| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 697,673 | G→T | 92.5% | A121S (GCT→TCT) | SAS0619 → | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 697,673 | 0 | G | T | 92.5% | 583.9 / 37.4 | 158 | A121S (GCT→TCT) | SAS0619 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/4); new base T (82/64); total (90/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TTTTAATCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCATTTTTAATT > BX571857/697578‑697765 | ttttAATCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGc < 1:2068563/97‑1 (MQ=255) ttAATCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCtt < 2:198715/97‑1 (MQ=255) ttAATCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCtt > 2:1987081/1‑97 (MQ=255) aaTCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTa < 1:563569/97‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTaa < 2:1105574/97‑1 (MQ=255) cttcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATCACATACCTACATGGCTAGGCTCTTTAAtt > 2:409688/1‑97 (MQ=255) cttcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAAtt > 1:1180572/1‑97 (MQ=255) cttcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAAtt > 1:2087846/1‑97 (MQ=255) cttcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAAtt < 2:261696/97‑1 (MQ=255) ttcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTa > 1:1396880/1‑97 (MQ=255) ttcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTa > 1:310770/1‑97 (MQ=255) tcttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTAt < 2:446880/97‑1 (MQ=255) ttcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGa < 1:820644/97‑1 (MQ=255) tcttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCATGCTCAACATTTGATGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGAc < 1:1654737/97‑1 (MQ=255) cttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGTGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACa < 2:1605213/97‑1 (MQ=255) ttATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACAt > 1:2256274/1‑97 (MQ=255) aTTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTa < 2:1588433/97‑1 (MQ=255) aTTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTa > 1:389275/1‑97 (MQ=255) ttGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGc > 1:1539809/1‑97 (MQ=255) tGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCg > 1:1066330/1‑97 (MQ=255) tGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCg > 2:157762/1‑97 (MQ=255) tGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCg > 2:1786831/1‑97 (MQ=255) tGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCg > 2:906769/1‑97 (MQ=255) tataGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGAtt < 2:1336148/97‑1 (MQ=255) tataGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGAtt < 2:1417477/97‑1 (MQ=255) tataGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGAtt < 1:2089697/97‑1 (MQ=255) tataGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGAtt < 2:149451/97‑1 (MQ=255) tataGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGAtt < 1:1878511/97‑1 (MQ=255) taGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGCCATTAGCGATTta > 2:1651308/1‑97 (MQ=255) aGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTtat > 2:218524/1‑97 (MQ=255) aGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTtat < 1:1416132/97‑1 (MQ=255) gCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCGATGTTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGGTAGGGTCTTTATTTGTGTCGTTAGGGGTTtata > 2:1224999/1‑97 (MQ=255) gCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTtata > 2:1196536/1‑97 (MQ=255) cTGTATCCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTatat < 1:1908521/97‑1 (MQ=255) tGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATAtt > 2:576210/1‑97 (MQ=255) gTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTa < 1:1518085/97‑1 (MQ=255) tAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCCAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTAc > 2:2095253/1‑97 (MQ=255) aaCCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACg > 2:1525037/1‑97 (MQ=255) cATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCCAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTg > 2:1709308/1‑97 (MQ=255) aTGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGc < 1:3273/97‑1 (MQ=255) tGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCt < 2:1813679/97‑1 (MQ=255) tGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCt < 1:35645/97‑1 (MQ=255) tGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCt > 2:1645175/1‑97 (MQ=255) tAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTAtt > 2:2077149/1‑97 (MQ=255) gCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAg < 2:1124035/97‑1 (MQ=255) gCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTta > 1:478910/1‑97 (MQ=255) gCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTta > 1:256180/1‑97 (MQ=255) cAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTtaa > 2:539348/1‑97 (MQ=255) gcgcAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTtaataa > 1:1067935/1‑97 (MQ=255) cgcAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATaaa > 2:285647/1‑97 (MQ=255) cgcAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATaaa < 1:1196203/97‑1 (MQ=255) cgcAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATaaa < 1:1838393/97‑1 (MQ=255) cgcAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATaaa > 1:864818/1‑97 (MQ=255) cgcAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATaaa > 2:1528515/1‑97 (MQ=255) gcAACATTGGAAGAAAGTTATAACAGCCCTGCATGGCTACGTGGATTAAGTATGACATAAGCGACTTATGTTATGTTGATATTAGAGTTtaataaga > 2:863304/1‑95 (MQ=255) aCATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAg > 2:2235535/1‑97 (MQ=255) aCATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAg > 2:2235890/1‑97 (MQ=255) cATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGt > 2:1343758/1‑97 (MQ=255) cATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGt > 2:1436184/1‑97 (MQ=255) aTTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTa < 1:1561954/97‑1 (MQ=255) aTTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTa > 2:375002/1‑97 (MQ=255) tttGCAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATACTACGTCGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTAc > 2:807374/1‑97 (MQ=255) ttGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACg > 1:430519/1‑97 (MQ=255) ttGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACg > 2:282461/1‑97 (MQ=255) tGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGt > 2:1245922/1‑97 (MQ=255) gaagaaAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTg < 1:1917656/97‑1 (MQ=255) agaaAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCa > 1:989097/1‑97 (MQ=255) taaaGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTGTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCAc < 1:1018512/96‑1 (MQ=255) gagaGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCAc < 1:1018329/94‑1 (MQ=255) gaaAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCAc < 1:1980960/97‑1 (MQ=255) aaaGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACt > 2:2009037/1‑97 (MQ=255) aaGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTa > 2:335135/1‑97 (MQ=255) aaGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTa > 1:2035869/1‑97 (MQ=255) aGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAg < 2:1741568/97‑1 (MQ=255) gTTATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAgg < 2:1600690/97‑1 (MQ=255) ttATAACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGt < 2:1723430/97‑1 (MQ=255) ataACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTAt > 2:1559759/1‑97 (MQ=255) ataACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTAt < 2:1848477/97‑1 (MQ=255) ataACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTAt > 2:791364/1‑97 (MQ=255) ataACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTAt < 1:2162194/97‑1 (MQ=255) taACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATc < 2:1039575/97‑1 (MQ=255) taACATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATc > 1:2167753/1‑97 (MQ=255) taACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATc < 1:855885/97‑1 (MQ=255) aaCATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCg < 2:490220/97‑1 (MQ=255) aaCATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCg > 1:1770158/1‑97 (MQ=255) aaCATACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCg > 1:1770190/1‑97 (MQ=255) tACCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTac > 2:912600/1‑97 (MQ=255) aCCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTaca > 1:1553231/1‑97 (MQ=255) aCCTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTaca > 1:1187390/1‑97 (MQ=255) ccTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTacac > 2:2169988/1‑97 (MQ=255) cTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACAcc < 2:437944/97‑1 (MQ=255) cTACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACAcc < 2:644783/97‑1 (MQ=255) tACATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCa < 2:289791/97‑1 (MQ=255) aCATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCAt > 1:2005731/1‑97 (MQ=255) aCATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCAt < 1:713048/97‑1 (MQ=255) cATGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCAtt > 1:488606/1‑97 (MQ=255) aTGGCTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCAttt > 1:2205777/1‑97 (MQ=255) cTAGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCATTTTTaa > 1:1691844/1‑97 (MQ=255) aGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCATTTTTAAtt > 1:1599589/1‑97 (MQ=255) aGGTTCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCATTTTTAAtt < 2:186158/97‑1 (MQ=255) | TTTTAATCTTCTTCTTATTTGGTATAGCTGTAACCATGATAGCTGGTGCAGGCGCAACATTTGAAGAAAGTTATAACATACCTACATGGCTAGGTGCTTTAATTATGACATTAGCGATTTATATTACGTTGCTATTAGACTTTAATAAAATAGTACGTGCACTAGGTATCGTTACACCATTTTTAATT > BX571857/697578‑697765 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |