| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 1,868,342 | G→A | 100% | G129D (GGT→GAT) | SAS1720 → | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 1,868,342 | 0 | G | A | 100.0% | 873.6 / ‑6.5 | 197 | G129D (GGT→GAT) | SAS1720 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (84/112); total (84/113) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TCAGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGGTAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTAA > BX571857/1868248‑1868435 | tCAGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATa < 1:163249/97‑1 (MQ=255) cAGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATaa < 2:1419853/97‑1 (MQ=255) aGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATaaa < 1:2119595/97‑1 (MQ=255) aGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATaaa < 2:1466786/97‑1 (MQ=255) gTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGCGACGATTAAAAACAAAGATAaag < 2:3005765/97‑1 (MQ=255) ttGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaaga < 2:907603/97‑1 (MQ=255) ttGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaaga < 2:1675745/97‑1 (MQ=255) tGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaa > 2:1127427/1‑97 (MQ=255) gAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAaagaag < 1:1804920/97‑1 (MQ=255) aaaCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGc < 1:2191835/97‑1 (MQ=255) aaCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCg < 1:1410143/97‑1 (MQ=255) aCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGt < 1:1018176/97‑1 (MQ=255) aCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGt > 2:1188838/1‑97 (MQ=255) aCTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCAAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGt > 1:2404004/1‑97 (MQ=255) cTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGtt < 1:281117/97‑1 (MQ=255) cTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGtt > 1:952168/1‑97 (MQ=255) tGACATCACTTGGTCCATCTATCGCTCCAACAAATGCTAAAGGGACAGTTGTCGTTGCCGATGTGACGCTTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGtcacc < 2:796068/97‑5 (MQ=255) tGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAAc < 2:1592753/97‑1 (MQ=255) gAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACa < 1:1288212/97‑1 (MQ=255) aaTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAAt < 1:69626/97‑1 (MQ=255) aTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAAtt < 2:477921/97‑1 (MQ=255) aTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAAtt > 2:1823562/1‑97 (MQ=255) aTCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAAtt > 2:613598/1‑97 (MQ=255) tCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTg < 2:2340477/97‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTg < 2:1357448/97‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTg > 1:3243162/1‑97 (MQ=255) aGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGAt < 2:1386337/97‑1 (MQ=255) aGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGAt > 2:265232/1‑97 (MQ=255) aGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGAt < 1:2538585/97‑1 (MQ=255) aGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGAt < 1:2979697/97‑1 (MQ=255) gTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATa < 2:2693168/97‑1 (MQ=255) gTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATa < 2:1837742/97‑1 (MQ=255) ttGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAg < 2:1986954/97‑1 (MQ=255) ttGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAg > 1:786585/1‑97 (MQ=255) ttGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGAAGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAg < 2:364611/97‑1 (MQ=255) tGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGt < 2:493086/97‑1 (MQ=255) tGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGt > 2:578927/1‑97 (MQ=255) gTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTc < 1:2121670/97‑1 (MQ=255) gTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTc < 1:2639372/97‑1 (MQ=255) tCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCa > 1:1113177/1‑97 (MQ=255) cATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAAt > 1:1223999/1‑97 (MQ=255) tCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGt < 1:737539/97‑1 (MQ=255) tCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGt > 1:2241557/1‑97 (MQ=255) cTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGtt < 2:2332944/97‑1 (MQ=255) tCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGAGAAGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTaa > 2:1469183/1‑97 (MQ=255) cgcgCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCACTGATTaaa > 2:1782661/1‑97 (MQ=255) gcgcCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAAc > 2:2929796/1‑97 (MQ=255) ccAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGa < 1:415458/97‑1 (MQ=255) ccAACAAAAGCTACAAGTACATTTGTCGTTGCTGATGTAACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTAAATGTTTATACTGa < 2:1733477/97‑1 (MQ=255) caaATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATc < 1:2674823/97‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCt < 2:974560/97‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCt > 1:502804/1‑97 (MQ=255) aaTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTg > 1:2894323/1‑97 (MQ=255) aTGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTgg < 1:2026633/97‑1 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt > 2:95837/1‑97 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt < 2:2867516/97‑1 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt > 2:2392741/1‑97 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt < 1:2528853/97‑1 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt > 2:1669261/1‑97 (MQ=255) tGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGGGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGt < 2:1118602/97‑1 (MQ=255) aaaGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATa > 2:2355954/1‑97 (MQ=255) aaGGTACTTTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCTTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaa < 1:1421619/97‑1 (MQ=255) aGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaa > 1:1195227/1‑97 (MQ=255) ggTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa > 1:2317475/1‑97 (MQ=255) ggTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa < 1:187219/97‑1 (MQ=255) ggTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa < 1:904066/97‑1 (MQ=255) ggTACAGTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATaaaa < 2:277856/97‑1 (MQ=255) aCATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACAt < 2:1921240/97‑1 (MQ=255) tttGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTg < 1:485682/97‑1 (MQ=255) ttGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGa < 2:2746924/97‑1 (MQ=255) gTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAg < 1:3064879/97‑1 (MQ=255) tCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGc < 1:2469081/97‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAg > 1:1922541/1‑97 (MQ=255) gCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGata > 2:2721130/1‑97 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata < 1:2140762/97‑1 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata < 2:2901409/97‑1 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata > 1:2051233/1‑97 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata < 2:127217/97‑1 (MQ=255) gATGTGACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGataata > 1:2454752/1‑97 (MQ=255) gtgACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAg > 2:2534689/1‑97 (MQ=255) gtgACGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAg < 1:54850/97‑1 (MQ=255) aCGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCt > 2:2069064/1‑97 (MQ=255) cGATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTc < 1:1403744/97‑1 (MQ=255) agATTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTc < 2:3137554/96‑1 (MQ=255) aTTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCaa < 1:1151712/97‑1 (MQ=255) aTTAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCaa < 1:354890/97‑1 (MQ=255) ttAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAAt > 1:1678710/1‑97 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg < 2:1814286/97‑1 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg < 2:1539405/97‑1 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg > 2:1020799/1‑97 (MQ=255) tAAAAACAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATg < 2:1245897/97‑1 (MQ=255) aaaaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGt > 2:1164643/1‑97 (MQ=255) aaaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCt < 2:3218663/97‑1 (MQ=255) aaCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTg > 2:170662/1‑97 (MQ=255) aCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGc > 2:747161/1‑97 (MQ=255) aCAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGc > 2:1065187/1‑97 (MQ=255) cAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCACTGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCt > 2:3350333/1‑97 (MQ=255) cAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCt > 1:2217125/1‑97 (MQ=255) cAAAGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCt < 1:682927/97‑1 (MQ=255) aaGATAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTaa > 2:2312078/1‑97 (MQ=255) | TCAGTTGAAACTATGAAATCAGTTGGTCCATCTATCGCGCCAACAAATGCTAAAGGTACATTTGTCGTTGCTGATGTGACGATTAAAAACAAAGGTAAAGAAGCGTTAACAATTGATAGTTCAATGTTTAAACTGAAATCTGGTGATAAAACATTTGAAGCAGATAATACAGGCTCAATGTCTGCTAA > BX571857/1868248‑1868435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |