Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | BX571857 | 1,434,357 | C→G | 12.0% | A141G (GCT→GGT) | SAS1338 → | putative tetrahydrodipicolinate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BX571857 | 1,434,357 | 0 | C | G | 12.0% | 764.7 / 23.2 | 220 | A141G (GCT→GGT) | SAS1338 | putative tetrahydrodipicolinate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (93/98); new base G (26/2); total (119/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGATGATGT > BX571857/1434262‑1434453 | tGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCt > 1:1619232/1‑97 (MQ=255) ggcgCTGTCGTATTGATGGGCGCAACGATGAGTATGGGGGCAGGCGTTTGCGAAGGTACGATGTTTGATATGAAGGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTa < 2:723061/94‑1 (MQ=255) gTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTAc > 1:1456929/1‑97 (MQ=255) gCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACaa < 1:399325/97‑1 (MQ=255) cTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAAc > 1:2951759/1‑97 (MQ=255) cTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAAc > 1:2952070/1‑97 (MQ=255) cGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt > 1:2910533/1‑97 (MQ=255) cGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt < 1:2445100/97‑1 (MQ=255) cGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGt > 1:1841909/1‑97 (MQ=255) gTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTa > 1:443615/1‑97 (MQ=255) gTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGGTACAACTAGTa > 2:577661/1‑97 (MQ=255) tATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaa < 1:2775753/97‑1 (MQ=255) tATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaa < 1:816535/97‑1 (MQ=255) tATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGCCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaa > 1:3001942/1‑97 (MQ=255) atgatgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTACCACTGGAaaaa > 2:1774634/1‑97 (MQ=255) atgatgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaa < 1:660969/97‑1 (MQ=255) atgatgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaa > 2:2908514/1‑97 (MQ=255) tgatgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATACGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTaaaaa < 1:2789057/97‑1 (MQ=255) atgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATg > 1:48250/1‑97 (MQ=255) atgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATg > 1:959321/1‑97 (MQ=255) atgGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCCTACCACTGGaaaaaacg > 2:467960/1‑95 (MQ=255) atgGGCGCAACAATGAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGCTCGTGCTACAACTGGTAAAAATg < 2:3006055/97‑1 (MQ=255) gggCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTa < 1:2615323/97‑1 (MQ=255) gggCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGGTACCACTAGAAAAAAAGTa > 2:1393165/1‑97 (MQ=255) aaTTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAggg > 1:1698219/1‑97 (MQ=255) aaTTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAggg > 1:3335779/1‑97 (MQ=255) tAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGcg > 1:2392752/1‑96 (MQ=255) aaTATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTg > 1:1792229/1‑97 (MQ=255) aaTATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTg > 1:1175089/1‑97 (MQ=255) aaTATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCACTGAAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTg > 2:1410810/1‑97 (MQ=255) atTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCCTACCACTAGAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGgcg > 2:1797428/1‑97 (MQ=255) ttGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCACTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGgcga > 2:123072/1‑96 (MQ=255) tGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCa > 1:3260645/1‑97 (MQ=255) ggCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGCCTGGCGCAg > 1:902612/1‑97 (MQ=255) gcgcAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGt < 1:252304/97‑1 (MQ=255) cgcAGGCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGGTATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTa < 2:791864/97‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAg > 1:589886/1‑97 (MQ=255) gTCGTGGGCGAAGGGACAATGATTGATATGAATGCAACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAg < 2:64382/97‑1 (MQ=255) cGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTGCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCa < 2:1253283/97‑1 (MQ=255) cGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCa < 2:3219506/97‑1 (MQ=255) cGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCa > 1:1971550/1‑97 (MQ=255) gTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAg < 1:2426784/97‑1 (MQ=255) ttGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAgg < 1:2886862/97‑1 (MQ=255) tGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGgt < 2:329787/97‑1 (MQ=255) ggCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGgtg > 1:1001174/1‑97 (MQ=255) ggCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGGTACCATTGGAAAAAATATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGgtg > 2:1689411/1‑97 (MQ=255) gAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGa > 2:2453234/1‑97 (MQ=255) aGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAtt < 1:2029247/97‑1 (MQ=255) aGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAtt > 1:2839615/1‑97 (MQ=255) aGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGAtt > 1:2679563/1‑97 (MQ=255) ggTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTg < 1:2176900/97‑1 (MQ=255) ggTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCATTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGGGaggg > 2:511875/1‑94 (MQ=255) gTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGa > 1:914960/1‑97 (MQ=255) gTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGa > 1:562452/1‑97 (MQ=255) gTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGa > 1:1931130/1‑97 (MQ=255) gTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGa < 1:2240424/97‑1 (MQ=255) tACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGaa > 1:1249460/1‑97 (MQ=255) tACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGaa < 1:2316751/97‑1 (MQ=255) cAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTACCACTAATAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAcc > 2:521645/1‑97 (MQ=255) aaTGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAccc < 1:1512373/97‑1 (MQ=255) aaTGAGTGATATGAATGCTGCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAccc < 2:2263217/97‑1 (MQ=255) aTGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCATTGAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAcccc > 2:281923/1‑97 (MQ=255) tgattgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAAccccc > 1:1278118/1‑97 (MQ=255) gattgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACACCCt > 1:775705/1‑97 (MQ=255) attgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTa < 1:1563298/97‑1 (MQ=255) ttgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAg > 2:2571667/1‑97 (MQ=255) tgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGGTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGt < 2:930113/97‑1 (MQ=255) tgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGt > 1:1207144/1‑97 (MQ=255) tgatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCACTGGAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGt > 2:2330376/1‑97 (MQ=255) gatATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCACTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTg > 2:2285960/1‑97 (MQ=255) atatGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGc < 2:1902263/97‑1 (MQ=255) atatGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGc < 1:1543288/97‑1 (MQ=255) tGAATGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCACTAAAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATc > 2:2726195/1‑97 (MQ=255) gAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCa < 1:1105731/97‑1 (MQ=255) aaTGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCAc > 1:1779856/1‑97 (MQ=255) tGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGACCCCCCTAGTGCATCACCg < 2:2682254/97‑1 (MQ=255) tGCTACTCTCGGTGGTCGCCGTATCATTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCg > 2:1339235/1‑97 (MQ=255) gCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCgg > 1:2007506/1‑97 (MQ=255) gCTACTCTCGGTGGTCGCCGTACCACTAAAAAAAAAATACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCgg > 2:2181917/1‑97 (MQ=255) aCTCTCGGTGGTCGTGCTACAGCTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTta < 2:1577511/97‑1 (MQ=255) aCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTta > 1:3298794/1‑97 (MQ=255) aCTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTta < 1:304660/97‑1 (MQ=255) ctctCGGTGGTCGTGCTACAGCTGGTAAAAATGTACATGGAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTtat < 2:767914/97‑1 (MQ=255) ctctCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTtat > 1:4540/1‑97 (MQ=255) tctcGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGGAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTtata < 2:2412995/97‑1 (MQ=255) ggtggtCGCCCTACCACTAAAAAAAAAGCACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCACGTGTGACTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCg > 2:1898072/1‑97 (MQ=255) ggtggtCGCCCTACAACTAGAAAAAAAGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCg > 2:1969691/1‑97 (MQ=255) ggtgggCGTGTTACAACTGGGAAAAATGTACATGTAGGGGCGGGCGCAGTATTAGCAGGGGTGATTGAGGCCCCGAGTGCATCACCGGTTATAATCg < 2:2953277/97‑1 (MQ=255) tggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGATCCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAg < 2:2499305/97‑1 (MQ=255) tggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAg < 1:2084476/97‑1 (MQ=255) ggtCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCgggg < 1:3159560/97‑1 (MQ=255) tCGTGGTAAAACTGGTAAAAATGTACGTGTAGGGGCTGGGGCAGTATTAGCAGGTGGGATTGAGCCCCCTAGTGCATAACCGGTTATAATCGAGgat < 2:843612/97‑1 (MQ=255) tCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGgat < 1:2855331/97‑1 (MQ=255) cGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGgctg > 2:1129952/1‑97 (MQ=255) cGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGgatg > 2:876275/1‑97 (MQ=255) gCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGatgatg < 1:271504/97‑1 (MQ=255) cTACAACTGGTAAAAATGTACGTGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGACCCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGATGATGt < 2:1893588/97‑1 (MQ=255) cTACAACTGGTAAAAATGTACGTGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGATGATGt < 2:2541840/97‑1 (MQ=255) cTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGATGATGt > 1:3087228/1‑97 (MQ=255) cTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGATGATGt > 2:3076062/1‑97 (MQ=255) | TGGTGCTGTCGTTATGATGGGCGCAACAATTAATATTGGCGCAGTCGTTGGCGAAGGTACAATGATTGATATGAATGCTACTCTCGGTGGTCGTGCTACAACTGGTAAAAATGTACATGTAGGGGCTGGCGCAGTATTAGCAGGTGTGATTGAACCCCCTAGTGCATCACCGGTTATAATCGAGGATGATGT > BX571857/1434262‑1434453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |