| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | BX571857 | 2,200,113 | G→A | 39.7% | S53S (AGC→AGT) | SAS2045 ← | putative membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BX571857 | 2,200,113 | 0 | G | A | 39.7% | 195.7 / inf | 224 | S53S (AGC→AGT) | SAS2045 | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (67/68); new base A (49/40); total (116/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
TTATTCAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGTATATGT > BX571857/2200018‑2200209 | ttATTCAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGgcgc > 1:2386617/1‑97 (MQ=255) tATTCAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCt > 2:3448693/1‑97 (MQ=255) tATTCAAACGCGCTATCGACAATTAATTGGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCt < 2:1059085/97‑1 (MQ=255) ttCAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGa < 2:3482581/97‑1 (MQ=255) cAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGAtt > 2:2573660/1‑97 (MQ=255) cAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGAtt < 1:1803760/97‑1 (MQ=255) cAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGAtt > 2:2448457/1‑97 (MQ=255) cAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGAtt < 2:1115669/97‑1 (MQ=255) aaaCGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGAttt < 1:2512044/97‑1 (MQ=255) cgcTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTg < 1:3329935/97‑1 (MQ=255) cgcTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTg < 2:188004/97‑1 (MQ=255) cgcTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTg < 2:2722534/97‑1 (MQ=255) cgcTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTg < 1:981392/97‑1 (MQ=255) cgcTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTg < 2:1895140/97‑1 (MQ=255) cgcTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTg < 1:1883981/97‑1 (MQ=255) aTCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCtt > 2:448510/1‑97 (MQ=255) tCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCttt > 2:3264868/1‑97 (MQ=255) tCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCttt > 1:57672/1‑97 (MQ=255) tCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCAGAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCttt < 2:210583/97‑1 (MQ=255) gACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTaa < 1:25357/97‑1 (MQ=255) gACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTaa < 1:3048075/97‑1 (MQ=255) cAATTACTTTGAAGCTACCAAGGTACCGCATAATGGCAGCACACTAATCAACAATGCGCTACACTTTACTGAGGCGCCGATTTGCTTGTCTTTaaaa > 2:1152351/1‑97 (MQ=255) cAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTaaaa > 2:1316444/1‑97 (MQ=255) cAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTaaaa < 1:325732/97‑1 (MQ=255) aattaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAg > 1:2284720/1‑97 (MQ=255) aattaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAg > 1:2599314/1‑97 (MQ=255) attaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGt > 1:1848565/1‑97 (MQ=255) attaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGt > 1:135757/1‑97 (MQ=255) ttaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTc < 2:738690/97‑1 (MQ=255) ttaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTc < 1:1383058/97‑1 (MQ=255) ttaattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATGAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTc < 2:22033/97‑1 (MQ=255) aattTGAAGCTACCAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCaa < 1:2425552/97‑1 (MQ=255) aattTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCaa < 2:1760963/97‑1 (MQ=255) attTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAAc < 2:1907623/97‑1 (MQ=255) tttGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACa < 2:2525601/97‑1 (MQ=255) tttGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACa > 2:2636298/1‑97 (MQ=255) ttGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACAt > 2:2185229/1‑97 (MQ=255) cTACAAAGGTCCCGCATAGTGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACt < 2:2923614/97‑1 (MQ=255) cTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACt > 1:2260989/1‑97 (MQ=255) cTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACt < 2:500325/97‑1 (MQ=255) aaaGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATa > 1:458744/1‑97 (MQ=255) aaaGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATa < 1:220656/97‑1 (MQ=255) aaGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATaa < 1:1001244/97‑1 (MQ=255) aaGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATaa > 2:2659494/1‑97 (MQ=255) ggTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAAtt < 1:515519/97‑1 (MQ=255) ggTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAAtt > 2:1582669/1‑97 (MQ=255) ggTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAAtt > 2:319626/1‑97 (MQ=255) aCCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCt > 2:2221367/1‑97 (MQ=255) cATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTaaaa < 1:355372/97‑1 (MQ=255) aTAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAAt > 2:383991/1‑97 (MQ=255) tAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATa < 1:3676092/97‑1 (MQ=255) aaTGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAg > 1:823163/1‑97 (MQ=255) aTGGCAGCACATTAATTAGCACTGCGCTAATCTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGCCAACATATCACTAATAATCCCGAAAATAGc > 2:2321272/1‑97 (MQ=255) aTGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGc < 1:1936196/97‑1 (MQ=255) aTGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGc > 1:609911/1‑97 (MQ=255) tGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGct < 2:2621495/97‑1 (MQ=255) tGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGct < 1:1039453/97‑1 (MQ=255) ggCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGcta > 2:1532808/1‑97 (MQ=255) ggCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGcta < 1:2360487/97‑1 (MQ=255) ggCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGcta > 1:2327362/1‑97 (MQ=255) gcagcaCATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGctac > 2:1411665/1‑97 (MQ=255) agcaCATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGctacta < 1:133720/97‑1 (MQ=255) caTTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACg > 2:3321219/1‑97 (MQ=255) attaattaACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGt > 2:217948/1‑97 (MQ=255) attaattaACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGt > 2:3376614/1‑97 (MQ=255) ttaattaaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTg > 2:1602826/1‑97 (MQ=255) taattaaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTgg > 2:2467330/1‑97 (MQ=255) aattaaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGa < 1:1491733/97‑1 (MQ=255) ttaaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAAt < 1:1102609/97‑1 (MQ=255) taaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAAtt > 1:1691185/1‑97 (MQ=255) aaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTg > 1:2078904/1‑97 (MQ=255) aaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTg < 2:3072857/97‑1 (MQ=255) aaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTg < 1:3209387/97‑1 (MQ=255) aaCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTg > 1:903902/1‑97 (MQ=255) aCAATGCGCTAACCTTGAAGGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCGACTATACGTGGAATTGt < 2:2877684/97‑1 (MQ=255) aCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGt < 2:1355429/97‑1 (MQ=255) aCAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGt < 2:2490146/97‑1 (MQ=255) cAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTc > 2:1261744/1‑97 (MQ=255) aaTGCGCTAAACTTTAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCa < 2:210079/97‑1 (MQ=255) aTGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCAt < 1:1510761/97‑1 (MQ=255) tGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATg < 1:3666354/97‑1 (MQ=255) gcgcTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGc > 1:1906018/1‑97 (MQ=255) cgcTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCt < 2:1785714/97‑1 (MQ=255) cgcTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCt > 1:2021850/1‑97 (MQ=255) cgcTAAACTTTAATGAGGCACTGACTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCt > 2:2257189/1‑97 (MQ=255) aCTTTAATGAGGCAATGATTTGCTCGACTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAAATACTATACGTGGAATTTTCATGCTCGGATa > 2:2749978/1‑97 (MQ=255) cTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATAc < 1:2804477/97‑1 (MQ=255) ttAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTg > 2:372754/1‑97 (MQ=255) ttAATGAGGCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTg > 2:1175907/1‑97 (MQ=255) tAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGc > 1:2790222/1‑97 (MQ=255) aaTGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCg > 1:631584/1‑97 (MQ=255) aTGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCgg < 1:3447869/97‑1 (MQ=255) gAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAGAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGta < 2:711298/97‑1 (MQ=255) gAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGta > 1:106779/1‑97 (MQ=255) aGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGtat < 1:2854805/97‑1 (MQ=255) ggCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGtata < 1:2838933/97‑1 (MQ=255) ggCACTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGtata < 1:486760/97‑1 (MQ=255) cgcTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGTATATg > 2:2010520/1‑97 (MQ=255) gcTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGTATATGt > 1:1733469/1‑97 (MQ=255) gcTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGTATATGt < 1:3087707/97‑1 (MQ=255) | TTATTCAAACGCGCTATCGACAATTAATTTGAAGCTACAAAGGTACCGCATAATGGCAGCACATTAATTAACAATGCGCTAAACTTTAATGAGGCGCTGATTTGCTTGTCTTTAAAAGTCAACATAGCACTGATAATTCCTAAAATAGCTACTATACGTGGAATTGTCATGCTCGGATACTGCGGTATATGT > BX571857/2200018‑2200209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |