| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 2,552,110 | T→C | 5.5% | E455E (GAA→GAG) | SAS2383 ← | putative cell wall‑anchored protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 2,552,110 | 0 | T | C | 5.5% | 527.4 / 14.9 | 145 | E455E (GAA→GAG) | SAS2383 | putative cell wall‑anchored protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/75); new base C (6/2); total (68/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TGTGATCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTTTATTA > BX571857/2552014‑2552206 | tgtgATCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCct < 1:1780552/97‑1 (MQ=33) gtgtTCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCctt < 2:1299340/97‑1 (MQ=21) gtgATCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCctt > 2:672502/1‑97 (MQ=34) tgATCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCcttc < 1:2046468/97‑1 (MQ=34) gATCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCcttct < 1:639717/97‑1 (MQ=34) aTCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCcttctt < 2:2212063/97‑1 (MQ=34) aTCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCcttctt > 1:241335/1‑97 (MQ=34) ctctTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGCGATTGTCTTACTTCCCGGTTGTCCTTCCTGt > 2:984262/1‑97 (MQ=255) ctctTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTGTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTTTCTTACTTCCCGGTTGTCCTTCTTGt > 2:355060/1‑97 (MQ=255) cttctGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGttt > 2:2501236/1‑97 (MQ=34) cttctGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGttt < 1:19230/97‑1 (MQ=33) cttctGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGttt < 1:585854/97‑1 (MQ=33) ttctGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTc < 1:970094/97‑1 (MQ=33) tctGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCa > 1:511777/1‑97 (MQ=34) gttggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTc > 2:593271/1‑97 (MQ=34) gttggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTc < 2:793217/97‑1 (MQ=33) ttggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCg < 1:1040246/97‑1 (MQ=33) ttggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCg > 1:831057/1‑97 (MQ=34) ggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCct < 2:796385/81‑1 (MQ=35) ggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGct < 2:1923164/97‑1 (MQ=34) ggttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGct < 1:198265/97‑1 (MQ=33) gttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGctc < 2:1148824/97‑1 (MQ=33) gttgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGctc > 2:2308980/1‑97 (MQ=34) tgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCtt > 2:197852/1‑97 (MQ=33) tgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCtt > 1:1987314/1‑97 (MQ=34) tgACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTAGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCtt > 2:2093993/1‑97 (MQ=18) aCCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCa > 1:1039705/1‑97 (MQ=34) cTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCAcc > 1:315253/1‑97 (MQ=32) ttCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCCCTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCAccc > 2:2306699/1‑96 (MQ=14) ttCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCa < 2:357462/97‑1 (MQ=31) ttCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCa < 2:1328893/97‑1 (MQ=31) ttCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCa < 2:1210167/97‑1 (MQ=31) gtgATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGtct > 2:2397571/1‑97 (MQ=32) gcgATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGtct > 2:2391828/3‑97 (MQ=17) gATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCg < 2:1455892/97‑1 (MQ=34) aTTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGa > 2:1713862/1‑97 (MQ=35) ttGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGaa > 2:2247607/1‑97 (MQ=37) ttGGTGTTGTGATTCTCTTACTTCCTTGTTGTTCTTCTTGTTTCTCTCGCTCTTCACCAGGTTGTATCTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGaa < 2:787757/97‑1 (MQ=11) tGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAAc < 1:867834/97‑1 (MQ=38) tGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAAc < 2:350788/97‑1 (MQ=38) ggTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCCTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACg > 1:170196/1‑97 (MQ=17) gtgtTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACgg < 1:423560/97‑1 (MQ=39) tgttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGt < 2:888618/97‑1 (MQ=39) tgttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGt < 1:333604/97‑1 (MQ=39) gttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTa < 1:2230959/97‑1 (MQ=38) gttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTa < 1:2294575/97‑1 (MQ=38) gttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCCTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTa > 2:916124/1‑97 (MQ=18) ttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAt > 2:1244706/1‑97 (MQ=37) ttgtGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAt < 1:119644/97‑1 (MQ=37) tgtgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtc < 2:2297939/97‑1 (MQ=39) gtgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtct > 2:125283/1‑97 (MQ=38) gtgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtct > 2:2414337/1‑97 (MQ=39) gtgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtct > 2:399018/1‑97 (MQ=37) tgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtctc < 1:523139/97‑1 (MQ=39) tgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtctc < 2:1534662/97‑1 (MQ=38) tgATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCCTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTAtctc < 1:417712/97‑1 (MQ=21) gATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATctct < 1:851952/97‑1 (MQ=38) aTTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCTCCCGGTTGTAACTTCGCATTAGATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTa < 2:1341770/97‑1 (MQ=11) aTTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTa < 1:2257456/97‑1 (MQ=39) ttGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTAc > 1:365039/1‑97 (MQ=39) ttGTCTTACTTCCTGGTTGTCCCTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTAc > 1:2556965/1‑97 (MQ=18) tGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACt > 1:2552660/1‑97 (MQ=38) gTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTg < 1:1487277/97‑1 (MQ=39) cTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGtt < 2:1561762/97‑1 (MQ=39) ttACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttt > 1:1496723/1‑97 (MQ=39) ttACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttt > 2:1037832/1‑97 (MQ=37) ttACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttt > 1:1375656/1‑97 (MQ=39) tACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGtttt > 2:1656793/1‑97 (MQ=37) tACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGtttt > 1:1911794/1‑97 (MQ=38) aCTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttttt > 2:1962605/1‑97 (MQ=38) aCTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttttt < 1:482016/97‑1 (MQ=39) aCTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttttt > 1:2093195/1‑97 (MQ=38) aCTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGttttt < 1:1382629/97‑1 (MQ=38) cTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCCCTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTg < 2:1960379/97‑1 (MQ=255) cTTCCTGGTTGTCCCTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTg < 2:2556964/97‑1 (MQ=21) ttCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGt > 2:2091737/1‑97 (MQ=38) tCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGtt < 2:962043/97‑1 (MQ=39) ccTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGTACGGTATCTCTACTGTTTTTg < 2:1844749/94‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTa > 2:423244/1‑79 (MQ=40) ccTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGttt < 1:1140718/97‑1 (MQ=39) ccTGGTTGTCCCTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGttt > 1:1603808/1‑97 (MQ=21) tGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCt < 2:1998908/97‑1 (MQ=39) tGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCt < 1:121330/97‑1 (MQ=39) ggTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGCACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTg > 2:817332/1‑97 (MQ=255) ggTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTg > 1:2430461/1‑97 (MQ=39) ggTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTg < 2:1360632/97‑1 (MQ=39) gTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGt > 1:2521596/1‑97 (MQ=40) gTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGt < 1:447711/97‑1 (MQ=40) tGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGttt < 2:353104/97‑1 (MQ=255) tGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGttt > 2:1139837/1‑97 (MQ=255) gTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGtttt < 2:2020128/97‑1 (MQ=255) gTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGtttt > 1:2273863/1‑97 (MQ=255) tCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTtta < 1:2082099/97‑1 (MQ=255) tCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTtta < 2:1631868/97‑1 (MQ=255) tCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTtta < 2:1679362/97‑1 (MQ=255) ccTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTttat < 1:669/97‑1 (MQ=255) ccTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTttat > 2:425538/1‑97 (MQ=255) cttcttGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTTTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTgtatt > 2:2517430/1‑97 (MQ=12) cttcttGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTttatt > 2:644267/1‑97 (MQ=255) ttcttGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTttatta < 2:1390550/97‑1 (MQ=255) | TGTGATCTCTTCTGTTGGTTGACCTTCGCCAACTTTTTCACCCGTTAATGGGTTCACTGTGATTGGTGTTGTGATTGTCTTACTTCCTGGTTGTCCTTCTTGTTTCACTCGCTCTTCACCAGGTTGTAACTTCGGATTAAATTCACGTTTTGTCTCGAACGGTATCTCTACTGTTTTTGTTTCTGTTTTATTA > BX571857/2552014‑2552206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |