| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 2,602,946 | G→T | 77.3% | G116G (GGC→GGA) | SAS2426 ← | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 2,602,946 | 0 | G | T | 77.3% | 482.2 / 227.7 | 229 | G116G (GGC→GGA) | SAS2426 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (23/29); new base T (97/80); total (120/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-02 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ATCGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAATTTTC > BX571857/2602851‑2603042 | cGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCa > 1:1337821/1‑97 (MQ=255) gTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCaa > 1:121928/1‑97 (MQ=255) gTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCaa > 2:2645512/1‑97 (MQ=255) gTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCaa > 1:473622/1‑97 (MQ=255) tATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCaaa < 1:878906/97‑1 (MQ=255) tATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCaaa > 1:1848340/1‑97 (MQ=255) aTCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAAt > 1:3217640/1‑97 (MQ=255) tCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATg < 1:148546/97‑1 (MQ=255) cTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGc < 1:502451/97‑1 (MQ=255) cTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGc < 1:1900284/97‑1 (MQ=255) tGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCt > 2:1226350/1‑97 (MQ=255) tGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCt > 2:7224/1‑97 (MQ=255) accaccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTa < 2:2732181/97‑1 (MQ=255) ccaccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTaa < 2:629858/97‑1 (MQ=255) ccaccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTaa > 1:2573933/1‑97 (MQ=255) ccaccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTaa > 2:1884803/1‑97 (MQ=255) caccTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAg > 1:2332379/1‑97 (MQ=255) gTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTaa > 1:2815491/1‑97 (MQ=255) ttCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAg < 1:1376166/97‑1 (MQ=255) ttCATGTGACACGTCGATACCTACGGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAg < 2:3316843/97‑1 (MQ=255) tCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGa > 1:2498013/1‑97 (MQ=255) cATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGaa > 2:739984/1‑97 (MQ=255) cATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAACATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGaa > 2:254956/1‑97 (MQ=255) tgtgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAaca < 1:3308580/97‑1 (MQ=255) gtgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAacac > 2:36406/1‑97 (MQ=255) gtgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAacac > 2:1716773/1‑97 (MQ=255) gtgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAacac > 1:204388/1‑97 (MQ=255) tgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACt > 1:948385/1‑97 (MQ=255) tgACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACt < 1:1131005/97‑1 (MQ=255) acacTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTaa > 2:1275445/1‑97 (MQ=255) cacTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATGACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATACAAATGCTTTACGTGGTAAGAACACTAAc > 2:447469/1‑97 (MQ=255) cacTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAAc < 1:2386025/97‑1 (MQ=255) cacTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAAc < 2:3052546/97‑1 (MQ=255) cTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACAt > 1:2286728/1‑97 (MQ=255) tCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGa > 2:644116/1‑97 (MQ=255) tCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGa < 1:3246651/97‑1 (MQ=255) cGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGaa > 2:2330811/1‑97 (MQ=255) ccTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCa > 1:2158805/1‑97 (MQ=255) cTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAg < 2:1756413/97‑1 (MQ=255) cTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAg < 1:2340780/97‑1 (MQ=255) tACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCACTAACGCTAAAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAAAAATAACATGAAATTCAGc > 2:2266828/1‑97 (MQ=255) tACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGc < 1:1703386/97‑1 (MQ=255) tACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGc > 1:287903/1‑97 (MQ=255) gCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGc < 1:1739248/97‑1 (MQ=255) cTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGcc < 2:3323699/97‑1 (MQ=255) cTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGcc < 2:1867443/97‑1 (MQ=255) tGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCa < 2:2754254/97‑1 (MQ=255) tGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCa > 1:1400683/1‑97 (MQ=255) tGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCa > 1:2994974/1‑97 (MQ=255) ttATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGt > 2:898640/1‑97 (MQ=255) tataGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGtt > 1:1527819/1‑97 (MQ=255) tataGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGtt > 2:1403748/1‑97 (MQ=255) ataGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTa > 2:2438506/1‑97 (MQ=255) ataGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTa < 1:1782713/97‑1 (MQ=255) ataGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTa < 1:408374/97‑1 (MQ=255) ataGATCGCGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTa < 2:220065/97‑1 (MQ=255) aGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAAt > 2:328745/1‑97 (MQ=255) gATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGataata > 1:692381/1‑97 (MQ=255) gATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATa > 2:1564384/1‑97 (MQ=255) gATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATa > 1:2774073/1‑97 (MQ=255) aTCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATac < 2:2060351/97‑1 (MQ=255) tCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAGATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATaca < 2:148538/97‑1 (MQ=255) cGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATacac < 1:1111453/97‑1 (MQ=255) ggCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTg > 2:1181093/1‑97 (MQ=255) ggCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTg < 1:1990128/97‑1 (MQ=255) cAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCa > 2:2603444/1‑97 (MQ=255) aTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaa < 2:2452586/97‑1 (MQ=255) aTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaa < 1:483559/97‑1 (MQ=255) aTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaa < 1:3052713/97‑1 (MQ=255) aTAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCaaa < 2:1591319/97‑1 (MQ=255) aCGTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAAt < 2:944447/97‑1 (MQ=255) cGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATg > 1:1724611/1‑97 (MQ=255) gTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGa < 2:695018/97‑1 (MQ=255) gTTACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGa > 1:241001/1‑97 (MQ=255) ttACAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGAt < 1:371380/97‑1 (MQ=255) taacaTGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGCTa < 2:1503777/93‑1 (MQ=255) tACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATa < 1:919802/97‑1 (MQ=255) aCAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATag < 1:636496/97‑1 (MQ=255) cAATGACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATaga < 1:2146376/97‑1 (MQ=255) ggACGTCGTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGAc < 2:600602/96‑1 (MQ=255) gACGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACa < 2:2942509/97‑1 (MQ=255) aCGTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAt > 2:1576158/1‑97 (MQ=255) cGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACAtt < 2:1543328/97‑1 (MQ=255) gTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg < 1:2691733/97‑1 (MQ=255) gTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg > 2:1776531/1‑97 (MQ=255) gTCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg > 1:224212/1‑97 (MQ=255) gTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg < 2:2816332/97‑1 (MQ=255) gTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg < 1:533397/97‑1 (MQ=255) gTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTg < 1:2129897/97‑1 (MQ=255) tCTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGt < 2:113788/97‑1 (MQ=255) cTTTAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTc > 1:444688/1‑97 (MQ=255) ttAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCtt > 2:2934149/1‑97 (MQ=255) tAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCCGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCttt > 2:508119/1‑97 (MQ=255) tAGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCttt > 1:1800088/1‑97 (MQ=255) tAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCttt > 2:1373564/1‑97 (MQ=255) aGAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTa > 1:1473857/1‑97 (MQ=255) gAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACGTGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTaa < 1:1034958/97‑1 (MQ=255) gAATATCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTaa < 2:2385471/97‑1 (MQ=255) atatCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAAtt < 2:800690/97‑1 (MQ=255) tAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAAttt > 1:2622647/1‑97 (MQ=255) | ATCGTATCTGTACCACCTAGTTCATGTGACACTTCGATACCTACTGCGGCTGTTATAGATCGGGGCAATAACGTTACAATGACGTCTTTAGAATAGCCAAATGCTTTAAGTGTTAAGAACACTAACATGAAATTCAGCATGACGCCAGTTAATACACTTGCAAAAATGATAGAGACATTGTCTTTAATTTTC > BX571857/2602851‑2603042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |