| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 1,868,342 | G→A | 100% | G129D (GGT→GAT) | SAS1720 → | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 1,868,342 | 0 | G | A | 100.0% | 782.8 / NA | 172 | G129D (GGT→GAT) | SAS1720 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (75/97); total (75/97) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
AGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGGTAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTAA > BX571857/1868250‑1868435 | gTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaag < 1:1017479/97‑1 (MQ=255) ttGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaaga > 1:1357748/1‑97 (MQ=255) tGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaa < 1:774253/97‑1 (MQ=255) tGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaa < 1:113272/97‑1 (MQ=255) gAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaag < 1:1403587/97‑1 (MQ=255) aaaCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGc < 1:1143827/97‑1 (MQ=255) aaCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCg > 2:2405768/1‑97 (MQ=255) aaCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCg > 2:2564233/1‑97 (MQ=255) aaCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGGACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCg < 2:2583557/97‑1 (MQ=255) aCTATGAAATCAGTTGGTACATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGt > 1:1933550/1‑97 (MQ=255) aTGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTaa < 1:2395851/97‑1 (MQ=255) tGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAAc > 1:152969/1‑97 (MQ=255) tGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAAc < 1:1741608/97‑1 (MQ=255) tGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAAc > 1:1111610/1‑97 (MQ=255) gAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACa < 1:809088/97‑1 (MQ=255) aaaTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACaa > 2:2394193/1‑97 (MQ=255) aaaTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACaa > 2:1171777/1‑97 (MQ=255) ctctgTTGGTCCATCTATCGCGCCGACAAATGCTAAAGGTACATGTGGCGTTGCAGATGTGACGGTCAAAACCAGAGAAAAAGAAGCGTGAACAAtt > 2:1263322/5‑97 (MQ=255) aTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAAtt < 2:568256/97‑1 (MQ=255) aGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGAt > 2:2527594/1‑97 (MQ=255) gTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATa < 1:1441218/97‑1 (MQ=255) gTTGGTCAAGCTGACGAGCCAACAAATGCTAAAGGTAGAGTCGTAGGCGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGAGAAAGACGCGTTCTCAATTGATa < 2:1140395/97‑1 (MQ=255) ttGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAg > 1:1244476/1‑97 (MQ=255) tGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGt > 2:1723503/1‑97 (MQ=255) tGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGt > 1:1082990/1‑97 (MQ=255) ggTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGtt > 1:302313/1‑97 (MQ=255) gTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTc < 2:1048195/97‑1 (MQ=255) tCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCa < 2:1734376/97‑1 (MQ=255) tCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCa < 2:184078/97‑1 (MQ=255) cATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAAt < 1:772013/97‑1 (MQ=255) aTCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATg > 1:2372763/1‑97 (MQ=255) aTCTATCGCGCCAACAAATGCGAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATg < 2:93607/97‑1 (MQ=255) cTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACGAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGtt > 1:1593909/1‑97 (MQ=255) tATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGttt < 2:843384/97‑1 (MQ=255) aTCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTa < 1:1571745/97‑1 (MQ=255) tCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaa < 1:1479076/97‑1 (MQ=255) cgcgCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaaa < 1:73618/97‑1 (MQ=255) cgcCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACt < 1:494819/97‑1 (MQ=255) gcCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTg < 1:1765786/97‑1 (MQ=255) ccAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGa < 1:1760611/97‑1 (MQ=255) ccAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGa < 1:620010/97‑1 (MQ=255) caacaaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGaa < 1:723354/97‑1 (MQ=255) aacaaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGaaa < 2:2640732/97‑1 (MQ=255) aacaaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGaaa > 1:347267/1‑97 (MQ=255) aaTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTg < 2:2112647/97‑1 (MQ=255) aaTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGAGTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTg < 2:1935838/97‑1 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt > 1:81032/1‑97 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGAGGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt < 2:351858/97‑1 (MQ=255) tGCCAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt > 2:951757/1‑97 (MQ=255) gCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTg > 2:1274036/1‑97 (MQ=255) cTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGa < 2:1566733/97‑1 (MQ=255) tAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGAt < 1:1695318/97‑1 (MQ=255) aaaGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATa > 2:2566266/1‑97 (MQ=255) aaGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaa < 1:636295/97‑1 (MQ=255) aaGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaa < 1:2201749/97‑1 (MQ=255) ggTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa < 1:984944/97‑1 (MQ=255) ggTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa > 2:1174696/1‑97 (MQ=255) gTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAAc > 2:1666996/1‑97 (MQ=255) tACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACa < 1:1278316/97‑1 (MQ=255) aCATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAt < 1:2553320/97‑1 (MQ=255) aCATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAt > 1:91156/1‑97 (MQ=255) aCATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAt > 1:2317838/1‑97 (MQ=255) aCATTGGTTGTTTCTGATCTGACAATTAAAAACAACGACCCAAAAGCCCTGATCATTGATAGCTCAAGGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAAGAt < 2:2660639/97‑1 (MQ=255) cATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGCTAGTTCAATGTGTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAtt > 2:652989/1‑97 (MQ=255) tttGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTg < 2:114532/97‑1 (MQ=255) gTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAg < 1:2043712/97‑1 (MQ=255) gTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAg < 1:880646/97‑1 (MQ=255) gTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAg < 1:1835932/97‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAg > 2:229762/1‑97 (MQ=255) gTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAg > 1:248619/1‑97 (MQ=255) tGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGat < 1:415389/97‑1 (MQ=255) gCTGATGTGCCGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCGGGTGATAAAACATTTGAAGCAGata > 2:1231487/1‑97 (MQ=255) gCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGata > 2:1757958/1‑97 (MQ=255) cTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataa < 1:18507/97‑1 (MQ=255) cTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataa < 2:815774/97‑1 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata > 2:4084/1‑97 (MQ=255) aTGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATAc > 1:1135451/1‑97 (MQ=255) aTGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGACAAAACATATGAAGCAGATAATAc > 2:776411/1‑97 (MQ=255) tgtgACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACa > 2:2175982/1‑97 (MQ=255) gtgACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAg > 1:1192926/1‑97 (MQ=255) gACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGc > 1:1372635/1‑97 (MQ=255) cGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTc < 2:1481868/97‑1 (MQ=255) cGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTc < 1:2356029/97‑1 (MQ=255) cGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTc < 2:824019/97‑1 (MQ=255) cGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTc < 1:323224/97‑1 (MQ=255) gATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCa < 1:1514411/97‑1 (MQ=255) gATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCa > 1:2625553/1‑97 (MQ=255) aTTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCaa < 2:2450281/97‑1 (MQ=255) aTTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCaa > 2:1362890/1‑97 (MQ=255) ttAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAAt < 1:1651781/97‑1 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg < 2:203095/97‑1 (MQ=255) aaaaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGt < 1:492162/97‑1 (MQ=255) aaaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTc < 2:560546/97‑1 (MQ=255) aaaCAAAAATGAAGGAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTGTAAACTGAAAGCTGGGGATAAAACATTTGAAGCAGAAAATACAGGCTCAAAGTCt < 2:1212074/97‑1 (MQ=255) aCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCCATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGGTCAATGTCTGc > 2:140397/1‑97 (MQ=255) aCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGc > 1:2119623/1‑97 (MQ=255) cAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCt > 1:2462405/1‑97 (MQ=255) aaaGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTa < 2:688352/97‑1 (MQ=255) aaaGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTa < 1:2399143/97‑1 (MQ=255) aaGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTaa > 2:732923/1‑97 (MQ=255) | AGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGGTAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTAA > BX571857/1868250‑1868435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |