| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 868,946 | G→A | 22.3% | A315T (GCT→ACT) | SAS0786 → | putative selenocysteine lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 868,946 | 0 | G | A | 22.3% | 494.6 / 152.5 | 202 | A315T (GCT→ACT) | SAS0786 | putative selenocysteine lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (80/77); new base A (26/19); total (106/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
ATTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTAC > BX571857/868850‑869042 | aTTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGCTGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATg > 2:601556/1‑97 (MQ=255) tGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCt > 1:15650/1‑97 (MQ=255) gCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCtt > 1:1466582/1‑97 (MQ=255) gCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCtt > 1:1388497/1‑97 (MQ=255) tCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTAt < 1:1783530/97‑1 (MQ=255) cAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATg < 2:337366/97‑1 (MQ=255) cAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATg < 1:949687/97‑1 (MQ=255) cAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATg > 1:1590269/1‑97 (MQ=255) cAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATg < 1:126536/97‑1 (MQ=255) aGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAg > 2:190446/1‑97 (MQ=255) gCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGc < 2:1762313/97‑1 (MQ=255) cAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCa < 2:871530/97‑1 (MQ=255) cAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCa < 2:272789/97‑1 (MQ=255) aaTTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCaa < 2:1810216/97‑1 (MQ=255) ttGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAAt > 2:1440837/1‑97 (MQ=255) tGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATg < 1:2072570/97‑1 (MQ=255) tGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATg < 1:1983578/97‑1 (MQ=255) ggggCTTGCAGAAGCTCTTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATg < 1:2117856/96‑1 (MQ=255) gggCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGATTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGt > 2:2218354/1‑97 (MQ=255) gCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCt < 2:1491738/97‑1 (MQ=255) gCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCt > 1:2416482/1‑97 (MQ=255) ttGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGc < 1:1182988/97‑1 (MQ=255) gCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCaa > 1:1429049/1‑97 (MQ=255) aGAAGCTATTCGGGATTGAGGACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAAtt < 2:1608262/97‑1 (MQ=255) aaGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGa < 1:1971729/97‑1 (MQ=255) aGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGaa > 2:955317/1‑97 (MQ=255) gCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAg < 2:287619/97‑1 (MQ=255) cTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAgg > 2:675454/1‑97 (MQ=255) tATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGa > 2:831111/1‑97 (MQ=255) gCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGa < 2:896229/97‑1 (MQ=255) cTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGaa < 1:1500541/97‑1 (MQ=255) cTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGaa < 1:2533566/97‑1 (MQ=255) tttAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAAtt > 1:862644/1‑97 (MQ=255) tAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTa > 2:236899/1‑97 (MQ=255) tAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTa < 1:1642478/97‑1 (MQ=255) tAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTa > 2:264751/1‑97 (MQ=255) tAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGCTATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATGGAAATTTATGGCCCGcc > 2:1227081/1‑97 (MQ=255) tAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGcc > 1:1439459/1‑97 (MQ=255) aGGGTTTGAGGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCa < 2:1879657/97‑1 (MQ=255) ggTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCaa > 2:323081/1‑97 (MQ=255) ggTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCaa > 1:433451/1‑97 (MQ=255) ttttGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAg > 1:88298/1‑97 (MQ=255) tttGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAgg < 1:112338/97‑1 (MQ=255) ttGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCACTTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGa > 2:1966127/1‑97 (MQ=255) tGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAt < 2:504774/97‑1 (MQ=255) gATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtc < 1:1241399/97‑1 (MQ=255) gATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtc < 2:1391673/97‑1 (MQ=255) tGCAATTGATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtcgt < 2:1063546/97‑1 (MQ=255) tGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtcgt < 2:2510599/97‑1 (MQ=255) gCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtcgtc > 1:738951/1‑97 (MQ=255) gCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtcgtc > 1:1993088/1‑97 (MQ=255) cAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtcgtcg > 2:342784/1‑97 (MQ=255) cAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGAtcgtcg > 2:1051258/1‑97 (MQ=255) aaTTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATcgtcgt > 1:676022/1‑97 (MQ=255) aaTTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAACTGAAGGAAATGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATcgtcgt > 1:759048/1‑97 (MQ=255) aTTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTg < 2:1309346/97‑1 (MQ=255) cATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAg > 2:1252175/1‑97 (MQ=255) cATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAg > 2:1528769/1‑97 (MQ=255) ggaaaTATGACGAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAgg < 2:2179393/95‑1 (MQ=255) aTAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAgg > 1:2480067/1‑97 (MQ=255) aTAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAgg < 1:341857/97‑1 (MQ=255) aTAAAGAGGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAgg < 2:745410/97‑1 (MQ=255) tAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGgt < 2:1239852/97‑1 (MQ=255) aaaTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGgtg > 1:1415329/1‑97 (MQ=255) aaaTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGgtg > 1:1875493/1‑97 (MQ=255) aaaTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGgtg > 1:363100/1‑97 (MQ=255) aaTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGgtgt < 1:379846/97‑1 (MQ=255) aaTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGgtgt > 1:128249/1‑97 (MQ=255) tatGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaa > 1:1204987/1‑97 (MQ=255) atGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaat < 1:2434379/97‑1 (MQ=255) atGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaat > 1:2470921/1‑97 (MQ=255) atGAACAAGAATTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaat > 1:158017/1‑97 (MQ=255) atGAACAAGAACTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaat < 2:1280958/97‑1 (MQ=255) tGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaata > 1:2095319/1‑97 (MQ=255) gAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGtaataa > 1:472971/1‑97 (MQ=255) aaCAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAAc < 1:2221206/97‑1 (MQ=255) aaCAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAAc < 2:2055376/97‑1 (MQ=255) cAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCACATGACTGCAATTGAAGGACTTGAACTTTATGGCCCGCCAAAGGACCGTCGGGCCGGCGTAATAACGt > 1:620425/1‑97 (MQ=255) cAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGt > 2:2403775/1‑97 (MQ=255) cAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGt > 1:275663/1‑97 (MQ=255) aaGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGtt < 1:527020/97‑1 (MQ=255) aaGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGtt > 1:1297891/1‑97 (MQ=255) aGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGttt > 1:1953450/1‑97 (MQ=255) gAATTAGCGATATATGCTTATGGGCAAATGGCTGCAATGGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTa < 2:2458794/97‑1 (MQ=255) aTTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAAt > 1:1526404/1‑97 (MQ=255) aTTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAAt > 1:132227/1‑97 (MQ=255) aTTAACGATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAAt > 1:2382450/1‑97 (MQ=255) ttAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAAtt > 2:546695/1‑97 (MQ=255) ttAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAAtt > 2:980001/1‑97 (MQ=255) ttAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAAtt > 1:820414/1‑97 (MQ=255) aaCGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTa < 2:2185026/97‑1 (MQ=255) aaCGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTa > 1:2241752/1‑97 (MQ=255) gATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACaa > 1:504145/1‑97 (MQ=255) gATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACaa > 1:2309884/1‑97 (MQ=255) gATATATACTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACaa < 2:2332099/97‑1 (MQ=255) tatatGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAgg > 2:461351/1‑96 (MQ=255) atatGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGAt > 1:1037374/1‑97 (MQ=255) tGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTa < 2:1815497/97‑1 (MQ=255) tGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGAGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTa > 2:2274862/1‑97 (MQ=255) gCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTAc > 2:785902/1‑97 (MQ=255) | ATTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTAC > BX571857/868850‑869042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |