| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571858 | 1 = | 0 (0.000) | 219 (1.140) | 110/170 | NT | 100% | intergenic (–/‑11) | –/pSAS01 | –/putative ABC transporter ATP binding protein |
| ? | BX571858 | = 20651 | 0 (0.000) | intergenic (+5/–) | pSAS24/– | putative exported protein/– | |||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
ATTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BX571858/96‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑TTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGGAT < BX571858/20651‑20558 ATTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCT > 1:1259687/1‑97 TTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTTCCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTta > 2:652434/1‑95 TTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCAT > 2:161824/1‑97 CCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTT < 1:844665/97‑1 TTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACATAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCCCCTCATTTTAAA > 2:1115613/1‑97 TTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAA > 2:222597/1‑97 TCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAA > 2:699912/1‑97 TCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAA < 2:95558/97‑1 TTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGG < 1:433048/97‑1 TTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGG > 2:609133/1‑97 AAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAA < 1:1381987/97‑1 AAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAAT < 2:466740/97‑1 AAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAAT > 1:622476/1‑97 AGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATA < 2:910418/97‑1 GTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT > 2:492603/1‑97 TTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATc > 1:807487/1‑96 CATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTT < 1:146410/97‑1 TCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑CTTTtg > 2:568694/1‑95 CCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGT < 2:1171152/97‑1 CCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGT < 2:1097479/97‑1 GTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAA > 1:1345613/1‑97 CTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATG > 2:171871/1‑97 TAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGT > 1:203285/1‑97 AAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTAT < 1:344643/97‑1 AAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTAT > 2:145743/1‑97 AAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTAT < 1:1166933/97‑1 AATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATT < 2:856113/97‑1 ATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTC < 1:693956/97‑1 ATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTC > 1:628462/1‑97 TTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTAT > 2:136443/1‑97 TTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTAT > 1:1186531/1‑97 TTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATC > 2:1176313/1‑97 TTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCG < 1:728734/97‑1 TTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCG < 1:1249026/97‑1 TTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACG < 2:29043/97‑1 TTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACG > 2:412422/1‑97 TTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACG > 1:705394/1‑97 TACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGC < 1:857762/97‑1 CTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACA > 1:158627/1‑97 TTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTTTCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAAGATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACAT < 2:282991/97‑1 TTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATAT < 2:778130/97‑1 TTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATAT > 1:1124428/1‑97 TTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATT > 1:1400855/1‑97 TACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCC < 1:59340/97‑1 ACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCC < 2:346832/97‑1 AAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTT < 1:425410/97‑1 AAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTT > 1:394120/1‑97 AAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTT > 2:1409770/1‑97 AACATTTTCAAGTTTTATCACTGTCGGTCCCCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTAT < 2:542704/97‑1 AACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTAT < 1:911835/97‑1 ACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATG < 1:677554/97‑1 ACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATG > 1:407325/1‑97 ACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATG > 1:662379/1‑97 ACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATG > 2:643503/1‑97 CATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGA < 2:299937/97‑1 CATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGA > 1:245204/1‑97 TTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATT < 1:287965/97‑1 TTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTT > 2:1318901/1‑97 TTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTT < 2:370589/97‑1 TTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTA < 1:565475/97‑1 TTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTA < 2:376088/97‑1 TTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTA < 2:1312974/97‑1 TCAAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTAC < 1:517868/97‑1 AAGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTT > 1:243462/1‑97 AGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTT < 1:980215/97‑1 AGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTT < 2:924409/97‑1 AGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTT < 1:220757/97‑1 AGTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTT < 1:769385/97‑1 GTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAACGTATTCTATCGAACGCACATATTCCCCTTTATGATTTACTTTC > 2:1379506/1‑97 GTTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAACTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTC < 1:717/97‑1 TTTTATCACTATCGTTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCA > 2:1391198/1‑97 TTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCA < 2:1048901/97‑1 TTTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCA > 1:1076959/1‑97 TTTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCAC > 2:245682/1‑97 TTATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACA < 1:172322/97‑1 ATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATA > 1:1301620/1‑97 ATCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATA < 1:959379/97‑1 TCACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATAT < 1:1060275/97‑1 CACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATT < 2:360080/97‑1 CACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATT < 1:1216052/97‑1 CACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATT < 2:1215719/97‑1 CACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATT < 1:479520/97‑1 ACTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTC > 2:183528/1‑97 CTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCT < 1:5610/97‑1 CTATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCT < 1:458388/97‑1 ATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTT > 2:1146409/1‑97 ATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTT > 2:1247268/1‑97 ATCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTT < 1:1092379/97‑1 TCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTT > 2:438746/1‑97 TCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTT > 1:114854/1‑97 TCGGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTT > 2:888511/1‑97 GGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGT > 1:917730/1‑97 GGTCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGT > 2:429370/1‑97 TCACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAG > 1:324833/1‑97 CACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGG > 2:1048136/1‑97 CACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGG > 1:796080/1‑97 CACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGG > 2:1220331/1‑97 CACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGG > 1:1009827/1‑97 ACCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGGA > 1:109986/1‑97 CCTCATTTTAAAAAGCTAGGAATATCTTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGGAT > 2:852763/1‑97 ATTTTCCTTTTTCAAAATTAAAGTTACATCCGTCTAAAATGTTTTTATTACCTTTTTTTACAAAAACATTTTCAAGTTTTATCACTATCGGTCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BX571858/96‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCATTTTAAAAAGCTAGGAATAT‑TTTTGTAATGTATTCTATCGAACGCACATATTTCCCTTTATGATTTACTTTCACATATTCTTTTGTAGGAT < BX571858/20651‑20558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |