| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 1,472,392 | G→T | 5.1% | pseudogene (3325/5622 nt) | ebh ← | very large surface anchored protein (pseudogene) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 1,472,392 | 0 | G | T | 5.1% | 785.8 / 14.8 | 200 | pseudogene (3325/5622 nt) | ebh | very large surface anchored protein (pseudogene) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (92/96); new base T (3/9); total (95/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CTTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGATC > BX571857/1472296‑1472488 | ttGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAgc > 2:1164856/1‑97 (MQ=255) tGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAgcg < 1:132621/97‑1 (MQ=255) gTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAgcgc > 2:1266433/1‑97 (MQ=255) gTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAgcgc < 1:1818251/97‑1 (MQ=255) ttCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCAt > 2:2524463/1‑97 (MQ=255) cGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTg > 2:2066354/1‑97 (MQ=255) cATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGtt < 2:3400884/97‑1 (MQ=255) aTTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTa < 2:3007856/97‑1 (MQ=255) ttttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTaa < 2:2368537/97‑1 (MQ=255) ttttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTaa > 1:1767864/1‑97 (MQ=255) tttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt < 2:348199/97‑1 (MQ=255) tttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt > 1:2311442/1‑97 (MQ=255) tttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAAt < 1:3444280/97‑1 (MQ=255) ttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCCATTTCTTCTTTAGTCAGCGCCTTGTTAATg > 2:2401187/1‑97 (MQ=255) ttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATg > 2:708485/1‑97 (MQ=255) ttCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATg > 2:1632573/1‑97 (MQ=255) cTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTc > 2:2272545/1‑97 (MQ=255) cTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTc > 1:2175234/1‑97 (MQ=255) tttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCg > 1:954855/1‑97 (MQ=255) ttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGt < 2:1018719/97‑1 (MQ=255) ttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGt < 1:889121/97‑1 (MQ=255) ttAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGt < 1:3035725/97‑1 (MQ=255) gCTTTCACTAAATCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTAt < 1:1919816/97‑1 (MQ=255) gCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGGTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCGATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTAt < 2:2271759/97‑1 (MQ=255) tttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGa < 1:1338342/97‑1 (MQ=255) ttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAc > 2:1371901/1‑97 (MQ=255) ttCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAc > 1:488323/1‑97 (MQ=255) cACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCt < 1:385980/97‑1 (MQ=255) cTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttg < 1:559732/97‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgtt > 1:3524075/1‑97 (MQ=255) aaaTCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCttgtt > 1:612831/1‑97 (MQ=255) aTCTTTGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGa < 1:1295883/97‑1 (MQ=255) tCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGaa > 2:2790178/1‑97 (MQ=255) tCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGaa > 1:1122768/1‑97 (MQ=255) cTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAg > 1:2765564/1‑97 (MQ=255) tttGATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGt < 2:2562165/97‑1 (MQ=37) ttAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTa < 1:2795443/97‑1 (MQ=255) ttAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTa > 2:3240532/1‑97 (MQ=255) tgaTTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAt < 1:2848566/95‑1 (MQ=255) aTTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTAttt < 1:2422821/97‑1 (MQ=255) ttCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGa < 2:21895/97‑1 (MQ=40) ttCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGa > 2:789780/1‑97 (MQ=40) ttCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGa > 1:1187680/1‑97 (MQ=255) tCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTTTTTGAt > 1:509208/1‑97 (MQ=255) tCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGAt > 2:3103074/1‑97 (MQ=40) cTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGAtt < 2:2131222/97‑1 (MQ=40) gTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAAt > 2:172575/1‑97 (MQ=255) aaTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATAc > 2:3575408/1‑97 (MQ=255) aaTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATAc < 2:3177262/97‑1 (MQ=255) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg > 1:1224414/1‑97 (MQ=255) aTGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACg < 1:1747929/97‑1 (MQ=255) ctggcgcAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc < 2:106918/94‑1 (MQ=255) cTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATc > 2:1458042/1‑97 (MQ=255) tGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTGGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCtt > 1:3604076/1‑97 (MQ=255) 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gtgCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTg > 2:1507440/1‑97 (MQ=255) gCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGtt < 2:3602641/97‑1 (MQ=255) ttGGCTTGTTCAGTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttttt < 1:1580829/97‑1 (MQ=255) ttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttttt > 1:720394/1‑97 (MQ=255) ttGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGCTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGttttt > 2:2822120/1‑97 (MQ=255) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTAt < 1:3275257/48‑1 (MQ=40) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTc < 1:2883510/97‑1 (MQ=255) tGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTc < 1:2141810/97‑1 (MQ=255) gCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGt < 1:3579594/84‑1 (MQ=255) gCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCt < 2:691992/97‑1 (MQ=255) cTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCtt < 2:538720/97‑1 (MQ=21) ttGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTa < 2:2748017/97‑1 (MQ=255) ttGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTa > 1:3134562/1‑97 (MQ=255) ttGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTa > 2:2899479/1‑97 (MQ=255) tGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTAt > 2:2233599/1‑97 (MQ=255) tGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTAt > 2:3552862/1‑97 (MQ=255) gTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATc < 1:1961108/97‑1 (MQ=40) tCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTg < 2:3642975/97‑1 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt > 2:2656341/1‑97 (MQ=255) cAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGt > 2:1148555/1‑97 (MQ=255) tttCTTCTTTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAg < 2:1329882/97‑1 (MQ=25) ttcttcTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGa > 2:196028/1‑97 (MQ=255) ttcttcTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGa < 2:26039/97‑1 (MQ=255) tcttctTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGAt < 1:162999/97‑1 (MQ=255) tcttctTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGAt > 1:683650/1‑97 (MQ=255) cttcttTAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGAtt < 2:3226073/97‑1 (MQ=25) cttcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGAtt < 1:1517553/97‑1 (MQ=255) cttcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGAtt > 1:1542361/1‑97 (MQ=255) tcttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTg < 1:812141/97‑1 (MQ=255) cttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAAt < 2:3360237/55‑1 (MQ=255) cttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTgg < 1:1880204/97‑1 (MQ=255) ttAGTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGt > 2:2889027/1‑72 (MQ=19) ttAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAt < 1:2064079/97‑1 (MQ=255) tAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAtt > 2:611290/1‑97 (MQ=255) gTCATCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTc < 2:3520928/97‑1 (MQ=25) gTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTc < 1:1473062/97‑1 (MQ=255) cAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGa > 1:2651467/1‑97 (MQ=255) cAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGa > 2:2140337/1‑97 (MQ=255) | CTTGTTTCGCATTTTCTTTAGCTTTCACTAAATCTTTAATTTCTTGTAATGCTTGCGCAAGTTGTGCTTTGGCTTGTTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATACGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTCGATC > BX571857/1472296‑1472488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |