCt > 2:1363015/1‑97 (MQ=255) ttCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCGTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCt < 2:1247285/97‑1 (MQ=255) tGTATTTGTACCGCCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGt < 1:127636/97‑1 (MQ=255) tGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGt < 1:2337485/97‑1 (MQ=255) tGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGt < 2:2081840/97‑1 (MQ=255) tGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGt < 2:2554499/97‑1 (MQ=255) tGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGt < 2:366881/97‑1 (MQ=255) gTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGtg < 1:2354794/97‑1 (MQ=255) gTATTTGGCCCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGtg < 2:2051367/97‑1 (MQ=255) aTTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGtgat < 1:1383459/97‑1 (MQ=255) aTTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGtgat < 1:792754/97‑1 (MQ=255) tttGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGtgatg < 2:453211/97‑1 (MQ=255) tGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTCGTGATGAc > 2:806015/1‑97 (MQ=255) tGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGAc > 2:1994559/1‑97 (MQ=255) gTACCACCTGTTTCTGCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGGCGTTAATAATACAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACt < 2:1972723/97‑1 (MQ=255) tgccaccGGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGGCATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACtt < 2:1967825/95‑1 (MQ=255) tACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACtt < 1:77073/97‑1 (MQ=255) tACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACtt < 2:1715209/97‑1 (MQ=255) caccTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCt < 1:1162598/97‑1 (MQ=255) caccTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCt < 1:2476718/97‑1 (MQ=255) caccTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCt < 2:1368414/97‑1 (MQ=255) gccggTTTCTGCCGCTGCTGCTTGTGCTTCGCGAGTTGAGATTAATTGTAAAAGTGTACTAATGGCTACAGATGCAGCGCCTAGTGATGACTTTCTa < 2:1317992/93‑1 (MQ=255) accTGTTTCTTCAGCTGCTGTTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTa < 2:1137136/97‑1 (MQ=255) accTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTa < 2:1564566/97‑1 (MQ=255) accTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTa < 1:203499/97‑1 (MQ=255) accTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTa < 1:2131476/97‑1 (MQ=255) acatGTTTCTTCCGCTGCTGCTTGCCCTTCGCCAATTGTCAATAACAATTAAAGTGTACTAATTCCGACAGTTGCATCGCCTTGTGTTGACTTTCTa < 2:1767109/94‑1 (MQ=255) gTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTg < 1:1371298/97‑1 (MQ=255) tcttcAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAAt < 1:1943101/97‑1 (MQ=255) tcAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATaaa < 2:1455440/97‑1 (MQ=255) cAGCTGCTGTTTGGGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATaaaa < 2:1141900/97‑1 (MQ=255) aGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAAt < 1:1569031/97‑1 (MQ=255) gctgctgctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATg < 2:1865768/97‑1 (MQ=255) ctgctgttTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGa > 1:126301/1‑97 (MQ=255) ctgctgctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGa < 2:1248534/97‑1 (MQ=255) tgctgctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGAt > 1:426154/1‑97 (MQ=255) tgctgctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGAt > 1:746950/1‑97 (MQ=255) tgctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGATTTa > 1:849075/1‑97 (MQ=255) gctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGATTTaa < 1:1899966/97‑1 (MQ=255) ctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGATTTaaa > 1:141931/1‑97 (MQ=255) ctTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGATTTaaa > 1:163671/1‑97 (MQ=255) | TTCTGGAGCTTTTTCAGATGTTGTTGTTGGACTTGCAACTGCTTCAGTTTTTGGTTGTGCTTCTGTATTTGTACCACCTGTTTCTTCAGCTGCTGCTTGTGCTTCGCCATTTGACATTAATAATAAAAGTGTACTAATTGCTACAGATGCAACGCCTAGTGATGACTTTCTAATTGAATAAAATGATTTAAA > BX571857/1136599‑1136790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |