| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 2,485,521 | C→T | 21.8% | T209I (ACC→ATC) | SAS2324 → | putative glycerate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 2,485,521 | 0 | C | T | 21.8% | 558.5 / 175.7 | 230 | T209I (ACC→ATC) | SAS2324 | putative glycerate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (91/89); new base T (21/29); total (112/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.22e-01 | |||||||||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
AATCGATATAACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAATGTGCAC > BX571857/2485426‑2485617 | aaTCGATATAACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTAcc > 1:1020043/1‑97 (MQ=255) aTCGATATAACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCt > 2:58405/1‑97 (MQ=255) tCGATATAACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCta < 2:1810324/97‑1 (MQ=255) cGATATAACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGctatctat > 1:1494161/1‑97 (MQ=255) tataACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATAtt > 1:168033/1‑97 (MQ=255) tataACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATAtt > 1:629192/1‑97 (MQ=255) ataACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATAttt > 1:2220837/1‑97 (MQ=255) ataACCAAGCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATAttt < 1:580379/97‑1 (MQ=255) taACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTa > 1:1837228/1‑97 (MQ=255) aCCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATg < 1:479313/97‑1 (MQ=255) aCCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATg > 1:311599/1‑97 (MQ=255) ccAATCTAGATTCGCGATTAAAGGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCGAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATgg < 1:1511250/97‑1 (MQ=255) cAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGt > 1:1429304/1‑97 (MQ=255) cAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGt < 1:551486/97‑1 (MQ=255) aaTCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTc > 2:1611262/1‑97 (MQ=255) aaTCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTc > 2:1420756/1‑97 (MQ=255) cTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATGTTTATGGTCCTc > 2:1308983/1‑97 (MQ=255) cTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTc < 2:43935/97‑1 (MQ=255) tAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCa > 2:275585/1‑97 (MQ=255) tAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTGATGGTCCTCa > 2:2216564/1‑97 (MQ=255) gagtCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCaaa < 2:1163186/94‑1 (MQ=255) gATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCaaa > 2:1228645/1‑97 (MQ=255) gATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCaaa > 2:1871393/1‑97 (MQ=255) ttCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCaaaaa < 1:2123225/97‑1 (MQ=255) ttCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCaaaaa < 2:2049061/97‑1 (MQ=255) cgcgATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAgg > 2:1084424/1‑97 (MQ=255) cgcgATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAgg > 1:2073946/1‑97 (MQ=255) cgcgATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAgg > 2:1426492/1‑97 (MQ=255) cgcgATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAgg < 1:2249224/97‑1 (MQ=255) cgcgATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAgg > 2:1187461/1‑97 (MQ=255) ttAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTg > 1:684940/1‑97 (MQ=255) ttAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTg > 1:66196/1‑97 (MQ=255) tAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTTTGATGTTTCAAATCCTTTATTGTGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGa < 1:1135074/97‑1 (MQ=255) aaaaGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGAt > 1:1098725/1‑97 (MQ=255) aaaGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCGTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATg < 2:1023336/97‑1 (MQ=255) gagGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCaa > 1:1217162/1‑97 (MQ=255) gTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAga > 2:1246633/1‑97 (MQ=255) gTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTAGTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAga < 2:824884/97‑1 (MQ=255) tGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAgat < 1:1577632/97‑1 (MQ=255) tGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAgat < 2:565541/97‑1 (MQ=255) gACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAgatg < 1:835897/97‑1 (MQ=255) ccTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAgatgat < 1:30053/97‑1 (MQ=255) cTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATa > 1:1062826/1‑97 (MQ=255) tAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCa > 2:2139592/1‑97 (MQ=255) tAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCa > 2:2221392/1‑97 (MQ=255) aaaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaa > 1:447665/1‑97 (MQ=255) aaaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaa > 2:1645230/1‑97 (MQ=255) aaaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaa < 1:1107253/97‑1 (MQ=255) aaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaaa > 2:1471645/1‑97 (MQ=255) aaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaaa < 2:345183/97‑1 (MQ=255) aaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaaa < 1:1328418/97‑1 (MQ=255) aaGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCaaa < 1:2044053/97‑1 (MQ=255) tGGCCCGTGATGTTTCACATCCTGTATTGGGCGAACATGGTGCCCTCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAACGATGATACCAAGGtt > 2:2003708/1‑97 (MQ=255) ggCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTg < 1:822591/97‑1 (MQ=255) ggCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTg > 1:292364/1‑97 (MQ=255) gCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTgg < 2:1650299/97‑1 (MQ=255) ccTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGa < 1:173307/97‑1 (MQ=255) ccTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGa < 1:1141883/97‑1 (MQ=255) cTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGAt < 2:2170004/97‑1 (MQ=255) aTGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGc < 2:453985/97‑1 (MQ=255) aTGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGc < 1:1425178/97‑1 (MQ=255) tGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCa < 1:877794/97‑1 (MQ=255) gTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCaa > 2:1081965/1‑97 (MQ=255) gTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCaa < 1:184472/97‑1 (MQ=255) tttCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAAt < 2:88869/97‑1 (MQ=255) ttCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATg > 1:393626/1‑97 (MQ=255) ttCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATg < 1:1120738/97‑1 (MQ=255) tCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGt > 1:1635111/1‑97 (MQ=255) cAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTc < 1:1002831/97‑1 (MQ=255) aaaTCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCg < 1:400765/97‑1 (MQ=255) aaaTCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCg < 1:1920160/97‑1 (MQ=255) aaTCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGc < 1:136951/97‑1 (MQ=255) aaTCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGc < 2:1858742/97‑1 (MQ=255) ccTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCAtt < 2:2230254/97‑1 (MQ=255) ccTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCAtt > 1:1165003/1‑97 (MQ=255) ccTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCAtt > 2:478217/1‑97 (MQ=255) tttATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTAt < 2:1777181/97‑1 (MQ=255) tttATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTAt < 1:1235245/97‑1 (MQ=255) tttATTGGGTGAAAATGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTAt > 2:1681134/1‑97 (MQ=255) ttATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATc > 2:953290/1‑97 (MQ=255) aTTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCAt < 2:1100732/97‑1 (MQ=255) ttGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATg > 2:2112105/1‑97 (MQ=255) tGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATga > 2:314307/1‑97 (MQ=255) ggTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgata < 1:1296937/97‑1 (MQ=255) gTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgataa > 1:1440788/1‑97 (MQ=255) tGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgataag < 2:1737012/97‑1 (MQ=255) tGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgataag > 1:2264083/1‑97 (MQ=255) tGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgataag > 2:1294383/1‑97 (MQ=255) aaaaTGGTGCTACCTATATTCATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGAGGCAGAGCTGATACCAACGTCGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgagaagat > 2:629632/1‑97 (MQ=255) aaaTGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTCATGCAAAGATGATGCCCAGGGTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATggtaagata < 2:789768/97‑1 (MQ=255) aaaTGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgataagata < 1:1628104/97‑1 (MQ=255) aaTGGTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATgatacgataa > 2:106084/1‑97 (MQ=255) ggTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATaaaaa > 1:94874/1‑97 (MQ=255) ggTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATaaaaa < 1:1026273/97‑1 (MQ=255) gTGCTATCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAAt < 1:421094/97‑1 (MQ=255) gcgaCCTATATGTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAAtgt > 2:649511/4‑97 (MQ=255) gCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAAtgt > 1:704914/1‑97 (MQ=255) cTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAAtgtg > 2:196183/1‑97 (MQ=255) cTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAAtgtg > 1:1727057/1‑97 (MQ=255) ccTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAATGTGcac > 1:1994060/1‑97 (MQ=255) | AATCGATATAACCAATCTAGATTCGCGATTAAAAGAGGTGACCTTTAAAGTGGCCTGTGATGTTTCAAATCCTTTATTGGGTGAAAATGGTGCTACCTATATTTATGGTCCTCAAAAAGGCGCTGATGCAAAGATGATACCAAAGTTGGATTTCGCAATGTCGCATTATCATGATAAGATAAAAATGTGCAC > BX571857/2485426‑2485617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |