| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 2,602,946 | G→T | 100% | G116G (GGC→GGA) | SAS2426 ← | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 2,602,946 | 0 | G | T | 98.2% | 682.2 / 5.0 | 165 | G116G (GGC→GGA) | SAS2426 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (75/84); total (78/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAAT > BX571857/2602853‑2603038 | cGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCa > 2:1824663/1‑97 (MQ=255)cGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCa < 1:30087/97‑1 (MQ=255)cGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCa < 1:2478171/97‑1 (MQ=255) gTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCaa > 2:1406477/1‑97 (MQ=255) gTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCaa > 1:2244681/1‑97 (MQ=255) aTCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAAt < 2:1653806/97‑1 (MQ=255) tCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATg > 1:2362155/1‑97 (MQ=255) tCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATg < 1:1751862/97‑1 (MQ=255) tCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATg > 1:224260/1‑97 (MQ=255) cTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGc > 1:588888/1‑97 (MQ=255) gTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCtt < 1:681375/97‑1 (MQ=255) tACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCttt > 1:512242/1‑97 (MQ=255) tACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCttt < 2:1710353/97‑1 (MQ=255) accaccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTa < 1:1585064/97‑1 (MQ=255) accaccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTa < 2:2526970/97‑1 (MQ=255) cTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAgtgt > 1:982186/1‑97 (MQ=255) cTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCAAAATGCTTTAAgtgt > 1:1582544/1‑97 (MQ=255) gTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTaa > 2:600634/1‑97 (MQ=255) ttCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAg < 2:2361652/97‑1 (MQ=255) tCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGa < 1:360585/97‑1 (MQ=255) aTGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAac < 2:518252/97‑1 (MQ=255) tgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACt < 2:2288109/97‑1 (MQ=255) gACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTa < 2:1550740/97‑1 (MQ=255) cacTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAAc < 2:986212/97‑1 (MQ=255) cacTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAAc < 2:1789038/97‑1 (MQ=255) cacTTCGATACCTACGGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAAc < 2:884639/97‑1 (MQ=255) cTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACAt > 1:1541565/1‑97 (MQ=255) cTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACAt > 1:1676412/1‑97 (MQ=255) ttCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATg > 1:1494703/1‑97 (MQ=255) ttCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATg < 2:262351/97‑1 (MQ=255) aCCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTc > 2:1444502/1‑97 (MQ=255) aCCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTc > 1:793966/1‑97 (MQ=255) ccTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCa > 1:2083520/1‑97 (MQ=255) ccTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCa > 2:2560559/1‑97 (MQ=255) ccTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCa > 1:624319/1‑97 (MQ=255) aCTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCa > 1:350485/1‑97 (MQ=255) aCTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCa > 2:911281/1‑97 (MQ=255) cTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCCGCAt > 2:1953512/1‑97 (MQ=255) cTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCAt < 1:765529/97‑1 (MQ=255) cTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCAt < 1:1920607/97‑1 (MQ=255) tGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATg < 1:2211537/97‑1 (MQ=255) tGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATg < 2:703843/97‑1 (MQ=255) cGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGAc < 1:2537452/97‑1 (MQ=255) ggCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACg < 1:1400591/97‑1 (MQ=255) ggCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACg < 1:219571/97‑1 (MQ=255) gCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGc < 2:2429875/97‑1 (MQ=255) tGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCa > 2:800845/1‑97 (MQ=255) tGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCa > 2:315374/1‑97 (MQ=255) tataGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGtt < 2:19274/97‑1 (MQ=255) taGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTaa < 1:1671926/97‑1 (MQ=255) gagcGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAAATCAGCATGACGCCAGTTAAtc > 2:2503286/4‑96 (MQ=255) gATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATa > 1:2286746/1‑97 (MQ=255) gATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATa > 2:131737/1‑97 (MQ=255) aTCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATac < 1:1340078/97‑1 (MQ=255) tCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATaca < 2:423714/97‑1 (MQ=255) ggggCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACt > 1:326914/1‑97 (MQ=255) gggCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACtt < 1:1369043/97‑1 (MQ=255) gCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGc > 1:1643246/1‑97 (MQ=255) aaTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaa < 1:235395/97‑1 (MQ=255) aTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaa < 2:200111/97‑1 (MQ=255) aTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaa < 1:2140446/97‑1 (MQ=255) tAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAGATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAAGTCAGCATGACGCCAGTTAGTACACTTGCaaaa < 2:1748169/97‑1 (MQ=255) aaCGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaaaa > 1:2179230/1‑97 (MQ=255) aCGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAAt < 2:878133/97‑1 (MQ=255) gTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGa > 1:827751/1‑97 (MQ=255) gTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGa < 1:1817893/97‑1 (MQ=255) ttACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGAt < 1:1854744/97‑1 (MQ=255) tACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATa > 2:1470406/1‑97 (MQ=255) aCAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATag > 2:1925379/1‑97 (MQ=255) cAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATaga < 1:1401101/97‑1 (MQ=255) aTGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTTTTAAGAACTCTAACATGAAATTCAGCATCACGCCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAATGATAgaga < 2:1256871/97‑1 (MQ=255) aTGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAgaga > 1:1005922/1‑97 (MQ=255) aTGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAgaga < 2:263490/97‑1 (MQ=255) aTGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAgaga > 1:1005873/1‑97 (MQ=255) gACGTCTTTAGCATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGCCGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACa > 2:1166188/1‑97 (MQ=255) gACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACa > 1:1062540/1‑97 (MQ=255) gACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACa > 2:2075701/1‑97 (MQ=255) gACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACa > 1:930864/1‑97 (MQ=255) aCGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAt < 2:646043/97‑1 (MQ=255) aCGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAt < 1:2439665/97‑1 (MQ=255) cgccTTTAGAATACCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACAAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACCCTTGCAAAAATGATAGAGACAtc < 2:1682867/94‑2 (MQ=255) cGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAtt < 1:113237/97‑1 (MQ=255) cGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAtt < 1:938564/97‑1 (MQ=255) cGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAtt < 1:1421944/97‑1 (MQ=255) gTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg > 1:1337016/1‑97 (MQ=255) gTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg > 2:2228494/1‑97 (MQ=255) gTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg < 2:1220038/97‑1 (MQ=255) tCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGt < 1:388585/97‑1 (MQ=255) tCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGt < 2:2311563/97‑1 (MQ=255) cTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTc < 2:1602018/97‑1 (MQ=255) cTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTc < 1:2444792/97‑1 (MQ=255) tttAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCt > 2:1907206/1‑97 (MQ=255) tttAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCt > 2:853568/1‑97 (MQ=255) tttAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCt > 1:1179340/1‑97 (MQ=255) tAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCttt < 1:319656/97‑1 (MQ=255) aGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTa < 2:152973/97‑1 (MQ=255) gAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTaa < 2:1358149/97‑1 (MQ=255) gAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTaa < 1:1390935/97‑1 (MQ=255) aaTATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAAt > 2:405929/1‑97 (MQ=255) aaTATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAAt < 1:2395579/97‑1 (MQ=255) | CGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAAT > BX571857/2602853‑2603038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |